第七章
1,遗传型(genotype):又称基因型,指某一生物个体所含有的全部遗传因子及基因组所携
带的遗传信息。
2,表型(phenotype):指某一生物体所具有的一切外表特征和内在特征的总和,是其遗传型
再合适环境条件下通过代谢和发育而得到的具体体现,所以它与遗传型不同是一种现实性,
具体性状
3,变异(variation):指生物体在某种外因或内因的作用下所引起的遗传物质结构或数量的
改变,亦称遗传型的改变,其特点是在群体中只以极低的概率一般为10-5到10-10出现,
性状变化幅度大且变化后的新性状是稳定的可遗传的。
4,饰交(modification); 是指外表的修饰性改变,一种不涉及遗传物质结构改变而只发生在
转录、翻译水平上的表情变化,其特点是整个群体中的几乎每一个体都发生同样变化,形状
变化的幅度,因其遗传物质未变,故饰变是不遗传的,例如黏质沙雷氏菌在25℃下培养时
会产生深红色的灵杆菌素,把菌落染成鲜血状,可是当培养在37℃下时,此菌群体中的一
切个体都不产色素。
5.核基因组:不论真核生物的细胞和或原核生物细胞的核区都是该微生物遗传信息的最主要
负荷者,被称为核基因组和染色体组,或简称基因组。
6,卡巴颗粒:是草履虫放毒者品系中的,是一类属于杀手杆菌属的共生细菌。
7. 2um质粒:又称2μm环状体,存在于酿酒酵母的细胞核中,但不与核基因组整合,长
6300bp,每个酵母细胞核中约含30个2μm质粒。
8,单倍体(heploid):如果一个细胞中只有一套染色体就称单倍体。在自然界中存在的微生
物多数都是单倍体,而高等动植物只有其生殖细胞才是单倍体。
9.二倍体(diploid):一个细胞中含有两套功能相同的染色体。只有少数微生物如酿酒酵母
的营养细胞以及由两个单倍体性细胞通过结合形成的合子等少数细胞才是双倍体,而高等动
植物的体细胞都是双倍体。在原核生物中通过转化转导或结合等过程而获得外源染色体片段
时,只能形成一种不稳定的称作部分双倍体的细胞。
10.碱基对(bp):描述基因组大小的单位。
11.基因:是生物体内遗传信息的基本单位,通常指位于染色体上的一段以直线排列的核苷
酸序列,它具有编码一特定功能的多肽,蛋白质或RNA的功能。一个基因的平均大小为1000
到1500bp。
12,操纵子(operon):原核生物的基因调控系统是由一个操纵子和它的调节基因所组成的每
一个操纵子又包括三种功能上密切相关的基因一结构基因二操纵基因三启动基因
12.1结构基因(structure gene)是决定某一多肽链一级结构的DNA模板,它是通过转录
和翻译过程来执行多肽链合成任务的。
12.2操纵基因:是位于启动基因和结构基因之间的一段核苷酸序列。它与结构基因紧密连
锁在一起,能通过与阻遏物及阻遏蛋白的结合与否控制结构基因是否转录。
12.3 启动基因:是一种依赖于DNA的RNA聚合酶所识别的核苷酸序列,它既是DNA聚合
酶的结合部位,又是转录的起始位点。
13.遗传密码 (genetic code)是指DNA链上决定个具体氨基酸的特定核苷酸序列。遗传
密码的信息单位是密码子。
14,密码子(codon) :遗传密码的信息单位。每一密码子有三个核苷酸序列即一个三联体
所组成,密码子一般都用mRNA上的三个连续核苷酸序列来表示。
15.质粒 (plasmid):凡游离于原核生物和精英组以外,具有独立复制能力的小型共价闭合
环状的ds DNA分子,即cccDNA就是典型的质粒。具有超螺旋结构,大小一般为1.5到
300kb,相对分子质量为十的六次方到十的八次方。是一种独立存在于细胞内的复制子。
16,严紧型复制控制(stringent replication control):质粒是一种独立存在于细胞内的复制
子,如果其复制行为与核染色体的复制同步称为严紧张型复制控制。在这类细胞中,一般只
含1-3个质粒
17,松弛型复制控制 (relaxed replication control):质粒的复制与核染色体的复制不同步。
这类细胞中可含十到15个甚至更多的质粒。
18,质粒消除(curing):含质粒的细胞在正常的培养基上受吖啶类染料、丝裂霉素c,紫外
线,利福平,重金属离子或高温等因子处理时,由于其复制受抑而核染色体的复制仍继续进
行,从而引起子代细胞中不带质粒,此即质粒消除。
19,附加体 (episome)某些质粒具有与核染色体发生整合与脱离的功能,如F因子这类质
粒又称附加体。
20,整合:指质粒等小型非染色体DNA插入核基因组等大型DNA的现象
21. pBR322质粒:大肠杆菌的该质粒是一个常用的克隆载体。具体优点是,一,体积小仅
4361bp。二在宿主大肠杆菌中稳定的维持高拷贝数, 20到30个/细胞。三若用氯霉素抑制
其宿主的蛋白质合成,则每个细胞可扩增到含1000到3000个质粒,约占核基因组的40%。
四,分离及其容易五可插入较多的外源DNA不超过十kb,六结构完全清楚,各种核酸内切
酶可酶切的位点可任意选用。⑦有两个选择性抗性标记氨苄青霉素和四环素8可方便地通
过转化作用导入受体细胞。
22. F质粒 :又称F因子或致育因子或性因子,是大肠杆菌等细菌决定性别并有转移能力的
质粒,大小仅100kb为CCC DNA,含有与质粒复制和转移相关的许多基因。其中有近三分
之一是tra区(转移区,与质粒转移和性菌毛合成有关,含28个基因。),另有oriT(转移起
始点。)oriS(复制起始点)。Inc(不相容群)rep(复制功能)phi(噬菌体抑制)和一些转座
因子,后者可整合到宿主核染色体上的一定部位,并导致各种Hfr菌株的产生。
23. R质粒:又称R因子或抗性因子。R质粒的种类很多,如R4 R100(可在肠道细菌间转移
的抗药性质粒),RP4 ,R6. 一般是由两个相连的 DNA片段组成,其一称抗性转移因子RTF, 它
主要含调节DNA复制和拷贝数的基因以及转移基因。具有转移功能,其二为抗性决定子,
又称r决定子,大小不很固定。无转移功能,其上含各种抗性基因,如抗青霉素,氨苄青霉
素,氯霉素,链霉素,卡那霉素等。
24. Col质粒:又称大肠杆菌素质粒或产大肠杆菌素因子。
25.细菌素:许多细菌都能产生抑制或杀死其他近缘细菌或同种不同菌株的代谢产物,因为
他是由质粒编码的蛋白质,且不像抗生素那样具有很广的杀菌谱,所以称为细菌素。细菌素
种类很多。如大肠杆菌素,枯草杆菌素等。
26,大肠杆菌素:是一类由大肠杆菌某些菌株所产生的细菌素,具有通过抑制复制,转录翻
译或能量代谢等方式而专一的杀死其他种肠道菌或同种其他菌株的能力。大肠杆菌素是由
COL质粒编码。
27, Ti质粒 :即诱癌质粒和冠瘿质粒。根癌土壤杆菌或根癌农杆菌从一些双子叶植物的受
伤根部侵入根部细胞后,最后在其中溶解释放出Ti质粒,其上的DNA片段会与植物细胞的
核基因组整合,合成正常菌株所没有的冠瘿碱类,破坏控制细胞分裂的激素调节系统,从而
使他转为癌细胞。Ti质粒是一种200kb的环状质粒,包括毒性区vir,结合转移区con,复
制起始区ori和T-DNA区四部分。
28, Ri质粒 :是外源基因的良好载体,也可用作进行次生代谢物的生产。发根土壤杆菌或
发根农杆菌可侵染双子叶植物的根部,并诱生大量称为毛状跟的不定根,该菌侵入植物细胞
后,会将大型Ri质粒(250kb)中的一段。T-DNA整合到宿主根部细胞的核基因组中。使之
发生转化。由Ri质粒转化的根部不形成瘤,仅生出可再生新植株的毛状根。若把毛状根做
离体培养,还能合成次生代谢物。
29, mega质粒 :即巨大质粒,存在于根瘤菌属中,其上有一系列与共生固氮相关的基因,
因其相对分子质量比一般质粒大几十倍至几百倍,故名。
30,降解性质粒 :只在假单胞菌属中发现这类质粒,可为降解一系列复杂有机物的酶编码,
从而使这类细菌在污水处理环境保护等方面发挥特有的作用。如樟脑质粒,二甲苯质粒,水
杨酸质粒。
31,基因突变(gene mutation):简称突变是变异的一类,泛指细胞内遗传物质的分子结构
或数量突然发生的可遗传的变化,可自发或诱导产生。狭隘的突变,专指基因突变(点突变) ,
而广义的突变则包括基因突变和染色体畸变。突变的概率一般很低。
31.1野生型菌株:从自然界中分离到的菌株。
32,选择性突变株(lectable mutant):凡能从选择性培养基或其他选择性培养条件快速选
择出来的突变株。包括营养缺陷型,抗性突变型,条件致死突变型。
33,非选择性突变株 :包括形态突变型,抗原突变型,产量突变型。
34,营养缺陷型 (auxotroph):某一野生型菌株因发生基因突变而丧失合成一种或几种生长
因子,碱基或氨基酸等能力,因而不能再在基本培养基(minimum MM)上正常生长繁殖的
变异类型称为营养缺陷型。
35,抗性突变型(Resistant Mutant):指野生型菌株因发生基因突变而产生的对某化学药
物,致死物理因子或噬菌体的抗性变异型。例如对一些抗生素具抗药性的菌株等。他们可在
家有相应药物,用相应物理因子处理的或含噬菌体的培养基平板上选出。
36.条件致死突变型(Conditional lethal mutant):某菌株或病毒经基因突变后,在某种条
件下可正常的生长繁殖,并呈现其固有的表型,而在另一种条件下却无法生长繁殖,这种突
变类型称为条件致死突变型。温度敏感突变株是一类典型的条件致死突变株。
37, Ts突变株: 即温度敏感突变株。是一种典型的条件致死突变株。例如大肠杆菌的某些菌
株可在三十七摄氏度下正常生长却不能在四十二摄氏度下生长引起突变的原因是突变时某
些重要蛋白质的结构和功能发生改变,以致会在某特定温度下具有功能,而在另一温度下则
无功能。
38,形态突变型 (morphological mutant):由突变引起的个体或菌落形态的变异,一般属
非选择性突变,例如细菌的鞭毛或荚膜的有无,霉菌或放线菌的孢子有无或颜色变化,菌落
表面的光滑,粗糙以及噬菌斑大小等的突变。
39,抗性突变型 (antigentic mutant): 指由于基因突变引起的细胞抗原结构发生的变异类
型包括细胞壁缺陷变异(L型细菌),细菌的荚膜或鞭毛成分变异等,一般也属非选择性突
变。
40,产量突变型 (metabolite quantitative mutant):通过基因突变而产生的在代谢产物产
量上明显有别于原始菌株的突变株。称产量突变型。
41,正变株:产量显著高于原始菌株
42,负变株:反之
43,突变率:某一细胞或病毒体在每一世代中发生某一性状突变的几率。例如突变率为十的
负八次方者,即表示该细胞在一亿次分裂过程中会发生一次突变。
44,正向突变 由原始的野生型基因变异为突变型基因的过程称为正向突变。
45,回复突变 突变体(mutant)经过第二次突变又完全地或部分地恢复为原来的基因型和表现
型
46,变量试验 :又称波动试验或彷徨试验。P201
47,涂布试验 :P201
48,影印平板试验:是一种通过在固体培养基表面盖印章的接种方式,达到在一系列培养皿平
板的相同位置出现相同遗传型菌落的接种和培养方法。
49.艾姆斯试验:是一种利用细菌营养缺陷型的回复突变来检测环境或食品中是否存在化学
致癌剂的简便有效方法。原理:鼠伤寒沙门氏菌的组氨酸营养缺陷型(his-)菌株在基本培
养基「-」的平板上不能生长,如发生回复突变变成原养型(his+)则能生长。
50基本培养基(minimal medium MM):仅能满足某微生物的野生型菌株生长所需要的最
低成分的组合培养基。
51完全培养基(complete medium CM):凡可满足某微生物一切营养缺陷型菌株营养需要
的天然或半组合培养基。
52补充培养基(supplemental medium SM):凡只能满足相应的营养缺陷型突变株生长所
需要的组合或半组合培养基。
53.野生型:指从自然界分离到的任何微生物在其发生人为营养缺陷型突变前的原始菌株。
54.原养型 (prototroph):一般指营养缺陷型突变株经回复突变或重组后产生的菌株,其
营养要求在表型上与野生型相同。
55.基因重组(gene recombination):两个独立基因组内的遗传基因,通过一定的途径转移
到一起,形成新的稳定基因组的过程。
56转化(transformation):受体菌直接吸收供体菌的DNA片段而获得后者部分遗传性状
的现象。
57转化子:通过转化方式而形成的杂种后代。
58转化因子(transforming factor):本质是离体的DNA片段。一般原核生物的核基因组
是一条环状DNA长链,不管在自然条件或者人为条件下都极易断裂成碎片,故转化因子通
常都是15kb左右的片段。
59感受态(competence):是指受体细胞最易接受外源DNA片段并能实现转化的一种生理
状态。调节感受态的一类特异性蛋白称感受态因子,包括三种主要成分:膜相关DNA结合
蛋白,细胞壁自溶素和几种核酸酶。
60.转染(transfection):指用提纯的病毒核酸(DNA或RNA)去感染其宿主细胞或其原生
质体,可增殖出一群正常病毒后代的现象。与转化的区别:作为转染的病毒核酸绝不是作为
供体基因的功能,被感染的宿主也绝不是能形成转化子的受体菌。
61转导(transduction):通过缺陷噬菌体(detective phage)的媒介,把供体细胞中的小
片段DNA携带到受体细胞中,通过交换与整合,使后者获得前者部分遗传性状的现象。主
要有普遍转导,局限转导和溶原转变。
62转导子:由转导作用而获得部分新性状的重组细胞。
99.普遍转导:通过极少数完全缺陷噬菌体对供体菌基因组上的任何小片段DNA进行“误包”,
而将其遗传性状传递给受体菌的现象。一般用温和噬菌体作为普遍转导的媒介。可分为完全
普遍转导和流产普遍转导。
100流产转导 (abortive transduction):经转导噬菌体的媒介而获得了供体菌DNA片段
的受体菌,如果这段外源DNA在其内既不进行交换,整合和复制,也不迅速消失,而仅表
现稳定的转录翻译和表达,这一现象叫
101局限转导 (specialized transduction):指通过部分缺陷的温和噬菌体把供体菌的少数
特定基因携带到受体菌中,并与后者的基因组整合,重组,形成局限转导子的现象。可分为
低频转导和高频转导。
102,低频转导 (LFT)指通过一般溶源菌释放的噬菌体进行的转导,因其只能形成极少数
(10-4-10-6-)转导子,故称为
103.低频转导裂解物
104高频转导 (HFT):在局限转导中,若对双重溶源菌进行诱导,就会产生含50%左右的
局限转导噬菌体的高频转导裂解物,用这种裂解物去转导受体菌,就会获得高达50%左右的
转导子,故称
105溶源转变(lysogenic conversion):当正常的温和噬菌体感染其宿主而使其发生溶源化
时,因噬菌体基因整合到宿主的核基因组上,而使宿主获得了除免疫性以外的新遗传性状的
现象。典型例子:白喉棒杆菌不产白喉毒素的菌株,在被β温和噬菌体感染而发生溶源化时,
就会变成产毒的致病菌株。
106接合(conjugation):供体菌(“雄性”)通过性菌毛与受体菌(“雌性”)直接接触,把
F质粒或其携带的不同长度的核基因组片段传递给后者,是后者获得若干新遗传性状的现象。
107接合子:通过结合而获得新遗传性状的受体细胞。
108. F+菌株:雄性菌株,指细胞内存在一个至几个F质粒,并在细胞表面着生一至几条性
菌毛的菌株。
109. F-菌株:雌性菌株,指与F+对应的,细胞中无F质粒,细胞表面也无性菌毛的菌株。
它可通过与F+菌株或F'菌株的接合而接受供体菌的F质粒或F'质粒,从而使自己转变成雄
性菌株;也可通过接合接受来自Hfr菌株的一部分或一整套核基因组DNA。
110. Hfr菌株(高频重组菌株):在该菌株细胞中,因F质粒已从游离态转变成在核染色体
特定位点上的整合态,故Hfr菌株和F-菌株相接合后,发生基因重组的频率比单纯用F+与
F-接合后的频率高处百倍,故名。
111F'菌株 :当Hfr菌株细胞内的F质粒因不正常切离而脱离核染色体时,可重新形成游离
的,但携带整合位点邻近一小段核染色体基因的特殊F质粒,称为F'质粒或F'因子。凡携带
F'质粒的菌株称为初生F'菌株,其遗传性状介于F+和Hfr菌株之间;通过F'菌株与F-菌株
的接合,可使后者也成为F'菌株,这就是次生F'菌株。
112,接合中断法
113. F因子转导(性导)
114.原生质体融合 (protoplast fusion):通过人为的方法,使遗传性状不同的两个细胞的
原生质体进行融合,借以获得兼有双亲遗传性状的稳定重组子的过程。由此方法获得的重组
子,称为融合子。
115有性杂交(xual hybridization)一般指不同遗传型的两性细胞间发生的接合和随之进
行的染色体重组。
116准性生殖(paraxual reproduction):是一种类似于有性生殖,但比它更为原始的两
性生殖方式,这是一种在同种而不同菌株的体细胞间发生的融合,它可不借减数分裂而导致
低频率基因重组并产生重组子。在某些真菌类尤其在还未发现有性生殖的半知菌类和构巢曲
霉中最为常见。
117,基因工程 :又称遗传工程,是指人们利用分子生物学的理论和技术,自觉设计操纵改
造和重建细胞的遗传核心--基因组,从而使生物体的遗传性状发生定向变异,以最大限度地
满足人类活动的需要。这是一种自觉的可人为操纵的体外DNA重组技术,是一种可达到超
远缘杂交的育种技术,更是一种前景宽广,正在迅速发展的定向育种新技术。
118重组载体:目的基因与载体DNA进行共价结合形成的一个完整的有复制能力的环状重
组载体或称嵌合体。
119,衰退 (degeneration):是指某纯种微生物群体中的个别个体由于发生自发突变的结果,
而使该物种原有一系列生物学性状发生衰退性的量变或质变的现象。
120复壮 :应是一项积极的措施,即在菌种的典型特征或生产性状尚未衰退前,就经常有
意识的采取纯种分离和生产性能的测定工作,以期从中选择到自发的正变个体。
121.菌种保藏(culture prervation):是指通过适当方法使微生物能长期存活,并保持原
种的生物学性状稳定不变的一类措施。
122. ATCC:美国典型菌种保藏中心。
123 CCCCM:中国微生物菌种保藏管理委员会
第八章
1,微生物生态学 (microbial ecology):是生态学的一个分支,它的研究对象是微生物生态
系统的结构及其与周围生物和非生物环境系统间相互作用的规律。
2,真菌毒素:一类由真菌产生的,可对人或动物致病的毒素,一般存在于食物和饲料中。在
目前已知的大约九万种真菌中,有200多个种可产生100余种真菌毒素,其中14种能致
癌。
3,黄曲霉毒素 (aflatoxin AFT):由黄曲霉部分菌株产生的。在1960年英国十万
火鸡死于一种病因不明的火鸡X病被发现的。经研究,从巴西进口的花生粉饼中污染有大
量的,分泌AFT导致的。AFT广泛分布于花生,玉米和大米等粮食及加工品上,严
重霉变者含量很高。在205℃下也只能破坏65%.
4.嗜极菌(extremophiles极端微生物):在自然界中,存在着一些绝大多数生物都无法生存
的极端环境,如高温 低温 高酸 高碱 高盐 高毒 高渗 高压 干旱或高辐射强度等环境。凡
依赖于这些极端环境才能正常生长繁殖的微生物,称为
5,条件致病菌 (opportunist pathogen):正常菌群的微生态平衡是相对的,可变的和有条
件的。一旦宿主的防御能力减弱,正常菌群生长部位改变或长期服用抗生素等制菌药物后,
就会引起正常菌群失调。这时原先某些不致病的正常菌群成员,如大肠杆菌 白假丝酵母就
趁机大量转移或大量繁殖,成了致病菌,这类特殊的致病菌称条件致病菌。
6,内源感染 :由条件致病菌引起的感染
7.微生态制剂(microecologics):依据微生态学理论而制成的含有益菌的活菌制剂,其功能
在于维持宿主的微生态平衡,调整宿主的微生态失调并兼有其他保健功能。
8.益生菌剂 (probiotics):通常指一类分离自正常菌群,以高含量活菌为主体,一般以口
服或黏膜途径投入,有助于改善宿主特定部位微生态平衡并兼有若干其他有益生理活性的生
物制剂。
9,益生元(prebiotics又称双歧因子) :专指一类人体不能消化吸收的低聚糖类食物成分,如
寡果糖,寡半乳糖,寡异麦芽糖和寡木糖等。它们进入大肠后,可被其中的双歧杆菌,乳酸
菌等消化吸收,促进了这类有益菌的增殖和产生对宿主健康有益的物质,进而发挥肠道的微
生态平衡和其他保健作用。
10互生 (metabiosis):两种可单独生活的生物,当它们在一起时,通过各自的代谢活动而
有利于对方,或偏利于一方的相互关系。例如微生物与植物的互生--植物内生菌。
11,植物内生菌:一类主要生活在植物体内,但不与植物一起形成一特殊组织结构的微生物。
12共生 (symbiosis):指两种生物共居在一起,相互分工合作,相依为命,甚至形成独特
结构达到难分难解 合二为一的极其紧密的一种相互关系。如根瘤菌与植物间的共生,地衣。
13寄生 (parasitism):一般指一小型生物生活在另一种较大型生物的体内或体表,从中夺
取营养并进行生长繁殖,同时使后者蒙受损害甚至被杀死的一种相互关系。如蛭弧菌。
14拮抗 (又称抗生 anatagonism):指由某种生物所产生的特定代谢产物可抑制其他种生
物的生长发育甚至杀死他们的一种相互关系。
15捕食(predatism):一般指一种大型生物直接捕捉,吞食另一种小型生物以满足其营养
需要的相互关系。
16二步发酵:指反应中有两步由微生物发酵,其余各步仍为化学转化反应。
17.蛭弧菌:小型细菌寄生在大型细菌中的独特寄生现象。小细菌称为蛭弧菌
18蛭质体:已死亡的宿主细胞开始膨胀成圆球状
19单极生态系统:只有分解者
20,双极生态系统:只有生产者和分解者
21三板生态系统:有生产者 分解者和消费者
22细菌沥滤(细菌冶金) :利用化能自养细菌对金属矿物中的硫或硫化物进行氧化,使它不
断生产和再生酸性浸矿剂,并让低品味矿石中的铜等金属以硫酸铜等形式不断溶解出来,然
后再采用电动序较低的铁等金属粉末进行置换,以此获取铜等有色金属或稀有金属。
23.硝化作用 ( nitrifcation ) :氨态氯经硝化细菌 ( nitifying bacteria ) 的氧化转变为硝酸
态氮的过程 , 称硝化作用 。 此反应必须在通气良好 、 pH 接近中性的土壤或水体中才能
进行 。硝化作用分两阶段1.氨氧化为亚硝酸 , 由一群化能自养菌亚硝化细菌
( nitrosbacteria ) 引起 , 如 Nitrosomonas ( 亚硝化单胞菌属 ) 等。2.亚硝酸氧化为硝酸 ,
由一群化能自养菌硝酸化细菌 ( nitrobacteria ) 引起 , 例如 Nitrobater ( 硝化杆菌属 )
等 。 硝化作用在自然界氮素循环中是不可缺少的一环 , 但对农业生产并无多大利益 , 主
要是硝酸盐比铵盐水溶性强 , 易随雨水流入江 、河 、湖 、海中 , 它不仅大大降低肥料的
利用率 ( 硝酸盐氮肥一般利用率仅 40% ) 而且会引起水体的富营养化 ( eutrophication ) ,
进而导致 “ 水华 ” 或 “ 赤潮 ” 等严重污染事件的发生 。土壤中硝化作用可用化学药剂
硝吡啉去抑制。
24氨化作用( ammonification) 指含氮有机物经微生物的分解而产生氨的作用,可在通气或不
通气条件下进行。含氮有机物主要是蛋白质、尿素、尿酸、核酸和几丁质等。许多好氧菌如
Bacillus spp.(多种芽孢杆菌)、Proteus oulgaris (普通变形杆菌)、Pudomonas fuorescens (荧
光假单胞菌)和一些厌氧菌如 Clostridium spp. (多种梭菌)等都具有强烈的氨化作用能力。氨
化作用对提供农作物氮素营养十分重要。
25反硝化作用 (denitrification) 又称脱氮作用,指硝酸盐转化为气态氮化物(N2和NO)的作
用。由于它一般发生在pH为中性至微碱性的厌氧条件下,所以多见于淹水土壤或死水塘中。
在无氧条件下,催化硝酸盐异化性还原作用并引起反硝化作用的一系列还原酶都呈现去阻遏
作用。一些化能异养微生物和化能自养微生物可进行反硝化作用,例如Baillus licheniformis
地衣芽孢杆菌) 、Paracocus denitrficans脱氮副球菌)、Thibacillus denirificans脱氮气硫杆
菌)和若干Pudomonas (假单胞菌属)的菌种等。反硝化作用会引起土壤中氮肥严重损失
(可占施入化肥量的3/4左右),因此对农业生产十分不利。
26.同化性硝酸盐还原作用 (assimilatory nitrate reduction) 指硝酸盐被生物体还原成铵盐
并进一步合成各种含有机物的过程。所有绿色植物、多数真菌和部分原核生物都能进行此反
应。
27,异化性硝酸盐还原作用( dissimilatory nitrate reduction) 指硝酸离子充作呼吸链(电子
传递链)末端的电子受体而被还原为亚硝酸的作用。能进行这种反应的都是一些微生物,尤其
是兼性厌氧菌(详见第五章第一节的厌氧呼吸和硝酸盐呼吸)。
28富营养化(eutrophication):指水体中因氮、磷等元素含量过高而导致水体表层蓝细菌
和藻类过度生长繁殖的现象。这时,下层水体不仅缺光少氧,而且因大量死藻被细菌分解而
进一步造成缺氧和有毒的环境。
29水华 :水华(water bloom)指发生在池、河、江、湖或水库等淡水水体中因富营养化而
引起的藻类过度繁殖的自然现家。在温暖季节,当因不合理施用化肥、使用大量含磷洗涤剂
等而使水体中的P/N值达到redfield氏常数或无机氮浓度达到 300 mg/m3、总磷量达到
20 mg/m3时,水体中的蓝细菌和浮游藻类就会迅速增殖,从而在水面上形成一薄层由蓝绿
色的藻体和泡沫组成的水华。水华中常见的蓝细菌有微囊蓝细菌属、 鱼腥蓝细菌属和束丝
蓝细菌属 常见的的绿藻有衣藻属 裸藻属和多种硅藻等。其中许多种类会产生对鱼、虾、软
体
动物和人、畜等有害的毒素,特别是蓝细菌毒素(又称蓝藻毒素)等。
30,赤潮:(red tide)指发生在河口、港湾或浅海等咸水区的水体,因富营养化而导致其中的
蓝细菌、浮游植物和原生动物的暴发性增殖、聚集,从而使水体呈现红、棕色的自然现象。
近年来,我国沿海的赤潮频繁出现,以每10年3倍的速度递增,每年都有特大赤潮(面积大
于1000km)出现。
31生化需氧量(BOD): ( biochemical oxygen demand)即“生化需氧量”或“生化耗氧量”,又
称生物需氧量,是水中有机物含量的一个间接指标。一般指在 1 L污水或待测水样中所含的
一部分易氧化的有机物,当微生物对其氧化、分解时,所消耗的水中溶解氧毫克数(其单位
为mg/L)。BOD的测定条件一般规定在20°C下5昼夜,故常用BOD5(5日生化需氧量)符
号表示。我国对地面水环境质量标准的规定为: 一级水BOD5值<1 mg/L,二三级水<3mg/L,
三级水<4 mg/L,若> 10mg/L时,表示该水已严重污染,鱼类无法生存。
32化学需氧量(COD): ( chemical oxygen demand)即化学需氧量, 是表示水体中有机物
含量的一个简便的间接指标,指1 L污水中所含的有机物在用强氧化剂将它氧化后,所消耗
氧的毫克数(单位为mg/L)。常用的化学氧化剂有K2Cr20,或KMnO2,但前者的氧化力更强,
能使水体中80% ~ 100%的有机物迅速氧化,故被优先选用,由此测得的COD值应标以
“CODcr”。此法较测BOD更为快速简便。同一水样其BOD5和COD值并不相等,但它们
间有一定的比例关系。
33总需氧量(TOD) : ( total oxygen demand)即总需氧量,指污水中能被氧化的物质(主要
是有机物)在高温下燃烧变成稳定氧化物时所需的氧量。TOD是评价某水质的综合指标之一,
与测BOD 或COD相比,具有快速、重现性好等优点,但需用灵敏的检测仪器作测定。
34溶解氧量(DO) :dissolved oxygen即溶解氧量, 指溶于水体中的分子态氧,是评价水
质优劣的重要指标。DO值大小是水体能否进行自净作用的关键。天然水的DO值般为5~
10mg/L。我国规定地面水水质的合格标准为DO>4 mg/L。
35.悬浮物含量(SS) :(suspend solid)即悬浮物含量, 指污水中不溶性固态物质的含量。
36,总有机碳含量(TOC) : (total organic carbon)即总有机碳含量, 指水体内所含有机物
中的全部有机碳的量。可通过把水样中的所有有机物全部氧化成co2和H2O,然后测定生成
CO2的量来计算。
37异生物质(xenobiotic):是指一些天然条件下并不存在的由人工合成的化学物质,如一
些杀虫剂,杀菌剂和除草剂等。
38,持久性有机污染物(POPs):是一类具有环境持久性(极难降解),生物累积性(可通过食
物链进行传递和累积),高生物学毒性和长距离迁移性的人工合成有机污染物。目前发现的
已有20余种,主要是各种氯代有机物,溴代有机物和氟代有机物,如有机氯农药,多氯联
苯。
39,完全混合曝气法 :又称表面加速曝气法,是一种利用活性污泥处理污水的方法。
40,活性污泥(active sludge):指一种由活细菌,原生动物和其他微生物群聚集在一起组成
的凝絮团。
41,生物转盘法:适合土地面积紧张的大城市内的利用生物背膜处理污水的方法。
42生物质 (biomass):由光合作用直接或间接的把日光能转化成的有机物,包括植物动物
和微生物体以及它们的加工产物和残余物在内的一切有机物,称为生物物质。
43沼气发酵(methanogenesis):又称甲烷形成作用,其生物化学本质是:产甲烷菌在无氧
条件下,利用H2还原CO2等碳源营养物,借以产生能量,细胞物质和代谢废物(CH4)的
生理过程。
第九章
1.病原体(pathogen):凡能引起传染病的生物。
2,传染(感染)(infection):又称感染或侵染,指外源或内源性病原体在突破其宿主的三道防
线(机械屏障,非特异性免疫和特异性免疫)后,在宿主的特定部位定居,生长,繁殖,产
生特殊酶和毒素,进而引起一系列病理生理反应的过程。
3,传染病:是一类由活病原体的大量繁殖所引起,可从某一宿主的个体直接或间接传播到同
种或异种宿主的疾病。
4人畜共患病:人和脊椎动物由同一种病原体引起的,在流行病学上密切相关的一类传染病
5毒力(virulence):又称致病力,表示病原体致病能力的强弱。对细菌性病原体来说,毒
力就是菌体对宿主体表的吸附,向体内侵入,在体内定居,生长和繁殖,向周围组织的扩散
蔓延,对宿主防御功能的抵抗,以及产生损害宿主的毒素等一系列能力的总和。不同的细菌
及其毒力组成有很大差别。现把构成毒力诸因素归结为侵袭力和毒素两方面。
6侵袭力(invastiveness):指病原体所具有的突破宿主防御功能,并在其中进行生长繁殖
和实现蔓延扩散的能力。包括以下三种:吸附和侵入能力 繁殖与扩散能力和抵抗宿主防御
功能的能力。
7透明质酸酶(hyaluronida):旧称扩散因子,可水解机体结缔组织中的透明质酸,引起
组织松散,通透性增加,有利于病原体迅速扩散,因而可发展成全身性感染。链球菌属,葡
萄球菌属和梭菌属的若干种可产生酶。
8,胶原酶(collagena):又称k毒素,能水解胶原蛋白以利于病原体在组织中扩散,可引
起气性坏疽的病原菌--产气荚膜梭菌等可产生此酶。
9卵磷脂酶 :又称α毒素,可水解各种组织的细胞,尤其是红细胞。如蛇毒是由此酶引起
10.外毒素(exotoxin):指在病原细菌生长过程中不断向外界环境分泌的一类毒性蛋白质,
有的属于酶,有的属于酶原,有的属于毒蛋白。
11,类毒素 (toxoid):若用0.3%-0.4%的甲醛溶液对外毒素进行脱毒处理,可获得失去毒性
但仍保留其原有免疫原性(抗原性)的生物制品。将其注射机体,可使机体产生对相应外毒
素具有免疫性的抗体(抗毒素)常用的类毒素有白喉类毒素,破伤风类毒素和肉毒毒素
12内毒素 (endotoxin):是G-细菌细胞壁外层的组分之一,其化学成分是脂多糖。因其
在活细胞中不分泌到体外,仅在细菌死亡后自溶或人工裂解时才释放,故称内毒素。
13热源质 (pyrogen):若将内毒素注射到温血动物或人体内后,会刺激宿主细胞释放内源
性的热源质,通过它对大脑控温中心的作用,就会引起动物发高烧。
14鲎试剂法(limulus assay):即鲎变形细胞溶解物质试验法(LALtest)。鲎血中仅含一种
变形细胞,其裂解产物可与G-细菌的内毒素和脂磷壁酸(膜磷壁酸)发生特异性和高灵敏
度的凝胶化反应。P278
15垂直传播途径 :有些病毒如艾滋病,疱疹,乙型肝炎等的病原体可通过胎盘,产道等途
径由母亲传给婴儿,称为垂直……
16,隐性传染(inapparent infection):如果宿主的免疫力很强,而病原菌的毒力相对较弱,
数量又较少,传染后只引起宿主的轻微损害,且很快就将病原体彻底消灭,而且基本上不出
现临床症状者,称为
17,带菌状态 (carrier state):如果病原菌和宿主双方都有一定的优势,但病原体仅被限制
于某一局部且无法大量繁殖,两者长期处于相持的状态,就称为带菌状态。
18显性传染 (apparent infection):如果宿主的免疫力较低,或入侵病原体的毒力较强,
数量较多,病原体很快在体内繁殖并产生大量有毒产物,使宿主的细胞和组织蒙受损害,生
理功能异常,于是就出现了一系列的临床症状,这就是显性传染或传染病。
19败血症 (pticemia):病原体侵入宿主的血流并在其中大量繁殖,造成宿主严重损伤和
全身性中毒症状者,称为败血症。例如铜绿假单胞菌常可引起败血症。
20非特异性免疫 (nonspecific immunity):凡在生物长期进化过程中形成,属于先天即
有,相对稳定,无特殊针对性的对付病原体的天然抵抗能力,称为非特异性免疫也称先天免
疫或自然免疫。
21.血脑屏障 :一种可阻挡病原体及其有毒产物或某些药物从血流透入脑组织或脑脊液的非
专有解剖构造,具有保护中枢神经系统的功能,主要由软脑膜,脉络丛,脑血管及星状胶质
细胞组成。婴儿因血脑屏障未发育完善,故易患脑膜炎或乙型脑炎等传染病。
22,血胎屏障:由母体子宫内膜的底蜕膜和胎儿的绒毛膜共同组成。当它发育成熟(约妊娠
三个月后),具有保证母子间物质交换和防止母体内的病原体侵入胎儿的功能。
23多形核白细胞 (PMN)又称粒细胞。一类有分节状细胞核,细胞质含大量溶酶体颗粒的
白细胞,形状较小,运动力强,在骨髓中形成,寿命短(半衰期6-7h),存在于血流和骨髓
中。有三类:嗜中性粒细胞(最为重要 占90%),嗜碱性粒细胞和嗜酸性粒细胞。
24单核细胞
25巨噬细胞(Mφ):是一类存在于血液,淋巴,淋巴结,脾脏,腹水和多种组织中的大型
单核细胞,寿命长,可作变形虫运动,对异物有吞噬,胞饮,抗原加工和递呈功能。
26炎症(inflammation):是机体对病原体的侵入或其他损伤的一种保护性反应,在相应部
位出现红,肿,热,痛和功能障碍,是炎症的五大病理特征。
27补体(complement):补体实为一补体系统,是指存在于正常人体或高等动物血清中的
一组非特异性血清蛋白(主要成分是β球蛋白)。在免疫反应中,由于它具有扩大和增强抗体
的补助功能,故称补体。本质是一类酶原,能被任何抗原-抗体复合物激活,激活后的补体
就能参与破坏或清除已被抗体结合的抗原或细胞,发挥其溶胞作用,病毒灭活,促进吞噬细
胞吞噬和释放组胺等免疫功能。性质不稳定。由巨噬细胞,肠道上皮细胞及肝,脾细胞所产
生。
28干扰素(interferons IFNs):是高等动物在病毒或dsRNA等干扰素诱生剂的刺激下,所
产生的一种具有高活性,广谱抗病毒功能的特异性糖蛋白,相对分子质量很小。它的功能除
能抑制病毒在细胞中的增殖外,还具有免疫调节作用(包括增强巨噬细胞的吞噬作用,增强
NK细胞和T细胞的活力)和对癌细胞的杀伤作用等,因此可用于病毒病和癌症的治疗。四
类:INF-α INF-β INF-γ INF-ω。
29,特异性免疫(specific immunity):也称获得性免疫或适应性免疫,是相对于上述非特异
性免疫而言的,其主要功能是识别自身和非自身的抗原物质,并对它产生免疫应答,从而保
证机体内环境的稳定状态。
30.免疫应答 (immune respon):是指一类发生在活生物体内的特异性免疫的系列反应
过程。这是一个从抗原的刺激开始,经过抗原特异性淋巴细胞对抗原的识别,使淋巴细胞发
生活化,增殖,分化等一系列变化,最终表现出相应的体液免疫或细胞免疫效应。能识别异
己,具有特异性和记忆性是免疫应答的三个突出特点。
31.细胞免疫 :指机体在抗原刺激下,一类小淋巴细胞发生增殖分化进而直接攻击靶细胞或
间接的释放一些淋巴因子的免疫作用。
32,体液免疫 :则指机体受抗原刺激后,来源于骨髓的一类小淋巴细胞(B细胞)进行增殖
分化为浆细胞,由它合成抗体并释放到体液中以发挥其免疫作用。
33中枢免疫器官 :一级淋巴器官,是免疫细胞发生分化和成熟的部位,骨髓胸腺,法氏囊。
S7,外周免疫器官 :主要是脾和淋巴结。
34.免疫细胞 (immunocyte):泛指一切具有非特异性和特异性功能的细胞,包括各类淋巴
细胞(T,B,NK和K细胞等),粒细胞,单核细胞和各种类型的巨噬细胞等。
35,免疫活性细胞:指能特异性识别抗原,即能接受抗原的刺激,并随后进行分化,增殖和
产生抗体或淋巴因子,以发挥特异性免疫应答的一群细胞,主要是指T和B。因单核细胞和
巨噬细胞在非特异性和特异性免疫中都发挥作用,故也可列入免疫活性细胞。
36.细胞因子(cytokines):一类存在于人和高等动物体中的,由白细胞和其他细胞合成的异
源性蛋白或糖蛋白,一般以小分子分泌物形式释放,可结合在靶细胞的特异受体上。细胞因
子可使各种信使分子连成一动态网络,借以发挥其激活和调节免疫系统的多种功能,以便对
外来的病原体感染或抗原性异物迅速做出免疫应答或其他生理反应。包括:细胞化学因子,
白细胞介素(IL),细胞毒因子(如肿瘤坏死因子TNF),集落刺激因子(CSF),促生长因子,
干扰素(IFN)
37免疫分子:主要指抗原和抗体
38,抗原 (antigen Ag):是一类能诱导机体发生免疫应答并能与相应抗体或T淋巴细胞受
体发生特异性免疫反应的大分子物质。一般同时具有两个特性:免疫原性和免疫反应性
39.半抗原 (hapten):凡缺乏免疫原性而有免疫反应性的抗原物质,称为半抗原,例如大
多数多糖,类脂,核酸及其降解物以及某些药物(如青霉素在水溶液中分解产生的青霉烯酸
和青霉噻唑)等,因其无免疫原性,故不能刺激机体产生免疫应答,但当它们与适当的蛋白
载体如甲基化牛血清蛋白(MBSA)相结合后,就兼有了免疫原性,由此刺激机体产生的抗
体,就可与该半抗原发生特异结合,可以认为,半抗原实为-抗原决定簇。
40.抗原决定簇:又称抗原表位,指位于抗原表面可决定抗原特异性的特定化学基因,即构
成抗原的免疫原性所必需的最少亚单位数。一个抗原的表面可存在一至多种不同的抗原决定
簇,由此产生了一至多种相应的特异性。
41抗原结合价 :凡能与抗体相结合的抗原决定簇的总数
42,共同抗原 :为多种复杂抗原系统所共有的抗原。
43免疫交叉反应:由于甲乙两菌存在共同抗原而引起甲菌抗原与乙菌的抗体间发生的较弱
的免疫反应的现象。
44凝集吸收反应:常利用交叉反应的原理把某一多价特异性抗血清与其共同抗原反应,再
把此抗原抗体复合物去除,就可去除其中的共同抗体,这就称吸收反应,如果所用的共同抗
原是颗粒状的,则称凝集吸收反应。
45抗体 (antibody Ab):是高等动物在抗原物质的刺激下,由浆细胞产生的一类能与相应
抗原在体内发生特异性结合的免疫球蛋白。
46抗抗体 :因抗体是蛋白质,故既具有抗体功能也可作抗原去刺激异种物产生相应的抗体,
47免疫球蛋白:凡具有抗体活性以及与抗体有关的各种球蛋白。
48单克隆抗体 (monoclonal antibody):McAb,指由一纯系B淋巴细胞克隆经分化,增殖
后的浆细胞所产生的单一成分,单一特异性的免疫球蛋白分子。利用淋巴细胞杂交瘤产生单
克隆抗体。
49淋巴细胞杂交瘤(lymphocyte hybridoma):简称杂交瘤,是由B淋巴细胞和骨髓瘤细
胞两者融合而成的一种既能在体内外大量增殖,又能分泌大量单克隆抗体的杂种细胞。
50,血清学反应 :传统的免疫方法仅局限于用体液免疫产生的抗体和各种抗原在体外进行反
应,因所用抗体均采自免疫后的血清,故称血清学反应。
51凝集反应(agglutination) :颗粒性抗原(完整的细菌细胞或血细胞等)与相应的抗体
在合适的条件下反应并出现肉眼可见的凝集团现象。
52沉淀反应(precipitation):可溶性抗原与其抗体在合适的比例和适当的条件下反应,并
出现肉眼可见的沉淀物现象,称为沉淀反应,抗原称沉淀原 抗体称沉淀素。
53补体结合试验 (complement fixation test CFT):是一种有补体参与,并以绵羊红细胞
和溶血素(红细胞的特异抗体)是否发生溶血反应作指示的高灵敏度地测定抗原与抗体间特
异性反应的免疫学方法。
54中和试验 (neutralization test):由特异性抗体抑制相应抗原的生物学活性的反应。例
如 在临床诊断中,测定风湿病患者体内是否存在抗链球菌O抗体的反应,就是利用该
55酶联免疫吸附法( ELISA):简称酶标法,一种把抗原抗体反应的特异性与酶和底物反应的
特异性以及灵敏性相结合起来免疫酶技术。此法被广泛用于检测各种抗原或抗体。包括:双
抗体夹心法,间接免疫吸附测定法,斑点酶免疫吸附法。
56疫苗(vaccine):用于预防传染病的抗原制剂称为疫苗。通常用钝化弱化或无害的病原体
或其产物制成,用以刺激机体产生保护性免疫力。广义的疫苗包括菌苗和疫苗两类生物制品,
狭义的疫苗仅指用病毒,立克次氏体或螺旋体等微生物制成的生物制品。
57抗毒素:(antitoxin):一类用类毒素多次注射马等大型动物,待其产生大量特异性抗体
后,经采血,分离血清并经浓缩,纯化后制成的生物制品。主要用于治疗由细菌外毒素引起
的疾病,也可以用于应急预防。如破伤风抗毒素,白喉抗毒素,肉毒抗毒素等。毒蛇咬伤也
可用毒蛇抗毒素来治疗。
58免疫调节剂 :是一类能增强,促进和调节免疫功能的非特异性生物制品。它对治疗免疫
功能低下,某些继发性免疫缺陷症和某些恶性肿瘤等疾病,具有一定的作用。主要机制:通
过非特异性的方式增强T,B淋巴细胞的反应性,或是促进巨噬细胞的活性,也可以激活补
体或诱导干扰素产生。
59转移因子 (transfer factor TF):一种又淋巴细胞产生的低分子核苷酸和多肽的复合物,
无免疫原性,有种属特异性,制剂有两类:特异性TF(来自某种疾病康复者或治愈者的淋
巴细胞中提取,能把供者的某一特定细胞免疫功能特异性的转移给受者)和非特异性TF(从
健康人的淋巴细胞中取得,可非特异性的增强机体的细胞免疫功能,促进干扰素的释放,刺
激T细胞的增殖,并使它产生各种介导细胞免疫的介质)。TF已被用于治疗麻疹后肺炎,单
纯疱疹和带状疱疹等病毒性疾病。
第十章
1,种(species):是一个基本分类单元,它是一大群表型特征高度相似,亲缘关系极其接近,
与同属内的其他物种有着明显差异的菌株的总称。
2菌株 (strain):又称品系,它表示任何由一个独立分离的单细胞(或单个病毒粒)繁殖
而成的纯遗传型群体及其一切后代。因此,一种微生物的每一不同来源的纯培养物或纯分离
物均可称为某菌种的一个菌株。
3三界学说:动物界 植物界 原生生物界
4.五界学说:植物界,真菌界,动物界和原生生物界以及原核生物界。
5,三域学说 :指的是细菌域,古生菌域和真核生物域。
6.(G +C) mol%值:DNA碱基比例,表示DNA分子中鸟嘌呤G和胞嘧啶C所占的摩尔百分
比值,=(G+C)/(A+T+G+C)×100%
7解链温度(Tm) :熔解温度或热变性温度,紫外吸收增高的中点值所对应的温度。
8,核酸分子杂交法:按碱基的互补配对原理,用人工方法对两条不同来源的单链核酸进行复
性(即退火),以重新构建一条新的杂合双链核酸的技术。是测定核酸分子同源程度和不同
物种间亲缘关系的有效手段。
9 rRNA寡核苷酸编目分析:一种通过测定原核或真核生物中最稳定的rRNA寡核苷酸序列
同源程度,以确定不同生物间的亲缘关系和进化谱系的方法。
10数值分类法:又称统计分类法,是一种依据数值分析的原理,借助现代电子计算机技术
对拟分类的微生物对象按大量表型性状的相似性程度进行统计,归类的放法
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