蛋白质序列(蛋白质序列是什么)

蛋白质序列是什么意思？

蛋白质中基本氨基酸只有二十种。若有其他氨基酸，也都是二十种基本氨基酸经过修饰得来的。不知楼主学过生化吗？氨基酸基本结构是一样的，区别只在于R基。就是说，二十种基本氨基酸只意味着二十种R基。序列中的数字就代表残基的顺序，每行60个残基，从第一个到第60个。一行肽链有三个氨基酸，残基也只有三个呀，一个残基指的是氨基酸形成肽键（要脱去一个羟基和一个氢）后的剩余部分。一号残基就是第一个氨基酸脱去羟基的部分。肽链的顺序是从N端到C端。

蛋白质序列功能域

一条蛋白质序列中的一段保守区域，该区域能够独立行使功能、进化等。
在蛋白质结构中，是一个蛋白质结构的一部分，能形成一个紧密的三级结构，能独立折叠且结构稳定，同样具有独立功能和进化等特征。

目的：除了多序列联配的结果，用更好的方式描述功能域并应用。

多序列联配结果中每一列出现最多的碱基或氨基酸构成的序列，是一条单一序列。

把每一列出现的碱基或氨基酸都列出而形成的。

是一个类似PSSM的矩阵，但它可以包含匹配、错配、插入和缺失等情况。提供了多序列联配中每一列出现各种氨基酸（或空格）的概率（经过对数转换并取整数）。

用参数表示的用于描述随机过程统计特性的概率模型，是一个双重随机过程，由两部分组成：马尔可夫链和一般随机过程。
详情见书P381

信息量IC=2-H（H越大，IC越低）

基因的蛋白质编码序列是什么序列?

基因的蛋白质编码序列是CDS序列，可以叫coding gment或coding quence。这条序列从ATG启动密码子开始，终止密码子结束。

所有的CDS都是ORF（开发阅读框 open reading framework），ORF就是ATG开始，终止密码子结束的一条序列，但ORF不一定编码蛋白，这是它和CDS的区别，只有编码蛋白的ORF才是CDS。

对于真核生物来说，mRNA是由外显子组成的。真核生物在转录后产生核不均一RNA（hnRNA）经过修饰加工可变剪切（除去内含子）形成成熟mRNA。

原核生物则不需要。所以在生物信息学中单纯使用查找ATG的方式找ORF只适合原核生物或mRNA，真核有专门的基因预测软件。

基因（遗传因子）是产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因支持着生命的基本构造和性能。储存着生命的种族、血型、孕育、生长、凋亡等过程的全部信息。

环境和遗传的互相依赖，演绎着生命的繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生理过程。生物体的生、长、衰、病、老、死等一切生命现象都与基因有关。

它也是决定生命健康的内在因素。因此，基因具有双重属性：物质性（存在方式）和信息性（根本属性）。

蛋白质的一二三四级结构是什么？

蛋白质四级结构

（1）一级结构指形成肽链的氨基酸序列，即氨基酸残基的排列顺序。

（2）二级结构多肽链盘绕形成规律性结构。

（3）三级结构多肽链三维构象，在二级结构基础上，进一步折叠成复杂分子结构。

（4）四级结构数条完整三级结构多肽链连接而成聚合体结构。

蛋白质的作用

构造人体：蛋白质是细胞组成的必要成分，是人体结构组织的主要物质，人体的毛发、肌肉、骨骼、内脏等都离不开蛋白质。

供能：蛋白质可以为人体的生命活动提供能量，保证营养供给。

载体：蛋白质可以在体内运输各种物质，如氧气、各种离子等，维持人体的生命活动。

免疫：蛋白质具有免疫功能，人体的抗体就是由蛋白质构成，有助于帮助人体抵抗感染。

以上内容参考 百度百科--蛋白质结构

蛋白质的一二三四级结构是什么？

一级结构：蛋白质多肽链中氨基酸的排列顺序，以及二硫键的位置。

二级结构：蛋白质分子局区域内，多肽链沿一定方向盘绕和折叠的方式。

三级结构：蛋白质的二级结构基础上借助各种次级键卷曲折叠成特定的球状分子结构的空间构象。

四级结构：多亚基蛋白质分子中各个具有三级结构的多肽链，以适当的方式聚合所形成的蛋白质的三维结构。

蛋白质是以氨基酸为基本单位构成的生物大分子。蛋白质分子上氨基酸的序列和由此形成的立体结构构成了蛋白质结构的多样性。蛋白质具有一级、二级、三级、四级结构，蛋白质分子的结构决定了它的功能。

蛋白质（protein）是组成人体一切细胞、组织的重要成分。机体所有重要的组成部分都需要有蛋白质的参与。一般说，蛋白质约占人体全部质量的18%，最重要的还是其与生命现象有关。

蛋白质是生命的物质基础，是有机大分子，是构成细胞的基本有机物，是生命活动的主要承担者。没有蛋白质就没有生命。氨基酸是蛋白质的基本组成单位。它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。

机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有蛋白质参与。蛋白质占人体重量的16%~20%，即一个60kg重的成年人其体内约有蛋白质9.6~12kg。人体内蛋白质的种类很多，性质、功能各异，但都是由20种氨基酸（Amino acid）按不同比例组合而成的，并在体内不断进行代谢与更新。

蛋白质序列的意思？？

蛋白质序列测定技术先于DNA序列测定技术问世，蛋白质序列的搜集也早于DNA序列。蛋白质序列数据库的雏形可以追溯到60年代。60年代中期到80年代初，美国国家生物医学研究基金会(National Biomedical Rearch Foundation，简称NBRF)Dayhoff领导的研究组将搜集到的蛋白质序列和结构信息以“蛋白质序列和结构地图集”(Atlas of Protein Sequence and Structure)的形式发表，主要用来研究蛋白质的进化关系。1984年，“蛋白质信息资源”(Protein Information Resource，简称PIR)计划正式启动，蛋白质序列数据库PIR也因此而诞生。与核酸序列数据库的国际合作相呼应，1988年，美国的NBRF、日本的国际蛋白质信息数据库(Japane International Protein Information Databa，简称JIPID)和德国的慕尼黑蛋白质序列信息中心(Munich Information Center for Protein Sequences，简称MIPS)合作成立了国际蛋白质信息中心(PIR-International)，共同收集和维护蛋白质序列数据库PIR，[Barker等, 2000]。