ncbi怎么用?
首先打开ncbi主页
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
在搜索框左边的下拉菜单选择"Gene",并输入要找的基因名称(最好是正式名称/缩写或者常用名称),例如想找人的超氧化物歧化酶1的基因,就输入Superoxide dismuta 1或者sod1,然后点"Search",在结果页面里选择智人[Homo sapiens]的对应结果即可进入超氧化物歧化酶1的基因报告页面(为了减少多余的结果,也可以把human/mou/rat之类的物种名加入关键词,用拉丁名homo/mus/rattus也可以)。
在基因报告页面里具体的基因组/mRNA/蛋白的信息可以将鼠标移动到基因图示的基因名上面,显示的下拉菜单里按第三个按钮,向下箭头,显示更多信息里有相关链接;另外也可以通过页面中间部分的"NCBI reference quences"找到对应的链接。
呃……看不懂英文就没法帮你了,找个词典吧!
NCBI主页中arch中的nucleotide和gene有何区别
对于Homo sapiens B-cell CLL/lymphoma 2 (BCL2)的nucleotide和gene的信息分别如下:
nucleotide:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=nucleotide&val=4557354
gene:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene&cmd=Retrieve&dopt=Graphics&list_uids=596
nucleotide主要关注碱基序列,里有个FASTA格式的序列可以下载,gene里主要是对这个基因进行详细描述,涉及在基因组的位置,转录、翻译等。详细可以自己看看区别。
ncbi怎么用
ncbi使用教程
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2016-11-04 19054人看过
NCBI (National Center for Biotechnology Information)是指美国国立生物技术信息中心。理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表,出现了生命过程的语法,其最复杂形式就是人类。阐明和使用这些字母来组成新的“单词和短语”是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须。挑战在于发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性,并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具,以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的理解。在生物学研究中,NCBI提供了大量的生物信息分析工具以及文献。所以学号检索方法是进入新生物学领域的必备技能。Blast工具、PubMed文献数据库等。
工具/原料
浏览器 NCBI网址
方法/步骤
1/9 分步阅读
首先进入NCBI主页。
Map view演示,主要是找到相关基因在染色体上的位置,以人类IL-6基因为例。
点击Map View
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选择物种,点击Go;
设置filter,过滤信息;
点击Genes q查询序列
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3/9
最后进入序列下载页面,可以直接下载。可以选择多种格式,一般选择fasta。
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通过clone查询相关基因的cDNA序列
选择clone数据库,arch基因描述。
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对基因的蛋白质序列和mRNA查询。
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也可对序列进行查询。基因组展示。
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也可以查询序列信息。
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查询已知引物,通过probe数据库搜索。
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同源性比对blast。有多种比对方式。DNA,RNA,Protein等比对模式,排列越高表示同源性越强。也可以进行引物比对。
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注意事项
简单演示仍需深入了解
21世纪是生物科学的世纪
软件 NCBI
编辑于2016-11-04,内容仅供参考并受版权保护
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bsci认证机构哪家好?
如何在NCBI里得到序列
一、
进入NCBI主页:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
在arch后面选择Gene,在for后面填写需要查找的基因的名字。点击“Go”
出现了很多基因序列,在每个序列的右边还有“Order
cDNA
clone”
的链接,这些序列中有些序列是跟你的目的基因同名的,有些是别名(Other
Alias)与你的目的基因一致,根据每个序列的介绍认真选择你的目的基因。
二、查找cDNA、mRNA和蛋白序列
1.
查找cDNA序列
①
点击Order
cDNA
clone,
②
点击Clone
Sequence后面的链接即可得到cDNA序列。
NCBI是什么?主要是做什么?
NCBI是National Center for Biotechnology Information的缩写,指美国国家生物技术信息中心,建立于1988年。
NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。除了建有GenBank核酸序列数据库(该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库,其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构)之外,NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。
扩展资料:
NCBI提供的资源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browr、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共计36种功能,而且都可以在NCBI的主页www.ncbi.nlm.nih.gov上找到相应链接,其中多半是由BLAST功能发展而来的。
已故参议员克劳德·佩珀认识到计算机化信息处理方法对于进行生物医学研究的重要性以及赞助立法,该立法于1988年11月4日成立了国家生物技术信息中心(NCBI),作为国家医学图书馆的一个部门(NLM) )在美国国立卫生研究院(NIH)。
参考资料来源:
百度百科-NCBI