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MTHFRC677T,MTHFRA1298C,MTRRA66G基因检测操作流程
实验流程
一、操作步骤
适用仪器:普通PCR仪
样本要求:EDTA抗凝剂的静脉全血(100l),室温保存不超过7天,2~8℃保存不超过1个月,
-20℃保存不超过3个月,反复冻融次数不超过5次;DNA的浓度应不低于5ng/l,A260/A280
应在1.6~2.0之间。有血块的样本需经匀浆处理或用b站电影 组织研磨仪研磨处理后再进行全血DNA的提
取。
检验方法:(试剂盒中的检本测卡、阳性/阴性对照卡上标识解释如下:M表示突变型,WT表示野
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生型,C表示质控线,T表示检测线。)
A:样本DNA的制备
试剂盒准备工作:
1、清洗液BW-I:用50ml量筒分别移取35ml无水乙醇(分析纯)和35ml异丙醇加入至清洗
液BW-I试剂瓶中,颠倒混合均匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。
2、清洗液BW-II:用50ml量筒移取49ml无水乙醇加入至清洗液BW-II试剂瓶中,颠倒混合均
匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。
3、蛋白酶K准备:取出蛋白酶K,室温解冻,涡旋混匀后备用。
4、磁性微粒准备:将磁性微粒涡旋混匀,保证均一。
实验操作步骤:
1.将20l蛋白酶K溶液加入2ml离心管的管底。依次加入100l全血、200l裂解液
BL,用涡旋振荡器混合15c(以下简称涡旋混匀),56℃水浴20min。
2.向步骤1裂解处理的样品中依次加入300l结合液BI、25l的磁性微粒(移取前必须充
分涡旋混匀),涡旋混匀,室温静置5min。磁性分离5min,弃上清。
3.从磁性分离器上取出离心管,加入400l清洗液BW-I,涡旋混匀,磁性分离至上清澄清(期
间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁),弃上清;重复本步操作,以400l清洗液BW-I重复
清洗一次。
4.从磁性分离器上取出离心管,加入400l清洗液BW-II,涡旋混匀,磁性分离至上清澄清(期
间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁),弃上清(尽可能弃去所有的清洗液BW-II)。
5.打开离心管盖,将其室温晾干5min。
6.从磁性分离器上取下离心管,向管中加入100l洗脱液ES,涡旋混匀,56℃水浴5min。
7.将离心管置于磁测量工 性分离器上,磁性分离至上清澄清。将上清液(分离纯化得到的DNA溶液)
转移到2ml离心管中,直接用于下游实验或于-20℃保存备用。
B:PCR扩增液准备
(1)每人份需做两个反应,取两个无菌0.2mlPCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT。
(2)将试剂从-20℃取出平衡至室温,瞬时离心。在标有M的管中加入29l扩增液(M),在标
有WT的管中加入29l扩增液(WT)。
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(3)分别向以上M和WT各管中加入1l反应液。将管盖花样面点 盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心待用。
C:待检测DNA样本的配制
在上述标有M、WT管中分别加入3l待测基因组DNA,分别再加入17lddH2O使终体积为50l。
将管盖盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心。
D:PCR扩增
将PCR管放入PCR仪中,按如下程序扩增:50℃2min;95℃5min;94℃30c、60℃30c、
65℃1min(26Cycles);65℃10min;4℃Hold。取出PCR产物,2~8℃保存。
E:检测卡检测实验
从密封袋中取出检测卡,将待测样本M与WT管中的PCR产物分别滴加在检测卡对应的样品垫处,
待2~5min对结果进行判读,20min后结果不可靠。
F:质量控制
(1)检测结果中阳性对照应在阳性对照卡检测线(T线)出条带,阴性对照应在阴性对照卡检测
线(T线)不出条带。正常检测时,应定期进行阳性对照品及阴性对照品实验。
(2)阳性对照品实验:取两个无菌0.2mlPCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT,将
20lM阳性对照液、20lWT阳性对照液分别加入标学习历史 有M、WT的PCR薄壁管中,再依次分别加入
M扩增液29l及1l反应液、WT扩增液29l及1l反应液,按照步骤中D~F完成,检测线(T
线)及质控线(C线)均应出现条带。
(3)阴性对照品实验:取两个无菌0.2mlPCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT,将
M扩增液29l、1l反应液及WT扩增液29l、1l反应液分别加入标有M、WT的PCR薄壁管中,
再分别加入20l阴性对照液,按照步骤中D~F完成,质控线(C线)应出现条带,检测线(T线)
应无条带出现。
G:结果判读(如下图、下表)
如上图一所示,以阳性对照液为模板进行PCR反应,对PCR产物进行检测,检测线(T线)有条
带出现,作为阳性对照;以阴性对照液为模板进行PCR反应,对PCR产物进行检测,检测线(T
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线)无条带出现,为阴性对照。若阴性样本有条带出现,有可能加样时未及时更换吸头,有DNA
污染,建议在操作过程中,先配制阴性对照管并及时闭合PCR管盖。图二显示MTHFR677CC表示
正常野生型;图三显示MTHFR677TT表示一对等位基因的第677位胞嘧啶(C)均变为胸腺嘧啶(T),
即纯合突变;图四显示MTHFR677CT表示其中一个等位基因的第677位胞嘧啶(C)变为胸腺嘧啶
(T单项选择 ),即杂合突变;图五质控线(C线)无条带或质控线(C线)与检测线(T线)均无条带,即
为无效检测。无效原因可能为操作不正确或试纸条已变质损坏。应再次仔细阅读说明书,并用新
的检测卡重新检测。如果问题仍然存在,应立即停止使用该批号产品,并与厂家或供应商联系。
H:注意事项
(1)实验室应该遵循PCR实验规范的要求分区操作,各区物品均为专用,不得交叉使布鲁将军 用,加模板和引物
的移液器不能混用,每次加样后均需更换吸头,推荐使用无核酶、带滤芯的吸头。各区的仪器、设备和工
作服应独立使用。
(2)本试剂盒用于体外操作。用户切勿吸入试剂或直接接触皮肤。
(3)使用本试剂盒前,请仔细阅读说明书,严格按照说明书的要求操作。打开包装后请尽快使用。
(4)使用本试剂盒时,因PCR体系为50l体系,应使用200l的PCR扩增管进行操作。
(5)本试剂盒备有“PCR组分加入确认单”,在【检测方法】中的步骤B(PCR扩增系统的准备)和C(待检
测DNA样本的配制)操作过程中应在确认单中逐一标注,以保证“扩增液、反应液、DNA模板和ddH2O”已
准确无误加入至PCR扩增管里。
(6)如发现铝箔袋包装破损,请勿使用;铝箔袋包装内的干燥剂,请勿使用。
(7)试剂使用前,请将反应液、扩增液等瞬时离心。
图二野生型
图三纯合突变
图一阳性及阴性对照
图五无效图
图四杂合突变
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本文发布于:2023-03-17 20:37:56,感谢您对本站的认可!
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