附件4
诺如病毒标本处理和实验室检测技术方案
诺如病毒完整的检测及分型流程包括标本前处理、RNA提取、Real-timeRT-PCR检测、
传统RT-PCR检测、测序和基因分型6个步骤。Real-timeRT-PCR方法灵敏度和准确度高,
是检测诺如病毒的金标准。用传统RT-PCR可对Real-timeRT-PCR阳性标本的PCR产物进行
测序,通过序列分析确定诺如病毒的基因群和基因型。在发生聚集或暴发时,ELISA方法
可作为辅助的手段快速检测诺如病毒抗原。食品、水、环境涂抹样检测方法的灵敏度不稳
定,仅作为参考方法。
一、标本前处理
1.粪便、呕吐物
1.1设备和材料
微量移液器、无菌过滤器、漩涡振荡器、微量离心机、1.5ml无菌离心管、10mMpH值
为7.0—7.4的PBS。
1.2操作方法
(1)离心管每管分装0.5mlPBS。用一次性移液管(或无菌棒)添加豌豆大小的粪便
(约0.1g),稀释成约10%至20%(重量/体积)的粪便悬浮液。当粪便样品是液态时,
不必在PBS中稀释,直接使用500间的样品。
(2)漩涡振荡每个样品1min。在2400g下离心5min,使得固体沉淀。澄清上清液
可以直接用于病毒核酸提取或贮存于—70℃。
(3)取澄清的上清液200同进行RNA提取。
2.水
通过阴离子滤膜过滤水样品。用牛肉膏(1.5%w/v)含0.05M甘氨酸(pH9.0)缓冲液
洗脱附在膜浙大录取分数线 上的病毒。使用Microp100TM或CentriconTMcolumns离心管进一步浓缩洗
脱液。
2.1设备和材料
DEPC水、新配置次氯酸盐(至少1%)或等效消毒剂、MilliporeHAfilter(孔径
0.45um、)、换膜过滤器、真空泵、计时器、PH值酸度计、磁力搅拌器及转子、低温冰箱(-
20℃、-70℃)、Microp100Kcolumns(PALL公司)、CentriprepYM-50(Millipore
公司)、洗脱液(BE-0.05GlypH7.0)、PBS8口7.个人劳务合同范本 2)、离心机、氯仿、丁醇。
2.2操作方法
2.2.1过滤装置准备
(1)使用无菌的镊子将滤膜放在滤器架上,滤膜有3层,型号分别为MilliporeHA
filter、AP15和AP20,放置顺序为MilliporeHAfilter-AP15fAP20。
注意:暴露出滤膜表面使其能与水样接触,请将滤膜光滑表面的那边向下。所有的玻璃
器皿应干净无菌。每批水样使用不同的漏斗。
(2)将滤膜置中,将有刻度的漏斗放在滤器的上边。
(3)使用不锈钢滤器夹进行水的密封。
(4)真空泵连接1000ml的锥形瓶。
注意:为防止气溶胶的污染,应在无菌的环境中过滤,在生物安全柜进行操作。
(5)向滤器中倒入20ml无菌水(DEPC水)检查滤膜的密封情况。
(6)打开泵,调整水的流速至形成缓慢的细流。
2.2.2水样品的过滤
(1)向玻璃漏斗里倒水样,当水样完全滤过立刻关闭真空泵。
(2)用不锈钢的滤器夹,小心移开滤膜上的刻度漏斗。
2.2.3用酸漂洗滤膜
将膜用无菌的镊子夹放在有200ml0.05mMH2
SO
4
(PH3.0)的无菌500ml烧杯中进行漂洗滤膜
去除Mg2+。
2.2.4洗脱
(1)将膜夹出放在无菌的60mm培养皿中,加5ml洗脱液。盖上铝箔。
注意:要将滤膜的上边向下(倒置)放在锥形瓶里。
(2)将锥形瓶放在恒温摇床上,转速0.01g(45rpm),室温(23℃3℃),
15min。
(3)关闭摇床,将洗脱液(大约5ml)转移到管子里。
2.2.5中和洗脱液
用1NHCl或1NNaOH调整洗脱液的pH至U7.0—7.4。检测前,洗脱液在一70℃
储藏。
2.2.6二次浓缩
方法一:用Microp100Kcolumns或CentriprepYM-50浓缩病毒
(1)为防止病毒的附着,先用无病毒粒子的洗脱液浸湿过滤器。
(2)将水标本滤膜洗脱液(大约5山1)加入到浓缩柱中,24008离心5min。
(3)吸取浓缩液(约150间),转移至1.5山1离心管中。
方法二:PEG沉淀
(1)向标本洗脱液中加入NaCl终浓度是0.3mol/L(若洗脱液为5ml加0.08775g的
NaCl),有助于病毒的沉淀,再等量加入PEG-6000终浓度为亲爱的的英文 12.5%(w/v)(若洗脱液为5ml,加
0.0625g的PEG-6000。4℃过夜。
(2)4℃,96008离心30min,收集沉淀;
(3)MilliporeHAfilter,倾倒并弃掉上清液。每个离心管添加150—500同
pH7.2(0.2)PBS重悬沉淀物。将离心管放置在离心管架上,为更好的让缓冲液与沉淀物接
触,将离心管架成一定角度放置。室温放置30min。
注意:如果沉淀物没有溶解,可用缓冲液反复的轻轻吹打沉淀物。吹打过力会产生气泡。
(4)向悬液中加入等体积的氯仿/丁醇(1:1vol/vol)混合。去除病毒悬液中的抑制剂。
(5)4℃,96008,离心20min。
(6)分离出水相(上清液),—80℃储藏。
(7)取200间上清液进行核酸提取。
3.环境涂抹样
将棉签在PBS里蘸湿,用力涂抹待测表面(最大面积100cm2)后,立即浸入核酸提取试
剂盒裂解缓冲液中,将棉签用力压EP管的侧壁,释放棉签中的液体。重复浸入和压侧壁的
步骤3~4次,确保病毒最大释放量,直接进入核酸提取步骤。
4.食品
4.1贝类
4.1.1设备和材料:诺如病毒质控样(中国食品药品检定研究院)、高速离心机(可离心
15ml〜50ml体积)、台式离心机、碎花制冰机、生物安全柜、实时荧光定量PCR检测系统、
眼科剪、眼科镊、一次性无菌培养皿、恒温摇床、高压灭菌器、电磨均质器(LX134MO)、一
次性研磨杵(上海生工)、15ml去RNAa离心管、1.5ml去
RNAaEppendorf管、20同、200同、1000间微量移液器、PBS溶液pH7.2(Gebico)、
蛋白酶K(PCR级Roche)。
采集贝类样品,进行解剖,剪取消化腺和肠道后均质,最后提取RNA。
4.1.3解剖方法
5个贝类个体作为一件样品,分别解剖,取其消化腺和肠道,用于检测。如果一件样品
的消化腺和肠道的总质量不够2.0g,应适当增加取样量,使得每件样品检验的总质量达到
2.0g。
(1)牡蛎的解剖方法
使用灭菌的刀具将牡蛎壳撬开,使用灭菌的眼科剪和眼科镊,先将牡蛎的内脏部分剪取
下来放到一个灭菌的平皿里,沿肠道将牡蛎软体部分剪开,暴露出肠道和消化腺,将多余的
组织去掉,取其消化腺和肠道用于检测。牡蛎的解刨过程及解剖结构见
(2)海虹
用灭菌刀具将双壳撬开,将消化腺用镊子直接夹下,同时尽量将肠道取下。由于海虹的
消化腺相对牡蛎较小,所以需要增加取样的海虹个体数,以使得总质量达到2.0g,用于后
续的检测。
(3)扇贝、毛蚶与文蛤
扇贝与毛蚶的解剖结构与海虹相似,参照海虹的方法将壳打开后,直接判断消化腺所处
的位置,用眼科镊和眼科剪,将其消化腺和肠道取下用于诺如病毒的检测。文蛤的消化腺包
在内脏团里,在解剖时可以直接用镊子在内脏团消化腺位置撕开,将消化腺取下,同时将肠
道取出,用于检测,文蛤的消化腺体积较小,需要适当增加取样量以满足检验的要求。
4.1.4均质
将上述解剖下的消化腺和肠道放到50ml灭菌的小烧杯内,用电磨均质器(LX134MO)
将消化腺仔细打碎,成糊状。
4.1.5蛋白酶K消化
将上述均质的消化腺,分别称取2.00.18,加入15ml的离心管,然后每管加入2ml
的PBS溶液,加入20mg/ml蛋白酶K(Roche)溶液10间进行消化,另外取1件样品加
入诺如病毒的阳性质控球,作为外部质控阳性对照。
4.1.6将上述样品于摇床37℃,0.57g(320rpm)振荡1h。恒温水浴60℃,保持15min;
将15ml离心管,3000g离心5min,取200间用于RNA的提取,剩余部分冷冻保存,用于复
检。
4.2.1设备和材料
诺如病毒质控样(中国食品药品检定研究院)、恒温振荡器、食品均值器、天平:感量
0.1g、高速低温离心机(4℃,10000g)、5XPEG8000/NaCl溶液(PEG80005002g,
NaCl871g,先用450ml蒸馏水溶解,稍微加热,待溶解后定容至1000ml,121℃,15min
灭菌)、磷酸盐缓冲液(PBSpH7.2)、Tris/甘氨酸/牛肉膏缓冲液(TGBE)(Trisba
12.10.2g,甘氨酸3.80.1g,牛肉膏101.0g,蒸馏水10001ml,121℃,15min灭
菌)、氯仿/正丁醇(1:1体积比)溶液。
4.2.2样品处理程序及方法
(1)取三文鱼样品25g,剪碎后置于带滤网的均质袋中,加人TGBE缓冲液40ml,均
质均匀,于室温60r/min震荡20min。
(2)取滤液至50ml新的离心管中,4℃,100008离心30min。
(3)取上清液(小心避开液体表面的油脂层),加入上清液1/4体积的5XPEG/NaCl溶
液,颠倒60s,4℃,60r/min震荡60min。
(4)将上述溶液于4℃,10000g离心30min,弃去上清液。向沉淀物中加入PBS溶
液700间,震荡重悬。
(5)加入与上述重悬液等体积的氯仿/正丁醇(1:1)溶液,充分振荡,室温孵育5min。
于4℃,100008离心1加油的英语怎么说 5min。
(6)取上层水相液体200间用于提取病毒RNA。
4.3草莓、蓝莓
4.3.1设备和材料
诺如病毒质控样(中国食品药品检定研究院)、PEG8000(Polyethyleneglycol)、
氯化钠(NaCl)、氯化钾(KCl)、碳酸氢钠(NaHCO3)、磷酸二氢钾(KH2PO3)、磷酸氢二
钠(Na2HPO3)、NaOH溶液(5M)、HCl溶液(1M)、纯水(MilliQ系统净化)、氯仿(Methenyl
trichoride)、丁醇(1-Butanol)、牛肉膏(BeefExtract)、甘氨酸(Glycine)、
蛋白酶K(ProteinaK)、果胶酶(PectinafromAspergilusniger,Sigma)、
5XPEG/NaCl缓冲液(PEG80005002g,NaCl8718,先用450ml蒸馏水溶解,稍微加
热,待溶解后定容至1000ml,121℃,15min灭菌)、TGBE缓冲液
(Trisba12.10.2g,甘氨酸3.80.1g,牛肉膏101.0g,蒸馏水10001ml,
121℃,15min灭菌)、DHZ-D型冷冻恒温振荡器、FE20K型酸度计、小型高速离心机、CR22E
型高速冷冻离心机。
4.3.2样品处理程序及方法
(1)取样称取25g草莓(蓝莓)样本放入滤膜均质袋中,加入40mlTGBE缓冲液,
(取一份样本作为阳性对照,可在这步加入诺如病毒的阳性质控球),以及30单位果胶酶
(PectinafromAspergilusniger,Sigma)
(2)样品提取室温振荡孵育10min,测量pH值。若pH<9.0,用NaOH(5M)溶液小心
调节至9.5,再振荡孵育10min。每调节一次pH值后,孵育10min,直至pH>9.0;将流
出液倒至离心管中(必要情况下使用2个离心管),4℃,100008离心30min;上清移至
一新管或瓶,用HCl(1M)调节pH至7.00.5;
(3)样品富集浓缩加入1/4体积的5XPEG/NaCl缓冲液,在4c条件下,于振荡孵育
器孵育60min;4℃,10000g离心30min(必要情况下将液体分装于2只离心管);
弃去上层溶液,4℃,再次100008离心5min以使颗粒紧凑;
弃去上层溶液,用500同PBS重悬沉淀。如果一个样品分两管离心,则用同样体积PBS
依次重悬;
将重悬液移至新的EP管中,加入等体积的氯仿/丁醇溶液,涡旋混匀,室温孵育5min。
4℃,100008离心15山血,小心将水相转移至新管待提取RNA。
4.4生菜和苗芽菜
4.4.1设备和材料
食品均质器(可拆卸、可清洗、可高压灭菌)、电子天平(感量0.01g)、台式离心机
(最高转速15000g)、微型离心机、电热恒温水浴锅(0-100℃)、涡旋振荡器、实时荧
光PCR仪、Roche,LightCycler480。
4.4.2样品处理程序及方法
(1)同一批次的生菜或苗芽菜样品,随机抽取样品数不少于5件,并用灭菌处理的剪
刀剪碎至2.5cmX2.5cmX2.5cm大小的形状,称量25g放入带有滤膜均质袋一侧中,作为
待试样品。另称取200g样品放入50ml离心管中,一80℃保存,留作备样,并做好标记。
(2)向上述均质袋中加入40mlTGBEbuffer,均质器拍打混匀,尼龙扎带封口后,室
温振荡约20min。
(3)将均质袋滤膜一侧液体倾入50ml离心管,4℃条件下10000Xg离心30min。
(4)离心结束后,将上清转移至另一50ml离心管,加入1/4倍体积的5皇菊的功效与作用 XPEG/NaCl溶
液,室温条件振荡60min。
(5)振荡完毕,4℃条件下10000*8离心30min。
(6)离心结束,弃上清,继续4℃条件下10000*8离心5min压实沉淀。
(7)向沉淀加入500同PBS溶液以溶解沉淀。吸取溶解沉淀后的PBS溶液200间转移至
无菌离心管中,作为试样。剩余的溶液分装到离心管中标记作为备样,-80℃冻存。
二、核酸提取
各类样品经前处理后,每个样品分别取200同,下面表格中提供的RNA提取试剂盒供参
考,按试剂盒说明书操作提取RNA。
样品种类试剂盒
粪便或呕吐物QIAGEN病毒核酸提取试剂盒(QIAampviralRNAminikit)或
Geneaid病毒核酸提取试剂盒(ViralNucleicAcidExtractionKit
II)
水和环境标本NucliSENSLysisBuffe用DNucliSENSMagnetic试剂盒(梅里埃公司)
食品标本HighPureViralRNAKit(罗氏公司)
三、诺如病毒核酸检测方法
1.方法:(1)样本类型:粪便、呕吐物、肛拭子、水、环境涂抹样;(2)分析方法:采
用诺如病毒双重Real-time(TaqMan)RT-PCR分析:(3)使用范围:ABI7500realtime
PCR、Smartcycler(Cepheid),Mx3005P,Mx3000P(Stratagene)和ICycleriQTMReal-
TimePCR检测系统(BioRad)等。
本设计应用QuantiTectMultiplexRT-PCRKits(Qiagen),引物和探针浓度分别被优
化为终浓度400nM和200nM。每个试剂盒特异的RT最适环境和活化步骤,需要遵循制怎样去胃火除口臭 造
说明书使用。该试验方法来自美国CDC诺如病毒暴发网络(CaliciNet验人)双重Real-
timeRT-PCR操作标准,引物设计参考文献[59]。
2.设备和材料
涡流混合器、微量离心机、移液器(量程为P20、P200和P1000)、Real-timePCR仪可
以是ABI7500(ABI)、Smartcycler(Cepheid)、Mx3005PorMx3000P(Strategene)或
BioRadiCycleriQTMReal-TimePCR检测系统(BioRad)。一次性手套、带滤芯枪头、无菌
1.5ml微量离心管、RNA酶去除剂、96-孔反应板、盖子或薄膜。
3.诺如病毒寡核苷酸引物/探针
表1多重荧光定量RT-PCR扩增诺如病毒的引物和探针
基因型
引物/
探针
序列(5’-3’)工作浓度nM)
Cog1FCGYTGGATGCGITTYCATGA400
GI
Cog1RCTTAGACGCCATCATCATTYAC400
Ring1AFAM-AGATYGCGATCYCCTGTCCA-BHQa200
Ring1BFAM-AGATCGCGGTCTCCTGTCCA-BHQa200
Cog2FCARGARBCNATGTTYAGRTGGATGAG400
GIICog2RTCGACGCCATCTTCATTCACA400
Ring2
JOE-TGGGAGGGCGATCGCAATCT-
BHQb
200
注:aGITaqMan探针:5'端用FAM荧光素标记,3'端用BHQ淬灭基团标记;BHQ淬灭基
团1更好;bGIITaqMan探针:5'端用JOE(HEX或VIC等)荧光素标记,3'端用BHQ淬灭基
团标记
4.操作方法
(1)实验准备
用RNA酶去除剂擦拭工作台表面、移液器和离心机除去潜在的RNA酶污染。Realtime
PCR仪开机预热15min。
(2)试剂准备
所有试剂冰浴;轻弹管壁混合2XQuantiTectMultiplexRT-PCRMasterMix反应液;
涡旋所有引物和探针5s;
QuantiTectMultiplexRTMix、引物、探针置于冰上。
(3)对照设立
每一次实验都要包括无模板对照(NC)(第一个和最后一个孔各设一个)和阳性对照(PC)
(GI和GII诺如病毒核酸或标准品)。
(4)检测
注意:请在PCR清洁区准备、配制反应体系(mastermix)。
①在1.5山1离心管中准备mastermix;
②确定每次分析的反应数(N),需要多配反应数来弥补重复移液中的小量丢失:
如果样本数(n)(包括NC和VC对照)=1-14,做n+1个反应的mix。
如果样本数(n)(包括NC和VC对照)>15,做n+2个反应的mix。
③配制Real-timeRT-PCR反应混合液22.5同(表2)
表2诺如病毒双重反应体系配制方案
组成成分体积(闻)终浓度(nM)
RNa-freewater4.25
Cog1F(10uM)1400
Cog1R(10uM)1400
Ring1A(10uM)0.5200
Ring1B(10uM)0.5200
Cog2F(10uM)1400
Cog2R(10uM)1400
Ring2(10uM)0.5200
RNa-freewater4.25
QuantiTectMultiplexRTMix0.25
2XQuantiTectMultiplexRT-PCRMaster
12.51X
Mix
④吸打混匀MasterMix。
⑤按如下方式排列阴性对照、阳性对照和样品,在每孔中加入22.5同MasterMix。
11iT-
ANCS1S2S3S4S5S6S7S8NCPCPC"
(GI)(GII)
B
C
*阴性模板对照(NC)加入第一列,样本加入后面的11列,检查加入样本时可能的交叉污
染。病毒模板对照(PC在所有样本和NC密封后加入到最后。
⑥加入2.5同DEPC水到第一个NC孔,盖好。
⑦将反应平板转移到核酸处理区域或清洁区外面。
⑧将RNA样本从一70C冰箱转移在冰上融化;漩涡振荡5s之后快速离心5s,移液
2.5同RNA样本到标记好的孔。例如,加样本1(S1)到平板位置A2和B2。如果样本体积小
于2.5同,加DEPC水至反应管使总反应体积达到25间。
⑨加2.5用水到最后的NC孔,盖好。
⑩最后,移液GI和GII诺如病毒阳性对照各2.5同到适当的PC孔,盖好。
⑪小心混合平板。
⑫4℃离心平板0.02g(500rpm)1min,以移除孔中可能存在的气泡和液滴。
⑬RT-PCR扩增条件:按照ABI7500(orotherplatform)的说明书放置好平板。终反
应体积为25同。根据QuantiTectMultiplexRT-PCRKits说明书,RT-PCR热循环程序
为:
循环数温度(℃)时间
1
5020min
19515min
459445S
6045S
5.结果解释
(1)阴性对照(NC)
如果一个或更多NC反应出现假阳性,则可能发生了污染。这种情况下,检测无效,需重
复检测。
(2)阳性对照(PC)
阳性对照产生超过阈值的荧光曲线或扩增图像。
(3)检测样本
只有在所有质量控制严格准确时,如果曲线在Ct值为W40,则认为检测样本为阳性。
四、诺如病毒传统RT-PCR分析
原理:人诺如病毒分为5个基因组(Genogroup,G),其中GI、GII和GIV型可感染人。
本方案利用衣壳蛋白的部分区域(regionC)来对诺如病毒进行分型。本方案由四个引物组
成,扩增ORF2的5'末端,编码主要外壳蛋白VP1。引物G1SKF和G1SKR用于GI的检测,扩
增片段330bp。引物和CoG2F和G2SKR用于GII的监测,扩增片段387bp。
1.设备与材料
涡流混合器、微量离心机、移液器、PCR仪、微波炉、电泳仪和制胶器。一次性手套、
带滤芯枪头、无菌1.5ml微量离心管、RNA酶去除剂、薄壁PCR管(Rnafree,0.5ml)、
LoadingBuffer、QiangenOneStepRT-PCRKit(货号:210212)
2.诺如病毒寡核苷酸引物/探针(见表3)
表3诺如病毒传统RT-PCR寡核苷酸引物
Region型别引物名称序列(5'-3')产物(bp)
G1SKF(+)CTGCCCGAATTYGTAAATGA
I330
CG1SKR(+)CCAACCCARCCATTRTACA
COG2F(+)CARGARBCNATGTTYAGRTGGATGAG
II387
G2SKR(-)CCRCCNGCATRHCCRTTRTACAT
3.操作方法
(1)实验准备
用RNA酶去除剂擦拭工作台表面、移液管和离心机以去掉潜在的RNA酶污染。
(2)试剂准备
①所有试剂冰浴。
②轻弹管壁混合5X缓冲液。
③离心酶、RNA酶抑制剂和dNTPs后将其放在冰上备用
④涡旋所有引物5$,离心5s备用。
(3)对照设立
每次PCR实验都应设置阴性对照和阳性对照,包括诺如病第1和GII,阳性对照为阳性
粪便样品。
(4)检测
注意:在PCR清洁区配置反应体系。
①用1.5山1离心管准备反应体系;
②确定每次分析的反应数(N),在操作需配置过量的反应体系来校正重复移液中的小
量丢失;见下面的样本:
♦如果样本数(n)(包括NC和VC对照)=1-14,做n+1个反应的mix。
♦如果样本数(n)(包括NC和VC对照)>15,做n+2个反应的mix。
③将每个引物对按以下计算量添加到反应混合液中(表4和5):
表4诺如病毒RegionC反应体系—GenogroupI
成分体积/反应(同)最终浓度
5XRT-PCRBuffer51x
dNTPmix1
Enzymemix1
GISKF(50uM)0.25500nM
GISKR(50uM)0.25500nM
RnaInhibitor(30-40U/
0.50
同)
Rna-freewater12
反应体系总体积20
表5诺如病毒RegionC反应体系—GenogroupII
成分体积/反应(同)最终浓度
5xRT—PCRBuffer51x
dNTPmix1
Enzymemix1
COG2F(50uM)0.25500nM
GIISKR(50uM)0.25500nM
RnaInhibitor(30—40U/
0.50
同)
Rna—freewater12
反应体系总体积20
④用移液管上下吹打混合液;
⑤向每个反应管中分装20间混合液;
⑥设立阴性对照,加5同DEPC水;
⑦将反应管转移到核酸处理区;
⑧将病毒核酸在冰上融化,漩涡振荡5s之后快速离心5$;
⑨移取5同的RNA模板到每一个相应的反应管中;
⑩最后加5间阳性对照;
⑪将所有的反应管放置在PCR仪上,按照下面的条件设置:
循环数时间温度℃
130min42
115min95
30c95
4030c50
30c72
110min72
⑫准备2%的琼脂糖凝胶,进行核酸电泳。
(5)解释
如果阴性对照出现条带,说明可能出现污染,需重复实验。阳性对照在正确位置出现
条带,则判定反应体系工作正常。
五、食品诺如病毒荧光定量PCR(使用罗氏LightMixKitNorovirusGGI,GG
II,MS2或等效的诺如病毒检测试剂盒)
1.反应体系及仪器设置
反应体系的添加按下表:
表6诺如病毒定量PCR体系
试剂1个反应(同)10个反应(同)
PCR水4.347
Activator激活剂1.314.3
引物和探针111
内对照111
预混液7.481.4
模板5
总体积20165
具体的仪器设置为检测信号通道FAM通道465~510nm,内参信号ROX通道533~610
nm,做分型的03670通道498~660nm,反应具体参数设置如下:
(1)逆转录61℃,3min;
(2)预变性95℃,30s;
(3)PCR循环,95℃10s,56℃10s收集信号,72℃5s,45个循环;
(4)溶解曲线,95℃30s,40℃2min,85℃1s收集信号。
2.诺如病毒荧光定量PCR结果判读
实验结束后,分析结果,具体分析标准按下表进行。
表7诺如病毒结果判读
FAM
(510nm)
Rox(610nm)熔解曲线(660nm)
阴性
对照
结果判读
有扩增有无扩增均可无信号无扩增GI型
有扩增有无扩增均可熔解峰在50~60℃无扩增GII型
无扩增有扩增无信号无扩增阴性
无扩增无扩增无信号无扩增
PCR抑制
有扩增有扩增有无信号均可有扩增污染
在食品类的诺如病毒检测方法中,通过诺如病毒质控样的加入作为外部质控以判断
RNA的提取过程是否正常;同时在RT-PCR过程中还含有ROX荧光通道检测内部质控噬菌体
pMS2,用以判断在PCR过程中是否含有PCR抑制物质,如含有抑制物质扩增过程为阴性或扩
增效率不高,正常则扩增为阳性。该试剂盒还含有与GII产物结合的探针,用以区分诺如
病毒的型别。如果扩增的结果为GII,则可以检测到探针信号,如果为GI型则无信号。可
以根据上表来对诺如病毒的检测结果进行判断。
六、诺如病毒ELISA检测方法(粪便、呕吐物)
1.操作步骤(RIDASCREENNorovirus3rdGeneration):
(1)将两滴(100间)阳性质控液Control”标本稀释液Dilut嬴一|(阴性质控液)
和10%便悬液上清加入为微孔中。
(2)再分别加入2滴(100间)生物素标记抗体标记物1Conjugate1,在充分混匀
(轻轻振动微孔板边缘)后,室温(20~25℃)孵育60min。
(3)每孔加入300间洗液,洗5次,在吸水纸上拍干。
(4)微孔中加入2滴(100同)酶结合物标记物2|"Conjugate2,室温20~25℃孵育30
min。
(5)每孔加入300间洗液,洗5次,在吸水纸上拍干。
(6)在每个孔中加入2滴(100间)的底物Substrate。然后微孔板在室温
(20〜25℃)下避光孵育15min。在每个微孔中加入1滴(50同)终止液StOp"|以终止反
应。轻微混合后(轻拍微孔板的边缘),用酶标仪测定在450nm的光波下测定吸光度。
(7)结果判定:将阴性质控所得吸光度值加上0.15即为Cut-off值。样本吸光度值大
于Cut-off值10%视为阳性。样本吸光度值处于上述Cut-off值土10%范围视为可
疑,应重复检测。重复测试新鲜粪便样本,结果仍在此区域,则视为阴性。样本吸光度值
小于上述Cut-off值+10%视为阴性。
阴性样品还需按本指南“3.1.1诺如病毒双重Real-time(TaqMan)RT-PCR分析”检
测确认。
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