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  • 第2代DNA测序技术在肝癌研究中的应用进展
    DOI:10.7683/xxyxyxb.2021.02.021收稿日期:2020-08-09基金项目:国家自然科学基金资助项目(编号:81974442);广东省医学科学技术研究基金资助项目(编号:A2018028);广州市科技计划项目(编号:201804010025)。作者简介:焦 扬(1995-),男,河南新乡人,硕士研究生在读,研究方向:肝癌侵袭转移分子机制研究及治疗靶点的筛查。通信作者:吴 
    时间:2023-08-11  热度:29℃
  • 运用二代测序技术拆分混合STR分型
    羊水指数正常范围刑事技术2021年 第46卷 第1期·经验交流·运用二代测序技术拆分混合STR分型吴玉剑1,方 慧1,刘翠兰1,韦 甜2(1.武汉公安司法鉴定中心,武汉430024;2. 赛默飞世尔科技〔中国〕有限公司,上海 200053)摘  要:目的 探讨二代测序技术在混合STR 分型拆分中的应用。方法 对一例强制猥亵妇女案中受害人颈部的拭子和血样作DNA 提取,以Precision
    时间:2023-08-02  热度:22℃
  • TCGA数据挖掘入门---什么是TCGA?TCGA中有哪些数据?
    TCGA数据挖掘⼊门---什么是TCGA?TCGA中有哪些数据?1. 什么是TCGA?TCGA中有哪些数据?车水马龙党员自我鉴定TCGA的全称是The Cancer Genome Atlas, 这个项⽬始于2005年,它旨在使⽤基因测序和⽣物信息学编⽬与癌症有关的基因突变。TCGA通过利⽤⾼通量基因组分析技术,来帮助我们更好地理解癌症的遗传学基础,从⽽提升我们对于癌症的诊断能⼒和对癌症的治疗、预防
    时间:2023-07-28  热度:44℃
  • 蛋白质组测序和磷酸化组测序
    蛋白质组测序和磷酸化组测序1. 背景介绍蛋白质是生物体内的基本结构和功能单位,对于维持生命活动至关重要。蛋白质组测序是研究蛋白质组成、结构和功能的重要手段,而磷酸化则是调控蛋白质功能的一种常见的修饰方式。2. 蛋白质组测序2.1 基本原理蛋白质组测序是指对生物样品中的所有蛋白质进行系统性的分析和识别。其基本原理包括以下几个步骤:•样品制备:从生物样品中提取蛋白质,并进行预处理,如去除杂质、富集目标
    时间:2023-07-26  热度:14℃
  • 基因芯片大攻略
    基因芯片大攻略基因芯片按应用领域主要分以下几类,用于基因组研究的SNP和CNV芯片;用于mRNA表达研究的基因表达谱芯片;用于转录调控研究的microRNA芯片和LncRNA芯片;以及用于表观遗传研究的DNA甲基化芯片。目前世界上主流的芯片制造商主要有4几家,分别是采用第二代基因芯片技术的美国affymetrix公司、美国agilent公司和ROCH nimblegen公司,以及采用第三代基因芯片
    时间:2023-07-25  热度:16℃
  • 转录组测序
    转录组测序今天我们来学习一些关于转录组测序的知识,从转录组的一些基本概念开始。第一章Intron:内含子,间隔存在于真核生物细胞DNA中的序列,转录时存在于前体mRNA中,通过剪接过程被去除,最终不存在成熟的mRNA中。Exon:外显子,真核生物DNA中的序列,与Intron对应,序列在剪接过程中不被去除,最终存在于成熟的mRNA分子中。2013年四级考试答案startedUTR:Untransl
    时间:2023-07-24  热度:21℃
  • 常用生物信息学格式介绍(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3。。。
    雅思费常⽤⽣物信息学格式介绍(fasta、fastq、gff2、gtf(gff2.5)、gff3。。。前⾔在各个⾏业都是有⾏业标准的,这样才能统⼀规范⽽⽅便后⾯的分析,在⽣物信息学领域中主要是各种⼤量序列数据、注释数据等,这些都是有特定的格式去表⽰,下⾯列举⼏种常见的格式。了解这些是进⾏后续⽣物信息学分析的必备知识,有些⼈虽说是在做⽣物信息学分析,但是到现在可能还不知道什么是GFF3格式等。fas
    时间:2023-07-24  热度:34℃
  • 测序常用名词解释整理
    高通量测序领域常用名词解释大全什么是高通量测序?高通量测序技术(High-throughput quencing,HTS)是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变, 一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术我的快乐英文(next generation quencing,NGS )足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转
    时间:2023-07-24  热度:28℃
  • RNA-Seq项目常见问题与解答知识讲解
    RNA-Seq项⽬常见问题与解答知识讲解R N A-S e q项⽬常见问题与解答RNA-Seq项⽬常见问题与解答这两年随着测序成本的下降和转录组研究的⽇渐⽕热,RNA-q俨然已经成为了分⼦⽣物学课题组推进项⽬的⾸选⽅向。在我们接触的转录组项⽬中,有些⽼师对项⽬分析结果存在或多或少不清楚或有疑惑的地⽅。那么春天来了,花⼉开了,今天福利也到了,我们特意将转录组项⽬中常见的⼀些问题进⾏了汇总,各位⽼
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  • fpkm值名词解释
    rerved什么意思啊fpkm值名词解释免费英文简历模板温馨提示:文档内容仅供参考hammered郑州少儿培训机构cielFPKM(Fragments Per Kiloba of transcript per Million mapped reads)是一种用于衡量RNA-Seq数据中基因表达量的单位。它考虑了RNA序列的长度和测序深度的影响,使得不同基因在表达量上可以进行比较。紧张的英文
    时间:2023-07-24  热度:103℃
  • 一文读懂泛基因组测序(附赠生信赚钱小方法)
    什么是泛基因组?为什么我们要开展泛基因组测序?技术路线组装技术对⽐应⽤parachute什么意思rasim泛基因组近年来的研究⼼得分享但总体来说,泛基因组都基本可以发到⾄少6分以上甚⾄像最近接近40分的期刊。在通读了最近两篇Nature的⽂章,我根据个⼈经验,总结这两篇⽂章的⼀些亮点(Gordon, Contreras-Moreira et al. 2017, Zhao, Feng et al.
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  • (完整版)测序常用名词解释整理
    高通量测序领域常用名词解释大全什么是高通量测序?高通量测序技术(High-throughput quencing,HTSmom and boy)是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变, 一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation quencing,NGS )足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一
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  • 各种测序基础知识介绍-转发
    各种测序基础知识介绍-转发各种测序基础知识介绍RNA-Seq名词解释index 测序的标签,⽤于测定混合样本,通过每个样本添加的不同标签进⾏数据区分,鉴别测序样品。碱基质量值 (Quality Score或Q-score)是碱基识别(Ba Calling)出错的概率的整数映射。碱基质量值越⾼表明碱基识别越可靠,碱基测错的可能性越⼩。Q30 碱基质量值为Q30代表碱基的精确度在99.9%。FPK
    时间:2023-07-24  热度:17℃
  • fastq、fasta、bed、gtf、gff、sam、bam生信分析常见文件格式查看
    fastq、fasta、bed、gtf、gff、sam、bam⽣信分析常见⽂件格式查看⽣信分析过程中的⽂件格式:除了原始测序数据fastq、fasta之外,还有基因组⽂件fasta格式,基因注释⽂件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间⽂件的⽣成,如bed、bed12、sam、bam、wig、bigwig、bedgraph等。1.测序数据FASTQ⽂件1)⽂件⽤途:测序返回的⼀般数据格式。通常是
    时间:2023-07-24  热度:33℃
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    技术单细胞转录组测序之10xGenomics进出口贸易流程10X Genomics platform10X Genomics 是⼀个综合的单细胞测序技术平台,可以应⽤于多种单细胞测序上,包括Single cell gene expression, Single cell Immune Profiling, Single cell CNV, Single cell ATAC。这篇⽂章将主要简述10X
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