英语口语班培训价格10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之识别肿瘤细胞的CNV分
什么是iis什么是幸福感析原理
关于圣诞节的歌曲hello，⼤家好，今天我们来总结单细胞数据识别肿瘤细胞的分析原理。其中单细胞识别肿瘤细胞最⼤的问题在于，reference，什么细胞作为reference，上⽪细胞癌变，⾃然是正常的上⽪细胞作为reference，但很多时候，光依靠单细胞数据我们我们⽆法区分恶性和⾮恶性的细胞类型，CNV判断也需要很精准的⼈为监督和数据分析，这⼀次，我们来分析⼀下识别恶性细胞的分析原理。
这⾥要注意啊，⼀定要使⽤配套的单细胞数据，确保其中含有恶性的细胞类型，不然光有正常的细胞类型也能分析出结果，拿到的结果是没有任何⽤处的。
⼤家推断CNV应该⽤的是inferCNV或者copycat，原理都差不多。个⼈倾向于copycat。
CNV Estimation：Initial CNVs (CNV ) were estimated by sorting the analyzed genes by their chromosomal location and applying a moving average to the relative expression values, with a sliding window of 100 genes within each chromosome , 这⾥⼤家应该都知道才对。我们逐步解读。
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第⼀步：T o av oid cons id e r ab le im p act of any p ar ticular g e ne on the m ov ing
av e r ag e , we lim ite d the r e lativ e e x p r e s s ion v alue s to [-3,3] b y r e p lacing all v alue s ab ov e 3 b y a ce iling of 3, and r e p lacing v alue s b e low -3 b y a f loor of -3.（这⾥不知道⼤家知道多少，对数据进⾏剪接，这是必要的）T his was p e r f or m e d only in the conte x t of C NV e s tim ation。
第⼆步：We s cor e d e ach ce ll f or the e x te nt of C NV s ig nal, d e f ine d as the m e an of s q uar e s of C NV v alue s acr os s the g e nom e , and f or the cor r e lation b e twe e n the C NV p r of ile of e ach ce ll with the av e r ag e C NV p r of ile of all ce lls f r om the cor r e s p ond ing tum or.(这个地⽅不陌⽣吧，就是对C NV的判断)。
can you feeling第三步：Putativ e m alig nant ce lls we r e the n d e f ine d as thos e with C NV s ig nal ab ov e 0.05 and C NV cor r e lation ab ov e 0.5, p utativ e non-m alig nant ce lls as thos e b e low the two cutof f s , and unr e s olv e d ce lls as thos e ab ov e only one of the thr e s hold s.（跟inf e r C NV的软件阈值是⼀致的）.
第四步：检验，T his initial analys is was b as e d on the av e r ag e C NV of all ce lls as a r e f e r e nce , which is b ias e d d ue to the inclus ion of m any m alig nant ce lls. We thus r e d e f ine d C NV e s tim ations , the C NV s ig nal, and C NV cor r e lations v alue s us ing the av e r a
laminate flooring
g e p atte r ns of nonm alig nant ce lls as a r e f e r e nce.（真正的r e f 必然是相同细胞类型的正常细胞）。
preamplifier
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性别 英语第五步：C NV e s tim ate ：
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当然，inf e r C NV软件还有⼀步降噪，⼤家感兴趣可以多多看看，总结归纳。
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女士英文
基础知识，多多学习，⽣活很好，有你更好
