或译DNA定序)是指分析特定DNA片段的碱基序列

更新时间:2023-06-25 12:17:21 阅读: 评论:0

DNA定序
DNA测序DNA quencing,或译DNA定序)是指分析特定DNA片段的碱基序列,也就是腺嘌呤A)、胸腺嘧啶T)、胞嘧啶C)与鸟嘌呤的(G)排列方式。RNA测序则通常将RNA提取后,反转录为DNA后使用DNA测序的方法进行测序。目前应用最广泛的是由Frederick Sanger发明的Sanger双脱氧链终止法(Chain Termination Method)。新的测序方法,例如454生物科学的方法和焦磷酸测序法。
Sanger测序法
Sanger(桑格)双脱氧链终止法是Sanger1975年发明的。测序过程需要先做一个PCR反应。PCR过程中,双脱氧核糖核酸可能随机的被加入到正在合成中的DNA片段里。由于双脱氧核糖核酸多脱了一个氧原子,一旦它被加入到DNA链上,这个DNA链就不能继续增加长度。最终的结果是获得所有可能获得的、不同长度的DNA片段。目前最普遍最先进的方法,是将双脱氧核糖核酸进行不同荧光标记。将PCR反应获得的总DNA通过毛细管电泳分离,跑到最末端的DNA就可以在激光的作用下发出荧光。由于ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP4种双脱氧核糖核酸)荧光标记不同,计算机可以自动根据颜色判断该位置上碱基究竟是AT
GC中的哪一个。
454生物科学和焦磷酸测序法
454测序法由454生物科学发明,是一个类似焦磷酸测序法的新方法。2003年向GenBank提交了一个腺病毒全序列,使得他们的技术成为Sanger测序法后第一个被用来测生物基因组全序列的新方法。454使用类似于焦磷酸测序的方法,有着相当高的读取速度,大约为5小时可以测两千万碱基对。
已测序的生物指其基因组已经被完全测序生物。其中部分生物的DNA序列已经被完全注释,功能性的片段(如基因等)已作图

借助於基因组研究及高通量处理等技术,越来越多的生物的全部基因被人们获得。自从1995年以来已经有150muchmoremen个基因组被解密,将近每个星期有新的物种添加进来。
已测序的生物列表
下表是目前爲止已经被相当完全测序的生物。
古菌
Aeropyrum perni' - Archaea aus japanischen Thermalquellen
Archaeoglobus fulgidublastfurnace>广州卡耐基' - Schwefel-Archaea
Halobacterium spec' - Archaea aus Salzen
Methanobacterium thermoautotrophicu' - Methanproduzierender Archaea
Methanococcoides burtoni' - k?ltetolerante und aerobe Archaea aus dem Ace Lake, Antarktis
Methanococcus jannaschi' - Tiefearchaea an Black Smokern
Methanococcus maripalud' - Archaea aus Salzen in Georgia
Methanogenium frigidu' - k?ltetolerante und aerobe Archaea aus dem Ace Lake, Antarktis
Methanopyrus kandler' - Tiefearchaea an Black Smokern
Methanosarcina acetivoran' - Archaea aus ?lquellen, Kuhm?gen u. a.
Methanosarcina maze' - Archaea mit der F?higkeit Acetat u. a. abzubauen
[equitans' - Archaea an hei?en Quellen, Parasit anderer Mikroorganismen
Pyrobaculum aerophilu' - Archaea aus hei?en Quellen
Pyrococcus abyss' - Tiefearchaea an Black Smokern
Pyrococcus furiosu' - Tiefearchaea an Black Smokern
Pyrococcus horikoshi' - Tiefearchaea an Black Smokern
Pyrolobus fumari' - Tiefearchaea an Black Smokern
Sulfolobus solfataricu' - Archaea aus hei?en Schwefelquellen
Sulfolobus tokodai' - Archaea aus hei?en Schwefelquellen disappointing
Thermoplasma acidophilu' - hr s?ureliebender Archaea, reinigt Bergwerkshalden u. a.
Thermoplasma volcaniu' - w?rmeliebender Archaea
细菌
[tumefaciens' - Pflanzenpathogenes Bakterium, tumorbildend
Aquifex aeolicu' - Hyperthermophiles Meeresbakterium
[anthracis' - Anthrax-Erreger
[cereus' - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
Bacillus haloduran' - Enzymproduzierendes Bakterium (Industriell genutzt)
[subtilis' - Enzymproduzierendes Bakterium (Industriell genutzt)
Bacteroides thetaiotaomicro' - Darmbakterium
Bifidobacterium longu' - Darmbakterium
signal
Blochmannia floridanu' - Bakterium in Symbio mit Ernteamein
[bronchiptica' - Erreger chronischer Infektionen der Atemwege
2013上海高考英语[parapertussis' - Erreger von mildem Keuchhusten
[pertussis' - Erreger von Keuchhusten
Borrelia burgdorfer' - Borrelio-Erreger
Bradyrhizobium japonicu' - Kn?llchenbakterium der Sojabohne
[melitensis' - Erreger des Maltafiebers
Brucella sui粗拙' - potentielle Biowaffe der USA, wirkt abtreibend
Buchnera aphidicol' - Bakterium in Symbio mit Blattl?un
Burkholderia malle' - Erreger des Rotzes bei Huftieren, auch humanpathogen (Einsatz als Biowaffe)
星期二英文∙ Burkholderia pudomalle' - Erreger der Melioido, vor allem in Südostasien
[jejuni' - Erreger einer Lebensmittelvergiftung
Caulobacter crescentu' - Sü?wasrbakterium
Chlamydia muridaru' - Atemwegsinfektionen bei Maus und Meerschweinchen
Chlamydophila cavia' - Augenentzündungen bei Meerschweinchen
Chlamydia trachomati' - Erreger der Harnr?hrenentzündung
[pneumoniae' - Erreger einer Bronchitis
Chlorobium tepidu' - Grünes Schwefelbakterium
Chromobacterium violaceu' - humanpathogenes Bakterium (Diarrhoe und andere Erkrankungen)
Clostridium acetobutylicu' - Aceton- und Butanol-produzierendes Bakterium
[perfringens' - Erreger Diarrhoe etc.
[tetani' - Tetanus-Erreger
[diphtheriae' - Erreger der Diphtherie
[jeikeium' - nosokomial pathogener Hautbewohner
by chance∙ Corynebacterium efficien' - Bakterium zur Produktion von Aminos?uren u. a.
[burnetti' - Erreger des Q-Fieber
Deinococcus radioduran' - extrem strahlungstolerantes Bakterium
Desulfotalea psychrophil' - extrem k?ltetolerantes Bakterium des arktischen Eismeeres

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