对虾偷死野田村病毒(CMNV) RT-PCR 检测方法的建立
作者:张达云
来源:《农家致富顾问·下半月》2016年第03期
postcrossing 摘要:参考 GenBank 中对虾偷死野田村病毒(Covert mortality nodavirus, CMNV)的基因序列,应用 Primer Premier5.0 软件设计了一对引物,建立了适合CMNV快速检测的RT-PCR检测方法。以该方法对实验室分离并保存的CMNV cDNA简繁翻译片段为模板进行PCR扩增,得到了预期大小为210bp的目的片段。将扩增所得的DNA片段进行克隆测序,测序结果与GenBank中的CMNV的相应序列比对分析,确定为CMNV的基因序列。以对虾常见IHHNV(传染性皮下及造血组织坏死病毒)、WSSV(对虾白斑综合症病毒)、TSV(桃拉病毒)、YHV(黄头病毒)等病毒核酸片段为模板,用设计的引物进行PCR,结果均为阴性。该方法敏感性检测结果表明,最低RNA模板检出量为2pg。表明所建立的RT-PCR检测技术具有特异、快速和敏感的特点,可用于对虾CMNV的快速检测。
拉丁语名字关键词: 虾 ; 病毒 ;检测方法
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
从宁波市多个南美白对虾育苗场分别采集10日龄虾苗幼体1000尾左右,95%酒精保存,CMNV、IHHNV(传染性皮下及造血组织坏死病毒)、mobile phoneWSSV(对虾白斑综合症病毒)、TSV(桃拉病毒)、YHV(黄头病毒)阳性样品为本实验室的保存样品。上海生工的“柱式动物组织总RNA抽提纯化试剂盒”和“胶回收纯化试剂盒”、康为世纪“HiFiScript cDNA 第一链合成试剂盒”、 行尸走肉第六季什么时候出康为世纪“2×Taq MasterMix”。
1.2 病毒RNA提取
根据上海生工的柱式动物组织总RNA抽提纯化试剂盒,操作如下:
将阳性虾苗用RNa-free研磨器研磨匀浆后,取25-50mg匀浆产物加入1.5ml RNa-free离心管中,加入450μl Buffer Rlysis-AG,立即震荡混匀,室温放置3min;12,000rpm,4℃表语是什么离心3min,将上清移至新的1.5ml RNa-free我的好朋友英语作文离心管中,加入1/2体积无水乙醇,充分混匀后,转移至吸附柱中,静置1min,室温12,000rpm离心1min,倒掉收集管中废液;将吸附柱放回收集管中,加入胸罩英语500μl GT solution,静置1min,室温10,000rpm离
心疯狂英语阅读版1min,倒掉收集管中废液;再加入500μl NT Solution,静置2min,室温10,000rpm离心1min,倒掉收集管中废液;室温12,000rpm空转离心2min;将吸附柱放入新的RNa-free的离心管中,在吸附膜中央加入40μl DEPC处理的水,静置presnter2min,室温12,000rpm离心2min,得到总RNA。