对虾偷死野田村病毒(CMNV) RT-PCR 检测方法的建立

更新时间:2023-06-03 18:16:26 阅读: 评论:0

对虾偷死野田村病毒(CMNV) RT-PCR 检测方法的建立
作者:张达云
来源:《农家致富顾问·下半月》2016年第03
postcrossing        摘要:参考 GenBank 中对虾偷死野田村病毒(Covert mortality nodavirus CMNV)的基因序列,应用 Primer Premier5.0 软件设计了一对引物,建立了适合CMNV快速检测的RT-PCR检测方法。以该方法对实验室分离并保存的CMNV cDNA简繁翻译片段为模板进行PCR扩增,得到了预期大小为210bp的目的片段。将扩增所得的DNA片段进行克隆测序,测序结果与GenBank中的CMNV的相应序列比对分析,确定为CMNV的基因序列。以对虾常见IHHNV(传染性皮下及造血组织坏死病毒)、WSSV(对虾白斑综合症病毒)、TSV(桃拉病毒)、YHV(黄头病毒)等病毒核酸片段为模板,用设计的引物进行PCR,结果均为阴性。该方法敏感性检测结果表明,最低RNA模板检出量为2pg。表明所建立的RT-PCR检测技术具有特异、快速和敏感的特点,可用于对虾CMNV的快速检测。
        拉丁语名字关键词: 病毒 ;检测方法
        1 材料与方法
        1.1 材料与试剂
        从宁波市多个南美白对虾育苗场分别采集10日龄虾苗幼体1000尾左右,95%酒精保存,CMNVIHHNV(传染性皮下及造血组织坏死病毒)、mobile phoneWSSV(对虾白斑综合症病毒)、TSV(桃拉病毒)、YHV(黄头病毒)阳性样品为本实验室的保存样品。上海生工的柱式动物组织总RNA抽提纯化试剂盒胶回收纯化试剂盒、康为世纪“HiFiScript cDNA 第一链合成试剂盒 行尸走肉第六季什么时候出康为世纪“2×Taq MasterMix”
        1.2 病毒RNA提取
        根据上海生工的柱式动物组织总RNA抽提纯化试剂盒,操作如下:
        将阳性虾苗用RNa-free研磨器研磨匀浆后,取25-50mg匀浆产物加入1.5ml RNa-free离心管中,加入450μl Buffer Rlysis-AG,立即震荡混匀,室温放置3min12000rpm4℃表语是什么离心3min,将上清移至新的1.5ml RNa-free我的好朋友英语作文离心管中,加入1/2体积无水乙醇,充分混匀后,转移至吸附柱中,静置1min,室温12000rpm离心1min,倒掉收集管中废液;将吸附柱放回收集管中,加入胸罩英语500μl GT solution,静置1min,室温10000rpm
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