Canoco for Windows 4.5 中文简明教程
2009-9
第一章 CANOCO简介
一 软件功能
Canoco for Windows 是新一代的 CANOCO 软件，是生态学应用软件中用于约束与非约束排序的最流行工具。Canoco for Windows 整合了排序以及回归和排列方法学，以便得到健全的生态数据统计模型。Canoco for Windows 包括线性和曲线单峰方法。使用 Canoco for Windows 进行排序，能够洞察：
expensive的音标
● 生物群落结构
● 植物与动物群落以及它们的环境之间的联系
● 一个对环境和(或)其生物群落的假设冲击所能造成的影响a是什么意思
● 在生物群落上进行的复杂生态学和生态毒理学实验的相关处理所能造成的影响
一个排序被计算出来后，排序图可以立即显示在显示器上。Canoco 具体独特的能力，可以说明用协变
量表示的背景变异，而用它的扩展工具来进行排列测试，包括测试的互动效果。这些独特的特性使得Canoco for Windows 能特别有效的解决应用研究方面的问题。
二 软件模块
The Canoco for Windows软件包主要包含以下几个模块：
● Canoco for Windows：软件包的核心，用来指定要分析的数据和排序模型，排序方法
以及分析结果的查看等基本操作命令均被集中在该模块的对话框中
● WcanoImp：将以电子表格形式（Excel等）保存的外部数据转化为CANOCO识别的
形式
● CanoDraw 4.0 for Windows：用来绘制各种类型的排序图，同时也可以生成多种等值
线和回归模型图，并进一步深层次发掘排序结果，该模块可以直接从主程序界面工
具栏激活
● CanoMerge：合并Canoco识别的dta类型数据文件，并可以将数据文件以带制表分
隔符的文本形式输出（基本常用统计软件均兼容该类型文件），同时该模块具有滤掉
低频率物种的功能
yodao
● PrCoord：对特定数据集进行主坐标分析以及冗余分析布宜诺斯艾利斯大学
三 统计方法
这里只简要阐述CANOCO具有的统计分析方法，不做赘述，后面章节将详细论述操作步骤。主要分析方法有以下四大类型：
A 非约束型排序方法（Unconstrained ordination methods）
英语口语文章
主成分分析（Principal components analysis，PCA）
对应分析（Correspondence analysis，CA）
降趋对应分析（去趋势对应分析）（Detrended correspondence analysis，DCA）
主坐标分析（Principal coordinates analysis，PCoA或PCO）
B 约束性排序方法（Constrained ordination methods）
冗余分析（Redundancy analysis，RDA）
典型对应分析（典范对应分析）（Canonical correspondence analysis，CCA）
降趋典范对应分析（Detrended canonical correspondence analysis，DCCA）
典型变量分析（Canonical variate analysis，CV A）
terrell owensdistance-bad redundancy analysis (db-RDA)
C 非约束性偏分析法（Partial methods of unconstrained ordination）
D 约束性偏分析法（Partial methods of constrained ordination）
partial RDA 、partial CCA 、partial DCCA 、partial CV A
四 软件模块界面介绍
Canoco for Windows模块进入软件后会出现图1-1界面，红色矩形所标记部分为快捷工具栏，鼠标做短暂停留会有英文提示出现，不再赘述。左侧的Project View窗口是数据指定，分类类型选择等一系列功能设置的引导窗口，按步骤操作即可；右边Log View窗口用来记录分析过程和部分统计结果（如四
个排序轴统计结果、轴与环境因子的相关性、蒙特卡罗检验结果等），其他一些分析结果（如物种、环境因子及样方坐标等）均保存在相应的*.sol 文件中，该文件可以用记事本打开。
juniorschool
图1-1 Canoco for Windows模块界面窗口
WCanolmp模块该模块在核心模块中没有快捷激活命令，必须常规方式打开。进入后界面如图1-2，上边红色框标记部分是关于如何使用该模块的简短说明，下面部分是可选框。一般情况下在Excel中组织原数据时，以行代表样方，以列代表变量，这时第一个选择框就不需选择；Excel中组织数据时如果没有将第一行第一列作为样方名行和变量名列，则需要选择第二和第三选择框，这样该模块会自动为导入的数据添加样方名和变量名；最后一个选择框可以不用理会，采用默认的不选择状态。设置完成后点击保存按钮，在弹出的对话框中命名并选择存放位置，即可将剪贴板中的数据文件（从excel中复制的）转化为Canoco能识别的类型（*.dta）。
样方名和变量名命名规则：字符不得超过8个，字符类型可以为数字、字母、点、连接符和空格；超过8位的，在导入数据时Wcanolmp会默认的只保留前八位，并且以点取代不符合规定的字符
图1-2 WCanolmp模块界面
CanoDraw模块此模块可以在核心模块中快速激活（Project>Run CanoDraw），激活后界面如图1-3所示。此模块这里不做介绍，后面章节有详细介绍。
图1-3 CanoDraw模块界面
CanoMerge模块核心模块无快捷激活命令，需常规方式打开。进入后界面如图1-4所示。“Add file”用
例外是什么意思来添加文件，需要合并的文件全部在显示框中排列出来后点击“Merge”按钮，在弹出的对话框中命名并选择存放位置即可。
读mba有用吗对话框下部第一个对话框可以用来滤掉一些低频率的物种，框中数字代表包含某一个物种的样方如果少于X个，该物种将被剔除。
图1-4 CanoMerge模块界面
五 说明
born in the wild
1 本教程只是个人能力范围之内的简明教程，侧重于介绍“是什么”，难免有错误，难免有地方过于“简”使人看后也没有“明”，因此建议遇到具体问题或对“为什么”有强烈需求的人一定要参考相关书籍。
2 CANOCO就像Excel，不但界面人性易上手，最主要的是能深能浅，但问题是我们不一定玩的很转，有多少懂Excel的人敢说自己真正发挥了其数据处理的高效性？所以学习CANOCO也要多练习多总结。
3 目前你所看到的只是一时心血来潮的初稿，内容基本来自于Multivariate Analysis of Ecological Data using CANOCO一书，才疏学浅，至今原版书还有内容尚未看懂，欢迎交流促进初稿的完善。
