潜在热点？——DNA6mA甲基化修饰
DNA甲基化是表观遗传学领域一个重要的研究方向，真核生物中最常见的DNA修饰非5-甲基胞嘧啶（5mC）莫属了，这也是我们研究最为广泛的一种修饰方式（图1）。然而在原核生物中最常见的DNA修饰方式则为N6-methyladenine (6mA)，即腺嘌呤第6位氮原子甲基化修饰（图1）。那么在真核生物中是否也存在6mA的修饰呢？这个问题在早期一直存在争论。
图1 5mC（左）及6mA（右）化学结构示意图
随着6mA在原核生物中重要的功能（保护DNA、参与DNA复制和修复、基因调控等）被揭示，真核生物中6mA的研究也逐渐增多，早期主要集中在单细胞原生生物中，如四膜虫、草履虫和衣藻等，6mA大约占据这些基因组所有腺嘌呤的0.4-0.8%。而最新的报道显示6mA的修饰发生在更高等的生物中，如线虫、果蝇、蚊子和植物等。在人类基因组中是否也存在6mA的修饰呢telnet西安职业培训1,2 ？本文针对human样本中发生6mA修饰的6篇文章进行了详细整理。
赵秀香提示：近两年来m6A RNA甲基化的项目和实验如火如荼地在开展，在人类样本中更是涌现了一批高质量的文章。而人类样本中DNA 6mA相对来说刚刚起步，以下6篇高分文章多为2018年最新发表的，而其中应用到的方法与m6A RNA甲基化中较为相近，这个领域会成为未来的一个热点吗？
libor
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crowedDNA 6mA去甲基化酶ALKBH1促进了人间充质干细胞的成骨分化3，Bone Rearch, 2016, IF: 12.354
英语名字女
研究发现了间充质干细胞ALKBH1的表达水平在成骨诱导过程中是上调的，而敲低ALKBH1增加了6mA的水平，同时显著降低了成骨相关基因的水平。体内实验也显示ALKBH1的缺失限制了骨头形成能力。而过表达ALKBH1能够增强成骨细胞的分化。机制上，ALKBH1缺失会导致ATF4启动子区域6mA修饰的积累，从而引起ATF4转录沉默；而ATP表达的重建能够成功挽救成骨分化。
从这篇文章中能够发现6mA修饰在干细胞分化表观调控中可能也发挥了重要作用，这样的调控机制和研究思路是不是可以借鉴？
Dot Blot实验显示敲低ALKBH1显著增加了6mA的水平
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利用单分子实时测序比对表征真核生物基因组6mA修饰4，Genome Rearch, 2018年5月，IF: 10.101
从文章标题能够看出本研究内容比较明确，利用三代单分子实时测序技术（SMRT）对两种真核生物基因组进行测序，在衣藻中构建了第一个完整的6mA单碱基和单分子分辨率的图谱；在人类淋巴母细胞中，联合SMRT和独立的测序数据推断6mA修饰富集在早期全长的LINE-1原件启动子区域。
细菌和真核生物6mA甲基化组之间的差异
新的方法比对真核生物基因组中6mA修饰
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人类基因组中6mA DNA修饰5，Molecular Cell, 2018年7月，IF: 14.248
看这个高大上的名字就知道这篇文章把矛头直指人类样本中6mA修饰，作者利用多种方法表征了人类基因组中6mA修饰，包括PacBio SMRT, 6mA-IP-q, LC-MS/MS, 6mA-IP-qPCR等，可以说是第一篇paper系统地揭示了人类基因组中6mA修饰图谱。
其中发现6mA广泛存在于人类基因组中，一共有881,240个6mA位点，占据所有腺嘌呤约0.051%，[G/C]AGG[C/T]是6mA修饰最显著相关的motif。在人类细胞样本中6mA位点富集
在编码区，而且标记了活跃转录的一些基因。
人类基因组中DNA 6mA和N6-去甲基化腺嘌呤分别被N6AMT1和去甲基化酶ALKBH1调控。而癌症中6mA丰度显著更低，伴随着N6AMT1水平下降，ALKBH1水平上调；6mA修饰水平的下调能够促进肿瘤形成。
因此这篇报道比较系统地阐述了人类基因组中的6mA修饰及6mA修饰在肿瘤形成中的重要作用！
N6AMT1和ALKBH1在人类正常细胞和癌细胞中重要功能示意图
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