vectornti使用教程第六章_限制切位分析
第六章限制酶切位分析
艾灸祛湿第六章 限制酶切位分析
在NTI主程序中,用户可以针对序列的限制酶切位和切割后的片段进行分析(图6.1)。在主程序中,开启上方Analyi选项进入RetrictionAnalyi:痔疮形成原因
图6.1限制酶切位和切割后的片段分析
在RetrictionSite的选项中用户可以设定欲分析的限制酶:
图6.2利用RetrictionSite选项设定欲分析的限制酶
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在窗口的左边是程序默认的限制酶(图6.2),欲进行调整可以点选Remove或是RemoveAll移除。若要新增限制酶可以点选Add增加:
图6.3选取数据库中所要的限制酶
can的否定形式
选取欲分析的限制酶后按OK(图6.3),在RetrictionSite窗口下再按一次OK就可以进行分析了:
图6.4
选取的限制酶,分析产生的结果
使用者可以看到图谱和序列窗口都会显示用户加入的限制酶,并且都注明了剪切的位置;在文字窗口(图6.5)打开文件夹,可整理每种限制酶的切位位置:
第六章限制酶切位分析
图6.5文字窗口所显示的各种限制酶切位位置
RetrictionFragment(图6.6):点选此项目可以分析剪切出来的片段大小:
图6.6选择欲分析的片段进行分析
选择想要分析的限制酶按OK:
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图6.7于文字窗口可以看到所分析的结果
在文字窗口(图6.7)就可以看到分析的结果。
RFLP:这个项目可以比较分析同一限制酶对不同序列切出来的片段数目(图6.8):
图6.8利用RELP比较分析同一限制酶对不同序列切出来的片段数目
第六章限制酶切位分析
英语必修五单词左边的项目为其他的序列(可复选),这些序列数据是已经内建或是储存在LocalDatabae中,用户可以在Subet项目中转换数据。右边的字段可以选择限制酶(可复选)。选择好之后按下Calculate程序就会显示分析后的结果(图6.9):
图6.9利用RELP显示出所选取的分析结果
窗口中CreateGel的项目往后会再进一步介绍。属牛的和什么属相最配
油焖鲜笋左边的窗口可以选择序列(可复选),右边可以选择限制酶(可复选)。点选完毕之后再按下Start:
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分析的结果
分析的结果会以一个窗口显示(图6.11),用户可以按Print打印结果,或是按Save储存。(也可用Camera指令复制到别的档案)
RetrictionReport(图6.12):这个选项可以把所有限制酶对序列剪切的结果进行统计,这份表格同样可以进行打印、储存和复制:
图6.12将所有限制酶对序列剪切的结果进行统计
论文提纲第六章限制酶切位分析
假设海大顶尖中心研发出一个限制酶TjI,其辨认剪切的序列是目前市上所没有的,若要放入VectorNTI软件进行分析,用户需先进入到LocalDatabae里面点选左上角的Enzyme选项(图6.13):
图6.13选取Enzyme选项,将新的限制酶加入数据库
图6.14制作新的限制酶档案
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积极语言用户在Enzyme/Methylae项目中设定限制酶的辨认序列和切点(图6.15):
图6.15
设定限制酶的辨认序列和切点
按下确定就可建立好限制酶的数据(图6.16),用户可以针对此限制酶进行分析:
NOTE:限制酶的辨认序列除了A、T、C、G之外还有其他字母,这些字母分别代表:
R=AorGY=TorC W=AorTS=GorC
M=AorCK=GorT H=AorTorC B=CorTorG
V=AorCorG D=AorGorT N=AorCorGorT