TreeAge Pro使用笔记
建立决策树:在控制面板选择决策节点,拖入模型编辑窗口,双击决策节点出现两个决策分支,每多双击一次增加一个决策分支,同样双击概率节点可出现两个概率分支,每多双击一次增加一个概率分支。
变化节点类型:选中→右击→change type→选择要转换成的节点
不常用的节点:
:标签节点,其意义相当于对后面分支的一种解释,只能接一个分支,不影响
模型的计算。
:逻辑节点,
2015版新增3个节点:总和节点、DES节点、Time节点。
总和节点的意义示意图
DES节点是time-to -event模型的开始,就如同Markov节点时Markov模型的开始。
Time节点也是time-to -event模型中的节点,具体意义不清楚。
节点注释(node comments):常用来对概率节点后面各分支的意义进行注释。选中目标概率节点→Node→Add Brants Comments,注释后在相应概率节点后以红色小旗子的图标出现。同样方式打开可进行修改或删除。
复制subtree:若一些节点后分支相同,可以直接复制。首先选中要复制的节点后的分支,方法是:选中节点→右击→lect subtree,或选中节点→工具栏的subtree→lect subtree,待subtree的所有节点都显示选中后,在空白处右击鼠标选择copy,或Edit→copy,然后在需要粘贴的节点右击,选择paste,或Edit→paste。
同样,选中整个subtree后,在空白处右击→cut,或Edit→cut,可删除整个subtree。
图1 表示3针10ug节点后的概率分支均为选择的状态
克隆Markov:如果模型中一些Markov节点后的状态、转移概率、回报值等都相同的话,可直接克隆最初的Markov节点后分支,克隆的部分不会展开具体的分支,可缩小模型篇幅。克隆后,所有克隆体都将随着被克隆体的变化而发生完全相同的变化。
选中需克隆的Markov节点,然后在工具栏subtree→create clone master,命名,即创建了克隆的模板,然后点击选中需要接入克隆的Markov节点→subtree→attach clone。
设置Markov模型的跳转:将Markov模型的最后一级转化成结果节点,软件会自动出现跳转状态的选择窗口,选择合适的跳转状态即可。如下图,表示本周期有3.3%的代偿性肝硬化转化为肝癌,这3.3%的代偿性肝硬化病人下一周期将进入肝癌状态。
选择模型计算方法:计算方法可以在构建模型框架之前设定,也可以在完成框架之后输入参数之前设
定,因为不同的计算方法需输入的参数不同。Edit→Tree preferences,打开树属性对话框进行计算方法及数值变量形式等的设定。计算方法主要包括四种,其中simple计算方法的结果payoff值只有一个,其它都有两个及以上的payoff值。Benefit-cost计算方法与我们常用的成本效益分析的方法并不相同,该计算方法得出的结果是payoff“benefit”减去payoff“cost”之后的结果,不能展示每个节点的cost和benefit各是多少。
进行成本效果分析时,效果指标有多个的计算方法。首先Edit→Tree preferences→calculation method,在计算方法中激活cost-effectiveness,然后对payoffs进行定义,比如效果指标有QALY和寿命年(LY)两个,加上成本共三个payoff值,在payoffs的个数处添加至3(可以大于3),然后点击custom names进行payoffs的定义,如下图,payoff 1表示成本,payoff 2表示QALY,payoff 3表示LY。以QALY为效果指标时,在cost-effectiveness计算方法中设置
cost payoff选1,effectiveness payoff选2;以LY为效果指标时,在cost-effectiveness计算方法中设置cost payoff同样选1,effectiveness payoff选3。
设置payoffs个数
定义payoffs
效果指标为QALY
效果指标为LY
定义payoffs的数值形式,包括小数点位数、单位等,如下。