004-分子间氢键
004分子间氢键
(1)找出形成氢键的原子对（供氢的原子写在前）。怎样找？下边envi C10---H10……O3
C7----H7……..O3
(2)找出形成氢键的原子对的相应操作码。
(供氢的原子后的数字越大，查找的范围就越大)
Xp程序→f mol/n→kill$q→grow→envi c10 2
C10---H10……O3 1455
→envi c7 2
C7----H7……O3 2675
→symm 1555 +x,+y,+z
2555 -x,-y,-z
换算出相应的操作码
C10---H10……O3 x-1,+y,+z
C7----H7……O3 1-x,2-y,-z
（3）
在Ins文件中输入指令
htab c10 o3_$1
eqiv $1 x-1,+y,+z
htab c7 o3_$2
eqiv $2 1-x,2-y,-z
XL程序→Xl
结果记录在CIF文件中(倒数第二段)
htab c10 o3_$1
eqiv $1 x-1,+y,+z
htab c7 o3_$2
eqiv $2 1-x,2-y,-z
htab c23 o4_$3
eqiv $3 1-x,2-y,1-z
htab c18 o3_$4
eqiv $4 +x,1.5-y,0.5+z
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
C10 H10 O3 0.93 2.64 3.412(18) 140.3 1_455 C7 H7 O3 0.93 2.48 3.373(15) 162.1 3_675 C23 H23 O4 0.93 2.44 3.30(2) 154.2 3_676 C18 H18 O3 0.93 2.53 3.412(17) 158.4 4_576
