分子动力学模拟基本原理及其应用

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分子动力学模拟基本原理及其应用

作者：李煌 鲁红权 陈钦煌 张宏伟 周社会实践活动心得 叶琪 童小宝

来源：《科技视界》2018年第05期

【摘 要】阐述了分子动力学模拟的理论基本、模拟条件、模拟应用以及钻研的重点目

标。介绍了MD计算的发展，并给出了分子动力学模拟中相关的运动方程和定理、有限差分算

法、分子动力学模拟应用发展的主要过程。并且阐述了分子动力学模拟的初始条件眼睛痛什么原因 、周期性边

界、长程作用力以及系综等。

【关键词】分子动力学；有限差分算法；模拟条件及应用

中图分类号： TB383.1 文献标识码： A 文章编号：2095-2457（2018）05-0025-002

【Abstract】The theoretical basis， simulation con士官等级 ditions， simulation applications and key

objectives of molecular dynamics simulation are this paper， the development of MD

calculation is introduced， and the motion equ麦片巧克力 ation and theorem， finite difference algorithm and t意大利面积和人口 he

main development process of molecular dynamics simulation are initial conditions，

periodic boundary， long-range force and enmble of molecular dynamics simulation are also

discusd.

【Key words】Molecul理想与信念作文 ar dynamics； Finite difference algorithm； Simulation conditions and

application

0 引言

分子动力模拟计算，从开始发展到现在已经有五十来年的历史。它是一种依据经典力学的

计算方法，主要是依据分子的力场来计算分子的各种性质。MD计算的使用已经逐渐涉及到更

多的领域，伴随着科技的进步，它们使用的方法越来越方便、图像显示清晰以及功能变得更多

更强大，具有选择性，所以MD计算愈加普遍的应用于各种体系的模拟。但是，它的计算尺度

太小，严重依赖于力场。

1邳国 分子动力学的理论基本

1.1 分子动力学

英语作文60字 分子动力学也称多质点动力学，在忽略核子的量子效应和绝热近似的条件下，它假定原子

的运动和确定的轨迹联系在一起，而且这种假设是可以行的通的。而且分子动力学方法是对理

论和实验的补充，它可以观察到原子的运动轨迹和原子运动过程中的微观细节。

1.2 牛顿运动定理