脚跟开裂是什么原因
样本分析前变量在生物样本库中的
应用探讨
马蓓颖ꎬ陈㊀畅ꎬ郭爱华ꎬ周学迅ꎬ唐中华ꎬ何㊀毅ꎬ王㊀伟ꎬ江㊀帆ꎬ刘世建
古风游戏名字
㊀㊀[摘要]样本分析前变量(ｓｔａｎｄａｒｄＰＲＥａｎａｌｙｔｉｃａｌｃｏｄｅꎬＳＰＲＥＣ)可有效管理和追溯生物样本分析前的影响因素ꎬ促进不同生物样本库之间的沟通和交流ꎬ提高样本的质量ꎬ提升实验结果的准确性ꎮ作者从样本库的质
控及相关流程㊁不同临床类型样本的收集和ＳＰＲＥＣ记录㊁ＳＰＲＥＣ的使用３个部分入手ꎬ结合上海儿童医学中心生物样本库的实际情况ꎬ对ＳＰＲＥＣ在生物样本库中的应用进行分析探讨ꎮ
[关键词]样本库ꎻ分析前变量ꎻ质控
[中图分类号]Ｒ－０５２㊀㊀㊀[文献标志码]Ａ㊀㊀㊀[文章编号]２０９５￣３０９７(２０１５)０５￣０２７０￣０３ｄｏｉ:１０ ３９６９/ｊ ｉｓｓｎ ２０９５￣３０９７ ２０１５ ０５ ００４
ＡｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆｓｔａｎｄａｒｄＰＲＥａｎａｌｙｔｉｃａｌｃｏｄｅ(ＳＰＲＥＣ)ｉｎｂｉｏｂａｎｋＭＡＢｅｉｙｉｎｇ１ꎬＣＨＥＮＣｈａｎｇ１ꎬＧＵＯＡｉｈｕａ１ꎬＺＨＯＵＸｕｅｘｕｎ２ꎬ
ＴＡＮＧＺｈｏｎｇｈｕａ１ꎬＨＥＹｉ３ꎬＷＡＮＧＷｅｉ１ꎬＪＩＡＮＧＦａｎ１ꎬＬＩＵＳｈｉｊｉａｎ１
(１ ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＢｉｏｂａｎｋꎬＰｅｄｉａｔｒｉｃＴｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌＭｅｄｉｃｉｎｅＩｎｓｔｉｔｕｔｅꎬＳｈａｎｇｈａｉＣｈｉｌｄｒｅｎ ｓＭｅｄｉｃａｌＣｅｎｔｅｒꎬ
光绪皇帝简介ＳｃｈｏｏｌｏｆＭｅｄｉｃｉｎｅꎬＳｈａｎｇｈａｉＪｉａｏｔｏｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＳｈａｎｇｈａｉ２００１２７ꎬＣｈｉｎａꎻ２ ＳｈａｎｇｈａｉＡｖａｎｔｅｃｈＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅＣｏｍｐａｎｙꎬＬｉｍｉｔｅｄꎬＳｈａｎｇｈａｉ２００１２７ꎬＣｈｉｎａꎻ３ ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＩｎｆｏｒｍａｔｉｏｎꎬＳｈａｎｇｈａｉＣｈｉｌｄｒｅｎ ｓＭｅｄｉｃａｌＣｅｎｔｅｒꎬＳｃｈｏｏｌｏｆＭｅｄｉｃｉｎｅꎬＳｈａｎｇｈａｉＪｉａｏｔｏｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＳｈａｎｇｈａｉ２００１２７ꎬＣｈｉｎａ)㊀㊀[Ａｂｓｔｒａｃｔ]ＳｔａｎｄａｒｄＰＲＥａｎａｌｙｔｉｃａｌｃｏｄｅ(ＳＰＲＥＣ)ｃａｎｍａｎａｇｅａｎｄｔｒａｃｋｔｈｅｒｉｓｋｆａｃｔｏｒｓｏｆｐｒｅａｎａｌｙｔｉｃａｌｂｉｏｓｐｅｃｉｍｅｎꎬｅｎｈａｎｃｅｅｘｃｈａｎｇｅａｎｄｑｕａｌｉｔｙｏｆｄｉｆｆｅｒｅｎｔｂｉｏｂａｎｋａｎｄｉｍｐｒｏｖｅｔｈｅａｃｃｕ￣ｒａｃｙｏｆｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔｓ.Ｔｈｅｐｒｅｓｅｎｔｓｔｕｄｙｄｉｓｃｕｓｓｅｓｑｕａｌｉｔｙｃｏｎｔｒｏｌａｎｄｐｒｏｃｅｓｓｏｆｂｉｏｂａｎｋꎬｃｏｌ
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Ｃｈｉｌｄｒｅｎ ｓＭｅｄｉｃａｌＣｅｎｔｅｒ.
[Ｋｅｙｗｏｒｄｓ]ＢｉｏｂａｎｋꎻＳｔａｎｄａｒｄＰＲＥａｎａｌｙｔｉｃａｌｃｏｄｅ(ＳＰＲＥＣ)ꎻＱｕａｌｉｔｙｃｏｎｔｒｏｌ
[基金项目]上海交通大学医学院 ９８５ 转化医学建设专项基金
(ＥＹ０６０５０)ꎻ上海交通大学医学院人文社会科学创新研究重点项目(ＷＺ１２１７)ꎻ上海交通大学医学院新华集团基金(ＸＨＪＴ２０１２Ｅ０１)ꎻ上海儿童医学中心人才启动基金((ＥＹ０３３３０２)
[作者单位]２００１２７上海ꎬ上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心儿科转化医学研究所生物样本库(马蓓颖ꎬ陈㊀畅ꎬ郭爱华ꎬ唐中华ꎬ王㊀伟ꎬ江㊀帆ꎬ刘世建)ꎻ２００１２７上海ꎬ上海万格科学器材有限公司(周学迅)ꎻ２００１２７上海ꎬ上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心信息科(何㊀毅)
[通讯作者]刘世建ꎬＥ￣ｍａｉｌ:ｌｉｕｓｈｉｊｉａｎ＠ｓｃｍｃ.ｃｏｍ.ｃｎ
㊀㊀转化医学是近年来生物医学领域的新概念[１￣２]ꎬ它有助于揭示疾病的发生机制ꎬ找出病因进行早期治疗或者预防疾病的发生㊁发展ꎮ然而ꎬ完成实验最
基本的条件是大量高质量的样本ꎬ离不开生物样本库的使用ꎮ有关全基因组关联研究[３￣４]和精准医学研究[５￣６]ꎬ都离不开大量样本的使用ꎮ为了得到高质量的样本ꎬ需要在样本收集过程中对样本处理信息进行精确记录ꎬ保证临床或研究信息的准确性ꎮ为有效管理和追溯生物样本分析前影响因素ꎬ国际生物与环境样本库协会旗下的生物样本科学工作组于
爱迪生的名言名句２００９年开发了样本分析前变量(ｓｔａｎｄａｒｄＰＲＥａｎａｌｙ￣ｔｉｃａｌｃｏｄｅꎬＳＰＲＥＣ)[７]ꎬ用于记录不同种类的生物样本在分析前处理过程中的重要参数ꎬ促进不同样本库之间沟通交流ꎮ分析前参数必须满足以下标准:①它们的变量已知或者很可能对后续的分析结果产生影响ꎻ②这些参数在生物样本库的可控范围之内ꎬ
能够预估或者能够通过标准化的工作流程进行优化ꎮＳＰＲＥＣ的应用不仅有助于获得高质量的样本ꎬ
而且为实验结果的准确性提供了保证ꎬ因此推行ＳＰＲＥＣ具有广阔的应用前景ꎮ美国㊁欧洲㊁韩国和澳大利亚已经有多个样本库信息管理系统推行了ＳＰＲＥＣꎻＳＰＲＥＣ被收纳在由瑞典生物样本库和生物样本资源研究所提出的 用最少数据实现生物样本㊁信息和数据的共享 理念中ꎬ已经成为瑞典卫生保健中心和研究机构的国家级标准ꎮ推行ＳＰＲＥＣ
哈尔滨冰雕图片
能促进和巩固国际多中心生物标志物的识别研究和生物样本研究ꎮ作者将结合上海儿童医学中心样本
库使用和管理的具体措施ꎬ对推行ＳＰＲＥＣ情况进行简要介绍ꎮ
１㊀样本库的质控及相关入库流程
上海儿童医学中心已建立与生物样本库相适应的人员和场地㊁设备㊁设施ꎬ符合样本捐赠㊁伦理审核㊁采集㊁处理㊁贮存㊁注释㊁出库㊁运输㊁质量管理的功能需求[８]ꎮ样本库工作人员均参加了由中国医药生物技术协会组织生物样本库分会组织的生物样本库岗前培训ꎬ并获得培训证书ꎮ
样本的信息是样本的重要组成部分ꎬ是关系样本质量的重要衡量指标ꎮ建立一套组织科学合理㊁信息全面而专业化的样本库管理系统ꎬ对各类样本信息进行完善的组织和管理ꎬ是建设高质量样本库的重要条件[９]ꎮ入库的样本首先由申请者提出申请并提供知情同意书ꎬ若无知情同意书还须通过伦理委员会的审查及审批ꎮ工作人员处理所收集的样本离心分装ꎬ编码入库ꎬ同时输入捐赠者的基本信息至系统ꎬ做到第一时间及时更新信息ꎮ
２㊀不同临床类型样本的收集和ＳＰＲＥＣ记录
样本收集员每天定时按科室收集样本ꎬ工作人员根据样本的类型进行相应的处理ꎬ及时入库ꎬ从而保证样本的质量ꎮ临床样本一般分为血液样本和组织样本ꎬ两者有不同的处理流程ꎮ
２ １㊀血液样本的采集㊀由申请者指派专人采集血液样本ꎬ定时由样本库专人收集ꎮ血液样本一般分为抗凝血和非抗凝血ꎬ样本库人员收到血样后及时离心分离血样ꎬ分装全血或分离成血浆㊁血清ꎬ所分离的样本分装到专用的冻存管内ꎮ上海儿童医学中心样本库根据ＳＰＲＥＣ要求ꎬ在样本入库时填写所收样本的类型㊁主要内容物的类型㊁离心前条件(温度㊁离心前延迟时间)㊁样本第１次离心和(或)第２次离心的条件(离心的速度㊁制动㊁温度㊁持续时间)㊁离心后和样本长期储存的条件ꎬ以保证所收样本的质量(图１)ꎮ同时ꎬ会定期与使用者沟通ꎬ以便获得反馈意见ꎻ并针对存在的问题定期展开讨论和研究ꎬ以便及时解决问题ꎬ从而使样本库质量不断提升
ꎮ
图１㊀液体样本的ＳＰＲＥＣ工作流程
２ ２㊀组织样本的采集㊀由外科医生采集样本后ꎬ通知样本库人员携带液氮转运罐到手术室取样本ꎬ并根据标准操作规程进行样本的处理和入库ꎮ入库时根据国际生物和环境样本库协会最佳实践指南填写样本入库前的信息ꎬ以保证样本的质量ꎬ为以后实验结果的准确性奠定基础ꎮ同时ꎬ对于每份样本填写
相对应的标准化分析前质控代码ＳＰＲＥＣꎬ包括样本类型㊁采集方式㊁热缺血时间㊁冷缺血时间㊁固定的类型和时间以及长期储存的条件(图２)ꎮ以上操作有助于根据已有的特征识别样本ꎬ当样本提供给样本库以外的机构或用户使用时ꎬ用户能够根据ＳＰＲＥＣ获得相关的样本信息ꎮ
图２㊀固体样本ＳＰＲＥＣ的工作流程
３㊀ＳＰＲＥＣ的使用及发展
最初ＳＰＲＥＣ只对哺乳动物的样本适用ꎬ在植物样本的采集和存储中的发展也已经得到了开发ꎮ随着样本采集㊁处理和存储新技术的不断开发ꎬＳＰＲＥＣ的代码相应不断更新ꎬ随着ＳＰＲＥＣ１ ０版本在不同生物样本库中推行ꎬ根据反馈信息ꎬ２０１２年开发了
ＳＰＲＥＣ的２ ０版本[１０]ꎬ增加一些新的选项ꎮ
上海儿童医学中心使用的ＳＰＲＥＣ可以记录生物样本分析前的操作处理环节的信息ꎬ已经将ＳＰＲＥＣ整合到现有的样本库软件系统中ꎮ此外ꎬ上海万格科学器材有限公司在ＳＲＰＥＣ基础上ꎬ开发了２个独立的工具编译软件ＳＰＲＥＣｅｒ和ＳＰＲＥＣｅｒＰｌｕｓꎬ可以对样本自动生成ＳＰＲＥＣ代码㊁保存ＳＰＲＥＣ代码㊁对ＳＰＲＥＣ代码进行反编译等操作ꎮＳＰＲＥＣｅｒＰｌｕｓ在样本生成ＳＰＲＥＣ代码的基础上ꎬ具备添加样本信息管理功能ꎬ为进一步合理规范生物样本库操作流程起到一定的积极作用ꎮ
ＳＰＲＥＣ在中国的应用尚属初级阶段ꎬ目前尚无使用ＳＰＲＥＣ前后样本质量差异的对比报道ꎬ将来会进一步研究比较对样本质量的影响ꎮ样本全程质控的建立及实施有望提高生物样本库的样本质量ꎬ为人类疾病个体化预测㊁诊断㊁治疗研究提供基础保障[１１]ꎮ但是需要考虑中国样本库的建立尚处于初级阶段ꎬ样本库的质量控制也是一个逐步完善的过程ꎮ随着样本库标准化㊁规范化的发展ꎬ将有越来越多的样本库推广使用ＳＰＲＥＣꎬ会在生物样本库的实践应用中发挥更为重要的作用ꎮ
ʌ参考文献ɔ
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朋友生女儿祝福语(收稿日期:２０１５￣０６￣１６㊀本文编辑：徐海琴)
