1.DNA annealing: DNA退火热变性的核酸经缓慢降温后的复性过程。
2.Kornberg Enzyme:科恩伯格酶,科恩伯格等(1956)在大肠杆菌提取液中发现的DNA
聚合酶,在Mg++、模板DNA与引物DNA存在下,能从4种三磷酸脱氧核糖核苷中游离出焦磷酸,合成与模板DNA互补的DNA链。该酶具有3′→5′核酸外切酶活性和5′→3′核酸外切酶活性。
3.Klenow fragment::Klenow片段,E.coli DNA聚合酶I经胰蛋白酶或枯草杆菌蛋白酶
部分水解生成的C末端605个氨基酸残基片段。该片段保留了DNA聚合酶I的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性,但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性。
4.Nucleotide excision repair(NER): 核酸切除修复,切除DNA一条链上受损伤片段,以其
互补链为模板合成正常DNA片段修复DNA损伤。
5.Ba excision repair(BER):碱基切除修复,DNA碱基修复机制的一种。受损DNA通过
不同酶的作用切除错误碱基后,由一系列的酶加工进行正确填补而恢复功能。
6.Prima:引发酶,一种依赖于DNA的RNA聚合酶,其功能是在DNA复制过程中先合
成一段RNA引物,在这引物上延伸新合成的DNA片段。不同于在DNA转录中起作用的RNA聚合酶。
7.Upstream of gene:基因的上游,转录起点之前的序列,如起始密码在编码区上游。
Downstream of gene:基因的下游,基因上沿着表达方向的序列,如编码区在起始密码的下游。
8.TAF1s/TAFIIs:转录激活因子I 和转录激活相关因子。
9.Trp operon:色氨酸操纵子,负责色氨酸的生物合成,当培养基中有足够的色氨酸时,
这个操纵子自动关闭,缺乏色氨酸时操纵子被打开,trp基因表达,色氨酸或与其代谢有关的某种物质在阻遏过程(而不是诱导过程)中起作用。由于trp体系参与生物合成而不是降解,它不受葡萄糖或cAMP-CAP的调控。
10.Lac operon:乳糖操纵子,大肠杆菌中控制β半乳糖苷酶诱导合成的操纵子。包括调控元
件P(启动子)和O(操纵基因),以及结构基因lacZ(编码半乳糖苷酶)、lacY(编码通透酶)和lacA(编码硫代半乳糖苷转乙酰基酶)。在没有诱导物时,调节基因lacI 编码阻遏蛋白,与操纵基因O 结合后抑制结构基因转录;乳糖的存在可与lac阻遏蛋白结合诱导结构基因转录,以代谢乳糖。
11.Homeobox:同源框,苷的简短延伸,这种核苷的碱基序列实质上在所有基因中都是相同
的。这种现象在许多生物体,如从果蝇到人类中都能发现。在果蝇中,同源(异型)框能确定特定基因在发育过程中何时表达。
12.D-loop replication: D-loop复制,线粒体DNA上的一个区域,其上的以小段RNA与
DNA一条链配对,使DNA原始配对链在此区域闲置。
13.Rolling cycle replication: 滚换复制,复制环状DNA的一种模式,在该模式中,DNA聚
合酶结合在一个缺口链的3ˊ端,绕环合成与模板链互补的DNA,每一轮都是新合成的DNA取代前一轮合成的DNA。
进度计划表模板
14.RFA and SSB: RFA(replication factor A):复制因子A,真核生物DNA延长中RFA与
单链结合起到SSB的作用。SSB(single strand binding protein):单链结合蛋白,其功能在于稳定DNA解开的单链,阻止复性和保护单链部分不被核酸酶水解。
15.Helix-turn-helix domain: 螺旋-环-螺旋结构域,可见于原癌基因产物Myc、肌肉细胞定
向分化的调控因子MyoD-1家族、免疫球蛋白k轻链基因的增强子结合蛋白E12和E47等转录因子的结
构中。其结构与上述的亮氨酸拉链结构非常相似,只是在2个α螺旋结构之间增加了一段非螺旋链结区(环),故称为螺旋-环-螺旋结构。HLH通过α螺旋疏水区形成二聚体,多数HLH蛋白还含有一个结合DNA所需要的碱性氨基酸区域。
16.Co-translational Translocation:共翻译转移。多肽自转移类型之一,蛋白质的共翻译转
移首先是在游离核糖体上合成一段信号肽,指导核糖体结合到糙面内质网膜上,然后肽链边合成边进入内质网腔,经过初步加工和修饰后,部分多肽以囊泡形式被运送至高尔基体,进一步加工和修饰后被运送至质膜活被分泌到胞外。
17.Post-translational translocation:翻译后转运,蛋白质从核糖体上释放后才发生转运。
18.Motifs and families of protein:蛋白质的主题与家族,具有序列相似性基因表达的产物。
19.Ba stacking Force:碱基堆积力,在DNA双螺旋结构中,碱基对平面垂直于中心轴,层
叠于双螺旋的内侧,相邻疏水性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力。
这种力与氢键共同维系着DNA双螺旋结构的稳定性,而且相比之下比氢键更重要。20.Coding strand and antin strand:编码链:DNA双链中与mRNA序列(除T/U替换外)
和方向相同的那条DNA链,又称有意义链。反义链:DNA双链中能作为转录模板通过碱基互补原则指导m RNA前体合成的DNA链,即模板链(Template strand)。
21.YAC Vector:酵母人工染色体载体。是将酵母人工染色体中为复制与分离所需序列同
片段目的DNA连接构成的,可克隆的外源片段长度可大于1Mb。YAC Vector含有两个端粒序列、一个着丝粒、一个自主复制序列以及能在酵母中用作筛选标记的基因。22.Zinc Finger Domain:锌指结构。一种常出现在DNA结合蛋白中的一种结构基元,是由
治疗失眠症一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn2+构成,形成的结构像手指状。
1.Acidic activation domains:酸性激活域,转录激活区的一种,该结构域含有很高比例
的酸性氨基酸,故名。
2.Alternative σ factor:替代σ 因子。从一套基因的转录到另一套基因的表达是噬菌体
感染的共同特点,这些改变通过RNA聚合酶的合成来完成或通过变换σ因子完成。3.Alternative Processing of RNA:可变RNA加工:指一个特定的前m RNA通过使用不同的
polyA位点或不同的剪接技术,产生一种以上的m RNA.
4.Alternative Splicing of RNA:RNA的剪接。hnRNA在加工成为mRNA的过程中,切掉
内含子,拼接外显子的RNA加工过程。
5.Anti-n RNA and Antin DNA strand:反义RNA和DNA反义链。反义RNA
是指与mRNA互补的RNA分子,也包括与其他RNA互补的RNA分子;DNA反义链是与DNA模板链互补的不参与转录的DNA分子。
6.Attenuation of transcription:转录衰减,指由RNA聚合酶的作用使DNA上的转录起
始区域(启动基因)已开始了的转录反应,在操纵子内部的一定区域(转录衰减区)几乎停止,其以后的区域转录显著减少,此称转录衰减。
7.Attenuator:衰减子,在色氨酸操纵子中的一个区域,此区域以形成不同二级结构的方
式,利用原核生物转录与翻译的偶联对转录进行调节。此区域只存在于原核生物合成代谢的操纵子中。Basal transcription apparatus:基本转录装置。
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8.CAP: 降解物活化蛋白,又称分解代谢基因活化蛋白,在分解代谢阻遏中调节基因的产
物是降解物基因活化蛋白(CAP),它能与环腺苷酸(cAMP)结合而被活化,帮助RNA聚合酶与启动子结合,促进转录进行。降解物活化蛋白降解物活化蛋白降解物活化蛋白降解物活化蛋白
9.cDNA \ T-DNA:cDNA是指与某一RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA;T-DNA,农杆菌 Ti
或Ri质粒中的一段DNA序列,可以从农杆菌中转移并稳定整合到植物核基因组中;10.Cloning Vector: 克隆载体,携带插入外源片段的质粒或噬菌体,从而产生更多物质或蛋
白质产物。cDNA clone,cDNA克隆,是以mRNA为原材料,经体外反转录合成互补
的DNA(cDNA),再与载体DNA分子连接引入寄主细胞。每一cDNA反映一种mRNA 的结构,cDNA克隆的分布也反映了mRNA的分布。
11.cDNA Library:cDNA文库。以mRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNA,
与适当的载体连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNA,并能繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。
12.cis-acting element:顺式作用元件,DNA、RNA或者蛋白质中的一些特殊的核酸或氨基
酸残基序列,只作用于与其连接在一起的靶,而不作用于不与其相连的靶。
13.Cis-acting quence:顺式作用序列,存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列。它
们的作用是参与基因表达的调控,本身不编码任何的蛋白质,仅仅提供一个作用位点,要与反式作用因子相互作用才能起作用。
14.Codon degeneracy:密码子的简并性,一个氨基酸由一个以上的三联体密码编码的现象
名片背面叫做密码子的简并性。Co-repressor and co-activator:共阻遏和辅激活物
八哥鸟吃什么食物15.Cot1/2:半变Cot值。DNA初始浓度与复性完成一半时间的乘积。
16.CRP(CAP):cAMP受体蛋白,是指能与细胞内第二信使cAMP特异结合的蛋白受体。
17.CTD and TFIIH:反式作用因子,是指能直接或间接的识别或结合在各类顺式作用元件
核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白质;TFIIH是一个大的既有激酶活性又有螺旋酶活性的多组分蛋白质复合体。
18.Denaturation of DNA and Tm:DNA变性和变性温度。DNA热变性时,其紫外吸收增加
值到达总增加值一半时的温度,称为DNA的变性温度。DNA变性是指DNA分子由稳定的双螺旋结构松解为无规则线性结构的现象。
19.Denaturation of Protein:蛋白质和DNA变性。蛋白质变性(protein denaturation)是指
蛋白质在某些物理和化学因素作用下其特定的空间构象被改变,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失的现象;
20.D-loop Replication:D-环复制,双螺旋的两条链并不同时进行复制,轻链先开始复制,
稍后重链再开始复制,当复制沿轻链开始时,重链上产生了D环,随环形轻链复制的进行,D环增大,重链后亦开始复制,最后两条链完成复制形成两条新的DNA又螺旋。
21.DNA Finger Printing DNA:指纹图谱,通过用限制性内切酶消化和与特异的核心探针
杂交取得不同大小的DNA片段的多点区带图谱,并经与另一个休的DNA图谱比较以评价其相似性的技术。对多点带图谱中个体的特异性进行评价的方法被称为“DNA指纹图谱法”。是根据没有两个无亲缘关系的个体在同一位置上共有同相同的区带图谱的机率极低,所以DNA指纹图被认为对某一个体是独特的。这种技术已广泛地应用地法医和亲子鉴定。
22.DNA ladder:DNA梯子。细胞调亡时DNA在核小体间断裂形成一些DNA片断,提取
后由一些特殊质粒被特定内切酶消化,在凝胶电泳上产生很多条带的核酸片段,由于成梯状,故称之为DNA Ladder。
23.Enchancer:增强子,增强基因启动子工作效率的顺式作用序列,能够在相对于启动
子的任何方向和任何位置(上游或下游)上都发挥作用。
24.Excision repair:切除修复,切除DNA一条链上受损伤片段,以其互补链为模板合成正常
DNA片段修复DNA损伤。
25.Exon:外显子,基因组DNA中出现在成熟RNA分子上的序列。外显子被内含子隔开,
转录后经过加工被连接在一起,生成成熟的RNA分子。信使核糖核酸(mRNA)所携带的信息参与指定蛋白质产物的氨基酸排列。
26.Expression vector: 表达载体,设计好的克隆载体,使编码序列插入特定的位点,能够转
录和翻译成蛋白质。
27.Footprinting:足迹法。一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法,用于检测与特定蛋
白质结合的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。
28.Frame-shifting: 移码,在DNA编码区插入或缺失碱基导致下游密码子的可读框发生
移动或改变。
29.Gene Cloning:基因克隆。从基因组或DNA中分离单个基因,并在细胞中复制拷贝的
过程。Gene expression:基因表达,使基因所携带的遗传信息表现为表型的过程。包括基因转录成互补的RNA序列。对于结构基因,信使核糖核酸(mRNA)继而翻译成多肽链,并装配加工成最终的蛋白质产物。
30.Gene therapy:基因治疗,在基因水平上治疗疾病的方法。包括基因置换、基因修正、
基因修饰、基因失活、引入新基因等。
31.General(basal) transcription factors:通用转录因子,RNA聚合酶介导基因转录时所必
需的一类辅助蛋白质,帮助聚合酶与启动子结合并起始转录。与作用于特定基因的调节蛋白不同,对所有基因都是必需的。
32.Genetic code:遗传密码,包含在脱氧核糖核酸或核糖核酸核苷酸序列中的遗传信息。
33.Genomic Library:基因组文库。某种生物全部基因组DNA序列的随机片段重组DNA
克隆的群体。
34.Group I Transmembrane Protein:I类跨膜蛋白。能够选择性的使非自由扩散的小分子物
质透过质膜的膜蛋白。
35.Group II Transmembrane Protein:II类跨膜蛋白质。整合质膜蛋白的一种,在一次跨膜
时,多肽链的C端在细胞膜外,N端在细胞膜内。
36.hn RNPs:核不均一核糖核蛋白,不均一核RNA与组蛋白结合在一起的复合物。
37.hnRNA不均一核RNA:它是mRNA的未成熟前体,需要经过加帽、加尾、剪切、剪
接等步骤称为成熟mRNA。
38.Houkeeping gene :管家基因,生物体各类细胞中都表达,对维持细胞存活和生长所
必需的蛋白质编码的基因。如糖酵解和柠檬酸循环所需酶的编码基因等。其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的。
39.Internal promoter:内部启动子,存在于RNA聚合酶Ⅲ中。
40.Intron :内含子,真核生物细胞DNA中编码序列的间插序列。这些序列被转录在前体RNA
中共七大的意义中,经过剪接被去除,最终不存在于成熟RNA分子中。
41.Kina:激酶,(1)全称“磷酸激酶(phosphokina)”。催化ATP上的5′-磷酸基团转移到
其他化合物上的酶。也偶尔催化其他三磷酸核苷上磷酸基团转移。(2)催化酶原转变为有活性的酶。
42.Leader quence of protein:蛋白质的前导序列。蛋白质短的N 端序列,负责进出膜。
43.Leader peptide quence:蛋白质前导序列。多顺反子mRNA的头一条多肽链合成起点
同RNA分子的5’-P末端间距离可达数百个核苷酸,这段编码之前的不转录的mRNA 区段称为前导序列。
44.Leading strand and lagging strand:前导链和后滞链。前导链:与复制叉移动的方向一致,
通过连续的5ˊ-3ˊ聚合合成的新的DNA链。
45.Leucine zipper protein:亮氨酸拉链。一种蛋白质中常见的结构模体,由一组重复片段组
成,每个重复片段的第7个氨基酸残基均为亮氨酸,两条含有此模体的多肽链可形成卷曲螺旋结构,最初发现于DNA结合蛋白,但也可存在于其他类型蛋白质。
46.Mismatch repair:错配修复,一种纠正DNA复制过程中错配碱基的机制。核酸外切酶识
别不能形成氢键的错配碱基,并切除一段多核苷酸,缺口由DNA聚合酶Ⅰ修补及DNA 连接酶封口。
47.Molecular Cloning:分子克隆。将核酸分子插入到可在原核或真核细胞中无性繁殖的
载体中,经过筛选获得单一克隆群体的技术。
氓原文朗读48.Molecular Biology:分子生物学。在分子水平上研究生命现象的科学。通过研究生物大
分子(核酸、蛋白质)的结构、功能和生物合成等方面来阐明各种生命现象的本质。49.Multiple cistron mRNA:多顺反子mRNA。在原核细胞中,通常是几种不同的mRNA
连在一起,相互之间由一段短的不编码蛋白质的间隔序列所隔开,这种mRNA叫做多顺反子mRNA。
50.Multiple Clone Sitea:多克隆位点, DNA载体序列上人工合成的一段序列,含有多个限制
双证本科内切酶识别位点。能为外源DNA提供多种可插入的位置或插入方案。
51.Nick translation:缺刻平移:缺刻的5’-P端被polyI不断去除,3’-OH则不断进行聚
合反应,缺口因而不断向3’转移的现象。
52.NLS and NES:核定位信号,核输出信号。核定位信号是另一种形式的信号肽, 可位于
多肽序列的任何部分。一般含有4~8个氨基酸, 且没有专一性, 作用是帮助亲核蛋白进入细胞核;核输出信号是细胞核内形成的大分子复合物上的氨基酸序列,起分拣信号作用,可被核孔复合体上的输出受体所识别,引导大分子从细胞核经核孔复合体输出到细胞质。
53.Northern Blotting:northern杂交。将电泳凝胶中的RNA转移到叠氮化的或其他化学修
饰的活性滤纸上,通过共价交联作用使它们结合。
54.knock-out基因剔除:,当基因转入破坏生物体基因组内某个基因后,观察由此引起的表型
变化,同样也可认识基因的功能,这是基因剔除。基因剔除是用DNA重组技术剔除或破坏生物体基因
组内某一特定基因,而后观察由此引起的表型改变。
55.Okazaki fragment:冈崎片段,在DNA不连续复制过程中,沿着后随链的模板链合成的
新DNA片段,其长度在真核与原核生物当中存在差别,真核生物的冈崎片段长度约为100~200核苷酸残基,而原核生物的为1000~2000核苷酸残基。
56.Oncogenes :癌基因,一类与癌的生成有关的基因。其表达过分活跃可导致细胞发生癌
变。源自细胞中的正常基因——细胞癌基因,最初因致癌病毒的转化基因而被发现。
57.Open reading Frame,ORF:开放阅读框,开放阅读框是结构基因的正常核苷酸序列,从起始密码子到终止密码子的阅读框可编码完整的多肽链,其间不存在使翻译中断的终止密码子。
58.Operon:操纵子,指包含结构基因、操纵基因以及调节基因的一些相邻基因组成的DNA
片段,其中结构基因的表达受到操纵基因的调控。
59.Origin of Replication/ori: 复制起点,基因组中单一DNA复制时的所需要的起始序列。
含AT碱基对丰富,易解链。真核细胞染色体含有多个起始点,而细菌染色体和质粒中只有一个。
60.PCR,聚合酶链式反应,是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温
退火及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,具有特异性强、灵敏度高、操作简便、省时等特点。
61.phage vector/M13 phage vectors/ BAC vector:λ噬菌体载体,一种大肠杆菌双链RNA噬
菌体为λ噬菌体,能够承载λ噬菌体的即为λ噬菌体载体。
62.Physical map:物理图谱,是利用限制性内切酶将染色体切成片段,再根据重叠序列确
定片段间连接顺序,以及遗传标志之间物理距离[碱基对(bp) 或千碱基(kb)或兆碱基(Mb)]的图谱。
63.Polycistronic mRNA,多顺反子mRNA,两个以上相关基因串在一起转录所得到的信使
核糖核酸(mRNA)。多顺反子mRNA一般可同步翻译产生功能相关的多个蛋白质或酶。