OMAHA七巧板医学术语集入门指南
Update in 2019.4.30
Prepared by OMAHA秘书处
一、O MAHA七巧板医学术语集介绍
1.OMAHA术语集意义和价值
垂直极限
OMAHA七巧板医学术语集(简称OMAHA术语集)是基于本体方式构建,经过验证的,语义丰富的术语集。它既可以帮助规范医学术语表达,同时又可以提升不同系统间的语义互操作能力。
OMAHA术语集可以通过如下方式为医疗健康行业赋能:
-应用于临床记录,不仅可以满足表达方式的多样性,又可以保证临床适用性。
-应用于垂直搜索,可以提升检索结果的准确性和完整性。
-应用于语义标注,可以减少人工成本。
-应用于数据分析,可以使分析结果更加准确可靠。
-应用于决策支持,快速检索病例内容并结合知识推导,给出准确建议。
-通过建立当前机构使用的术语与OMAHA术语集的映射,可以实现不同系统间语义层面的信息互换。
2.OMAHA术语集范畴
OMAHA医学术语集主要包含疾病、症状、解剖、手术、生物、药品、医疗器械、检验检查、影像、护理、基因、基因突变等医学领域的术语内容。术语集范围将会结合行业需求持续进行拓展。
万圣节素材3.OMAHA术语集框架
OMAHA术语集是一套符合临床适用性的医学术语集。共有四种类型的核心构件:
具有独特含义的概念。用于描述概念的符合临床用语习惯的术语。将每个概念与其它相关概联系起来的关系。与国内外主流术语进行连接的映射。
OMAHA术语集框架
-概念(concept)
概念是客体在人们心理上的反映1。客体既包括客观存在并可观察到的事物,具体的如树木、房屋;抽象的如物价、自由;也包括想像产生的事物(如神话人物)2。
在OMAHA医学术语集中,概念表示一个临床观念(clinical idea/clinical thought),每个概念都有一个唯一的数字标识符表示。
-术语(term)
在OMAHA术语集中,术语是对概念的语言指称,一个概念下可以有多个术语同时存在,每个术语都有一个唯一的数字标识符表示。每个概念下有且仅存在一个首选术语或待定首选(两者不同时存在),首选术语/待定首选术语是临床上最常用来表达这个概念的术语,这个概念下其他术语被定义为许用术语。
单个概念术语展示
1GB/T 10112—1999 术语工作原则与方法
2GB/T15237.1-2000 术语工作词汇第1部分理论与应用
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-关系(relationship)
OMAHA术语集通过关系将术语集中相关的概念建立联系。每一条关系都有一个唯一的数字标识符表示。关系有两种类型,子类关系和属性关系。
子类关系:即层级关系(或上下位关系),一个概念可以是另一个或多个概念的子类。如疾病“急性胆管炎”是疾病“急性消化系统疾病”的子类,也是疾病“胆管炎”的子类。
属性关系:用来表示概念的特征。如疾病“急性胆管炎”的病理过程是“突然发作或短期持续”,发生的解剖结构位置是“胆道”,形态学改变是一种“炎症”。
单个概念关系展示
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-映射(mapping)
映射是指建立一个术语集的编码、概念或术语与另一个术语集内有着相同或相似语义的编码、概念或术语之间的关联。通过映射,OMAHA术语集可以与其它术语建立联系。每一条映射都有一个唯一的
数字标识符表示。
OMAHA术语集与ICD-10的映射
ways
OMAHA术语集与ICD-9-CM-3的映射
二、O MAHA医学本体介绍
1.OMAHA医学本体概述
OMAHA术语集是基于本体的方式构建,包含疾病、症状、体征、解剖、手术、生物、药品、医疗器
械、检验检查、影像、护理、基因、基因突变等医学领域的术语,且未来术语的范围将会结合行业需求持续进行拓展。通过严谨规范的术语创建和维护规则,形成可供行业复用的高质量的中文术语集,并持续进行维护更新。
OMAHA医学本体采用OWL 2 EL3标准。OWL 2 EL是OWL 2的一个子集,具有以下特点:
-特别适用于具有大量类(class)和属性(property)的本体。
-本体一致性(ontology consistency)、类包含(class expression subsumption)和实例检测(instance checking)可以在多项式时间内完成。
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2.OMAHA医学本体组成
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OMAHA医学本体由实体、公理和表达式组成:
公理(axiom): OMAHA医学本体表达的基本陈述。
实体(entity):用来表示医学领域中的对象。实体包括类、数据类型(datatype)、对象属性(object property)、注释属性(annotation property)和命名个体(named individual)。类用于对具有共同点的个体进行分组。对象属性以不同的方式把类联系起来,数据类型是指数据值的不同类型。注释属性是对本体添加额外的描述。命名个体是指经过明确声明的个体。
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表达式(expression): 由基本的实体组合而成的复杂的语句。
2.1公理
OMAHA医学本体支持下列公理:
-子类:SubClassOf
-类的等价:EquivalentClass
-类的不相交:DisjointClass
-带或不带属性链的对象属性的包含:SubObjectPropertyOf
-数据属性的包含:SubDataPropertyOf
-对象属性的等价:EquivalentObjectProperties
-数据属性的等价:EquivalentDataProperties
-传递的对象属性:TransitiveObjectProperty
-
自返的对象属性:ReflexiveObjectProperty
3见www.w3/TR/owl2-profiles/#OWL_2_EL。