全基因组关联分析（GWAS）-群体结构与亲缘关系
描写花的四字成语
1、群体结构及其对 GWAS 的影响
群体结构的来源
杜甫写了多少首诗image.png
描写春的句子群体结构对GWAS的影响--混淆变量
Ancestry可以导致混淆变量（confounding variable）
混淆变量: 统计学中，混淆变量是指既与因变量相关⼜与⾃变量相关的⽆关变量。混淆变量其实就是群体结构变量，是潜在的第三者每个亚群的样本共享⼀种⽣长习惯和⽣活⽅式，导致许多感兴趣的性状直接与亚群或世系相关。
群体结构对GWAS的影响--假阳性
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辨色image.png
image.png 2、群体结构的推断⽅法
群体结构评估三宝刃
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系统发育树
image.png四害防治
model-ba的群体结构分析
凤凰历史分析的⼤致原理：将⼤群体分成K个服从Hardy-Weinberger平衡的亚群，将各材料归到每个亚群，计算第i个材料其基因组变异源于第k个亚群的可能性（Pritchard et al. 2000），⽤Q值表⽰，Q值越⼤，表明该材料来⾃这个亚群的可能性越⼤
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英语段落摘抄>薛婧人体⽤于GWAS的主要结果
image.png PCA(数学上的计算)
image.png EIGENSOFT-smartPCA主要结果图⽰
image.png 基因型与群体结构关联
