关于计算参数设置
主要有几个参数需要注意 1 对于 Electronic 页面， 需要注意的是 Core treatment,对于过渡金属原子通常需要考虑相对论效应， 因此一 般不使用 All Electron 方法。其他几种方法任选。Basis t 应为 DNP，Setup 下的 Quality 一般选 fine。为了提高计算速度，一个较好的办法是先用粗糙的Basis t 和 Quality 进行优化，然后再提高精度。 2 还有一个非常重要的选项是 Electronic>More>SCF 里的 U smearing。这个关键字有助于加快收敛，但是设的多大往往会产生错误的结果，它也相当于允许的误差范围。具体设置办法可参考 help。 其他的关键字可酌情设置。
虾子酱Dmol3
DMol3允许您使用密度泛函理论(DFT)建模分子、固体和表面的电子结构和能量学。这将产生非常精确的结果，同时使从头计算方法的计算成本相当低。您可以使用DMol3研究广泛的系统，包括有机和无机分子、分子晶体、共价固体、金属固体和材料的表面。使用DMol3，您可以预测结构、反应能量、反应势垒、热力学性质、光学和振动光谱。
DMol3使用DFT产生非常精确的结果，同时对于从头开始的方法保持相当低的计算成本。您可以在DMol3的理论部分了解更多关于DMol3如何工作的信息。
DMol3适用于分子和三维周期固体，但不适用于一维或二维周期结构。要为这样的系统建模，您必须构建一个周期性副本之间具有真空的3D结构。
Setup
DFT-D
Spin unrestricted=spin polarized
自旋不受限制:当选择时，表示计算将使用不同的轨道进行不同的自旋。这就是所谓的“自旋不受限制”或“自旋极化”计算。如果不加检查，计算对和旋转使用相同的轨道。这就是所谓的“自旋受限”或“非自旋极化”计算。默认=无节制的。
U formal spin as initial
使用形式自旋作为初始值:当勾选时，表示每个原子的未配对电子数的初始值将取自为每个原子引入的形式自旋。这个初始值将在计算过程中进行优化。检查默认=勾选
Metal
当选择时，这表明该系统是金属的，需要热涂片和布里渊区密集采样。如果不勾选，默认情况下使用的k点分隔符将更粗，并且不使用涂片。默认=无节制的。只适用于周期体系
U symmetry
当勾选时，表示计算中应使用对称信息。分子动力学模拟或涉及过渡态搜索或确认的计算不能使用对称信息。
由于DMol3服务器强制的对称单元，在DMol3计算中获得的总能量和其他特性在使用对称集on和off之间可能有非常细微的差别。在高度对称的分子系统中，这种数值效应可能非常明显。
当函数设置为B3LYP或任务设置为Dynamics、TS Search、TS Confirmation、Reaction Kinetics或electronic Transport时，U对称轴复选框不可用。在这些情况下，将不使用对称。
Multiplicity
从下拉列表中选择multiplicity来对特定的自旋状态执行计算。可用的选项是:
当选择Auto时，DMol3将尝试通过执行aspin-unrestricted计算来确定地自旋状态。
只有勾选自旋不受限制复选框且不勾选将正式自旋用作初始复选框时，才启用此选项。
指定自旋状态有一个限制:不可能强制mol3执行不受限制的单线态计算。
如果选中Spin unrestricted复选框并将Multiplicity设置为Singlet，结果将与使用自动设置相同。
在周期系统中，多重性指的是单个单元单元电子的自旋状态。
Charge
指定分子或单元上的总电荷。
DMol3可以使用fractional charge操作，但是非整数charge只能通过手工编辑DMol3输入文件来指定。
当任务设置为电子传输时，自旋和电荷控制被禁用。
More
Quality
设置优化循环之间的能量变化、最大力和最大位移的几何优化收敛阈值。当满足能量收敛时，优化将停止，同时满足位移或梯度准则。如果计算出的初始梯度低于阈值，优化将成功停止，无需一步，也无需比较位移和能量。
Value | Coar | Medium | Fine |
Energy (Hartree) | 1 × 10-4 | 2 × 10-5 | 1 × 10-5 |
Max. force (Hartree Å-1) | 0.02 | 0.004 | 0.002 |
Max. displacement (Å) | 0.05 | 0.005 | 0.005 |
| | | |
Energy
指定几何优化期间Hartree中最大能量变化的收敛阈值。
Max. force
在Hartree A-1中，指定几何优化过程中最大力的收敛阈值。
Max. displacement
指定几何优化过程中A中最大位移的收敛阈值。
Max. iterations
指定几何优化循环的最大数量。如果达到这个循环次数，即使不满足收敛准则，计算也会停止。
Max. step size
指定任意笛卡尔坐标允许的最大变化量。几何位移被截断，使之小于这个值。这可以防止
右字组词优化器采取不合理的步骤。
DMol3中的默认优化器使用非局部化的内部坐标，最大笛卡尔步长并不直接适用于此方法。你应该减少最大值步骤大小,满天星花如果你观察到在最小化过程中实际位移太大，导致大的能量变化。
U starting Hessian:
选择时，与当前模型关联的Hessian将用作新计算中的初始Hessian。如果未选中，则最小化将在没有黑森纤维的情况下启动。您可以从几个源获得开始的Hessian，如导入Hessian文件所述。公共安全管理
在DMol3中，当对称性被激活时，不可能使用开始的Hessian进行几何优化。
Print eigenvalues
当选择时，Kohn-Sham特征值打印在每个收敛SCF循环的末尾。
Optimize cell:
只有当前活动的文档包含周期性结构时才启用此选项。如果禁用或未选中此选项，则优化循环和置换步骤不可用。
单元格优化需要对单元向量进行许多小的更改，并对每个位移进行局部优化。
当选择优化单元和对称时，不可能同时计算振动。
Optimization cycles
确定单元优化步骤的数量
Displacement step
单元向量位移的大小。
Electronic
Integration accuracy
指定在哈密顿量的数值积分中使用的精度。
Medium选项为计算中的每个原子使用大约1000个网格点
SCF tolerance
Coar = 10-4
Medium = 10-5
Fine = 10-6
k-point t
定义用于在互易空间中对波函数进行积分的积分点的数量。
Gamma - a single point
k点控制只对周期系统有效。
Core treatment
All Electron (default) 不提供特殊处理的核心。所有的电子都包括在计算中。
Effective Core Potentials (ECP) 将核心电子替换为单个有效势，降低了计算成本。ECPs引入了一定程度的相对论校正到核心。
All Electron Relativistic显式包含所有电子，并在核心引入一些相对论效应。这是最精确的，也是最昂贵的计算选项。
DFT Semi-core Pudopots (DSPP) 将核心电子替换为单个有效势，降低了计算成本。dspp将一定程度的相对论修正引入核心。基础施工The are DFT-bad potentials
Effective Core Potentials and DFT Semi-core Pudopots are not available for the meta-GGA exchange correlation functionals.
Basis t
当基集被设置为TNP时，基文件的选择不可用，因为它有自己的自定义基文件。
当基底集被设置为DNP+时，基底文件的选择是不可用的，因为这个基底集仅在4.4版本
中可用。
选择DNP+ 中秋祭月要求非常大的轨道截止。较短的截断可能会导致压缩弥散尾近似产生误差。
Orbital cutoff quality
指定原子基集的有限范围截止。
轨道截止质量决定了有限范围截止的大小，并取决于轨道截止方案
原子轨道到原子中心的距离为零。减小截止值可以减少计算所需的计算时间，但会引入较大的近似。截止值必须在3.25到20 A之间。
在SCF或几何优化计算期间，使用太小或太大的截止可能导致收敛失败。切断的最小推荐值是粗质量表中的值。最大值不应超过20a。
Harris approximation
当勾选时指定哈里斯非自洽近似用于计算。这大大减少了所需的计算时间，但也降低了计算的准确性。哈里斯近似仅适用于无溶剂效应的LDA泛函自旋受限计算。
U solvation model
当勾选指定将使用COSMO溶剂化模型时，可以在DMol3电子选项对话框的溶剂选项卡上设置更多细节。当使用溶剂化模型时，哈里斯近似是不可用的。
SCF
SCF tolerance
q版漫画人物指定SCF密度收敛的阈值。当DIIS密度误差矩阵的最大(量级)分量小于这个值时，SCF过程被认为收敛到最小值。
Max. SCF cycles
指定能量计算允许的最大SCF迭代次数。如果SCF在指定的迭代次数后不收敛，则计算将终止。
Multipolar expansion
指定用于电荷密度多极表示的最大角动量函数
对于d-电子半占位的元素，必须选择Hexadecapole for Multipolar expansion.
Charge
100的英语
指定用于在当前迭代和以前迭代之间混合电荷密度的值f。允许的值是0.0 < f≤1.0。例如，0.2的值将使用电流密度的20%和以前迭代的80%构建电荷密度。
Spin
指定在当前迭代和以前迭代之间混合自旋密度时使用的值。允许的值= 0.0到1.0。
U DIIS
当检查时，表明DIIS(迭代子空间中的直接反演)将用于加速SCF的收敛。
