monocle2拟时间分⽀点分析结果解读
How to map cell fate to branches?
拟时间分析结果有很多重要的结果，但是这些结果如何解读？⽐如下图的分⽀点分析结果：
病服
分⽀点热图结果
从图中可以看到，⾏代表基因，这个好说，热图的列主要分为三⽅⾯：Pre−branch、Cell fate 1、Cell fate 2，这三个列代表什么含义？Pre−branch
明天的太阳
五花肉炒青椒
为了解读结果，我们看⼀下拟时间分析分的state结果图，然后我们对应的Pre−branch包含哪些细胞？
拟时间分析state结果
这⾥，我们想⽐较state7和state1的差异，也就是想分析branch point 3的分⽀点（identify genes expresd in a branch-dependent ），那这⾥Pre−branch到底包含哪些细胞？
In fact, BEAM tries to traver backward from the cell on the branch point all the way back to the root cell (the cell with pudotime 0) and u all tho cells as the the pre-branch.
从结果说明可以看到，Pre−branch包含的细胞为 2, 3, 5。大班教育笔记
'cell fate 1' and 'cell fate 2'
cell fate 1和cell fate 2到底指什么？⽐如还是这⾥的branch point 3为例：
Cell fate 1 corresponds to the state with small id (in this ca, state 1) while cell fate 2 corresponds to sate with bigger id (in this ca, state 2)
从说明⽂档中可以看出：
[x] Cell fate 1：state 1
[x] Cell fate 2：state 7
其他场景Pre−branch说明
如果⽐较state4和state7，Pre−branch⼜是哪些细胞？
this is a very good question since state 4 relates to branch point 2 while state 7 relates to branch point 3.
安全图片大全For this test, the pre-branch will only include cells from state 2.
这⾥的Pre−branch仅仅包含state2细胞。
后记
岚平
此⽂仅仅记录了分⽀点依赖相关基因的解读，其他的解读后续在说明。
白菜饺子馅的做法plot_multiple_branches_pudotime函数说明
plot_multiple_branches_pudotime：Create a kinetic curves to demonstrate the bifurcation of gene expression along multiple branches。
合同审核此函数可以进⾏多个分⽀点进⾏⽐较分析。
