泛素化研究模式很难吗?我们总结了一份研究小套路~

更新时间:2023-06-26 06:33:15 阅读: 评论:0

泛素化研究模式很难吗?我们总结了⼀份研究⼩套路~
泛素化是指泛素在⼀系列酶的催化下对靶蛋⽩进⾏特异性修饰的过程,它被认为是蛋⽩质翻译
工会计划
后修饰的⼀个重要途径,在细胞凋亡、细胞周期调控、DNA损伤修复及膜转运等细胞过程中起
重要作⽤。
⼀、套路总结
1、从下游找上游
2、从上游找下游
⼆、⾼分(IF:41.577)⽂献剖析
FBXO38 mediates PD-1 ubiquitination and regulates anti-tumour immunity of T cells.Nature.
IF:41.577 FBXO38 mediates PD-1 ubiquitination and regulates anti-tumour immunity of T
cells.Nature. 2018 Dec;564(7734):130-135.
1、机制图展⽰
在正常激活的T细胞中的IL-2信号传导导致STAT5介导的Fbxo38基因表达的转录激活。FBXO38
蛋⽩募集泛素(Ub)修饰内化的PD-1,使PD-1的蛋⽩酶体降解。T细胞表⾯上低丰度PD1可最
终促进抗肿瘤免疫反应。
2、⽂献解读
PD-1在蛋⽩酶体中被泛素化降解
三种不同T细胞PD-1表达⽔平-时间变化曲线:激活后的T细胞2天PD-1表达到峰值,之后开始降
解,激活后T细胞中PD-1转录⽔平下降不明显。
IP实验发现PD-1和泛素相互作⽤,暗⽰PD-1被泛素化。
蛋⽩酶体抑制剂MG132可抑制PD-1的降解;
承受的近义词
溶酶体抑制剂NH4Cl则不能。
has的过去式
FBXO38介导PD-1的Lys48位泛素化降解
IP实验验证:PD-1和FBXO38存在相互作⽤。
只有同时表达PD-1和FBXO38才可观察到PD-1泛素化;
圣诞活动主题调⾼FBXO38,PD-1泛素化升⾼,调低则泛素化降低。
FBXO38调节T细胞抗肿瘤免疫⼒
敲除FBXO38的⼩⿏种瘤之后肿瘤⽣长更快、⼩⿏存活时间缩短。
敲除FBXO38后,CD4和CD8 T细胞PD-1表达升⾼,效应分⼦阳性CD8 T细胞⽐例降低,CD8
T细胞增殖能⼒降低。
IL-2在肿瘤微环境中拯救Fbxo38的表达⽔平
除CD3、CD28抗体激活外,在加⼊IL-2可进⼀步提⾼FBXO38的表达。
ChIP发现IL-2能促进STAT5(IL2的下游)结合到FBXO38的Enhancer和Promoter上 -IL-2促进FBXO38转录的机制。
级的笔顺
体内实验证明:IL-2可通过促进FBXO38的转录,抑制PD-1的表达,进⽽抑制肿瘤的⽣长。
3、技术路线图
三、低分(IF:6.491)⽂献剖析
Long non-coding RNA SNHG15 interacts with and stabilizes transcription factor Slug and promotes colon cancer progression.
IF:6.491 Jiang Hao,Li Tingting,Qu Yi et al. Long non-coding RNA SNHG15 interacts with and stabilizes transcription factor Slug and promotes colon cancer progression.[J] .Cancer Lett., 2018, 425: 78-87..
1、机制图展⽰唱得响亮简谱
LncRNA SNHG15与Slug的C末端结构域结合,掩蔽蛋⽩化位点可阻⽌BTRC介导的Slug泛素化降解。导致Slug蛋⽩表达上升,诱导结肠癌中的EMT和/或肿瘤细胞增殖。
2、⽂献解读
差异表达的lncRNA⽐较分析
通过GEO数据库数据挖掘,结合PCR验证结果,排除已经有研究报道的lncRNA,最终挑选了SNHG15这⼀lncRNA。
LncRNA SNHG15在癌症中失调
LncRNA SNHG15与癌症不良预后相关,LncRNA SNHG15在癌症中⾼表达。
LncRNA SNHG15促进结肠癌细胞迁移
在细胞表型研究中,作者发现SNHG15能够显著促进结直肠癌细胞的迁移。多米尼加
LncRNA SNHG15与结肠癌细胞中的Slug相互作⽤
IP和RNA pull-down实验验证LncRNA SNHG15与Slug相互作⽤。
确定SNHG15中的Slug结合域 ,Flag-Slug受外源lncRNA SNHG15调控。
LncRNA SNHG15通过阻⽌Slug泛素化来稳定Slug
lncRNA SNHG15上调Slug蛋⽩⽔平,对mRNA⽔平⽆影响。炸莲藕片的做法
验证LncRNA SNHG15是通过蛋⽩酶体降解防⽌Slug降解。
验证SNHG15能够抑制BTRC(E3泛素连接酶)介导的Slug的泛素化降解。
LncRNA SNHG15促进体内肿瘤⽣长
3、技术路线图

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