emsa实验方法与过程

更新时间:2023-06-09 15:05:14 阅读: 评论:0

emsa实验方法与过程
EMSA(Electrophoretic Mobility Shift Assay)即电泳迁移实验,是一种常用的蛋白质-核酸交互作用分析技术。它主要基于核酸分子与蛋白质分子相互作用的原理,通过蛋白质与核酸结合后形成的复合物电泳迁移速度的改变,来鉴定蛋白质-核酸的结合情况。下面将详细介绍EMSA实验方法与过程。
材料与试剂
1. 核酸探针:DNA或RNA序列
形容女子好看2. 目标蛋白质:目标蛋白质或酶标记的抗体
3. 电泳buffer:1×TBE buffer  (含10 mM Tris-HCl, 90 mM boric acid, 2 mM EDTA)
4. 端粘性缓冲液:10 × binding buffer ba  (含100 mM KCl, 20 mM HEPES pH 7.9, 1 mM EDTA, 10 mM DTT, 0.1 mM ZnCl2)
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5. 样品加入的pbm:聚乙二醇(20%)
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斗拱的作用传承的近义词6. 聚丙烯酰胺凝胶:8%的聚丙烯酰胺凝胶
实验步骤
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内地女艺人1.核酸标记:将DNA片段的5'末端标记为放射性,通过32P-ATP进行核酸的标记;同时也可利用Bio-11-dUTP、Bio-16-dUTP等进行化学标记。标记方法会根据实验需要而略有不同,详情请查看相应的实验方法。
2. 核酸与蛋白质结合:在一个干净的和核酸自由的管子中,将标记好的核酸与所检测蛋白质混合,恰当的样品加入的pbm(通常为聚乙二醇)会加速蛋白质与核酸的结合。混合物经过旋转或者震荡等操作,使核酸质量较小,蛋白质则质量较大,将以复合物的形式形成。同时也要准备好由对照DNA或RNA组成的对照组。在同一实验中,可能需要同时检验多个不同的核酸与蛋白质结合情况。
3.制备聚丙烯酰胺凝胶:将8%的聚丙烯酰胺凝胶制作成最终电泳的凝胶。注意聚丙烯酰胺浓度和凝胶的稳定度可能会因实验需要而有所不同。
1975年什么命4. 准备电泳buffer:将1×TBE buffer稀释成所需的电泳buffer浓度。
5. 电泳:为了使复合物迁移速度趋向于不同的位置,将聚丙烯酰胺凝胶上分别划定出不同电泳通道。将混合物移至一个或多个通道中,在聚丙烯酰胺凝胶上在所选择的位置上加入适量的样品,再将凝胶进行电泳迁移,电泳结束后将核酸切除,蛋白质分析仍需更长的时间。
结论
EMSA实验可以用于检测蛋白质与DNA/RNA之间的结合情况,可以用于检测转录因子和DNA相互作用、 RNA结构与蛋白质结合、 DNA修饰酶和DNA相互作用等。它的可靠性和准确性使它成为了生物学和分子生物学领域中最常用的实验方法之一。

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标签:蛋白质   核酸   实验   电泳
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