酵母双杂相关步骤

更新时间:2023-06-01 03:09:48 阅读: 评论:0

YPD:
    Difco peptone            20 g/L
Yeast extract              10 g/L
葡萄糖                  20 g/L
YPD固体:
    Difco peptone            20 g/L
Yeast extract              10 g/L
葡萄糖                  20 g/L
Difco Agar (for plates only)   20 g/L
调pH至6.5,灭菌条件为高压1210C灭15 min(以下所涉及的需要加入碳源的培养基类型均与此相同)。
YPDA:
    YPD冷却至550C,添加5mL/L 0.6% Ade。
每升加YMB酵母无氨基氮源6.7g(威佳),-leu氨基酸(takara),无水葡萄糖20g,琼脂20g,pH5.8
SMART III Oligo ( 5'-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTGGCCATTATGGCCGGG-3')
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CDS III Primer (5'-ATTCTAGAGGCCGAGGCGGCCGACATG-d(T)30VN-3')*
5' PCR Primer (5'-TTCCACCCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTGG-3')
3' PCR Primer (5'-GTATCGATGCCCACCCTCTAGAGGCCGAGGCGGCCGACA-3')
AD 5' CTATTCGATGATGAAGATACCCCACCAAACCC
AD 3' GTGAACTTGCGGGGTTTTTCAGTATCTACGAT
一、利用CDS引物合成单链cDNA
1.灭菌离心管加
1-2ul  RNA( 0.025-1.0ug的m RNA)
1.0 ul  CDS 引物
加入灭菌去离子超纯水至总体积为4.0ul.
2.混匀
3.72水浴2分钟
4.冰水中冷却2分钟
5.轻微离心
6.加入一下试剂
2.0 ul  5× First-Strand Buffer
1.0 ul  DTT( 20m M)
1.0ul  d NTP (10m M)
1.0ul  MMLV反转录酶
7. 混匀
8. 42 水浴10分钟
9.加入 1.0ul的 BD SMART 寡核苷酸
10.42 水浴1小时(加石腊油)
11. 扩增仪上75放置10分钟,终止合成反应
12.冷却至室温,加入2.0ul(2.0单位)的RNa H.
13 37温浴20分钟。
14.-20条件下放置备用。
四、用LD-PCR扩增单链Cdna
1.PCR扩增仪预热至95
2.在离心管加入如下药品
2.0ul  单链cDNA
70ul  去离子超纯水
10ul  10×BD Advantage 2 PCR 缓冲液
2 ul  50×d NTP Mix
2 ul    5 PCR引物
2 ul    3 PCR引物
10ul    10× GC-Melt 溶液
2ul    50×BD Advantage 2 聚合酶混合液
3.小心混匀,轻微离心
4.加2滴灭菌石蜡油
5.扩增程序
95    30 c
N个循环:
      95  10 c
      68AREM  6  min (注意:每个循环过后,退火时间增加5秒
68      5min
6.取7ul扩增产物,加Marker,在1.2%的琼脂糖胶电泳,与附录A中图谱对照,检测扩增结果。
7.-20条件下放置备用。
五.用BD CHROMA SPIN  TE-400 滤柱纯化回收双链cDNA
1.取出滤柱,上下晃动几次,每95ul样品用一个滤柱
2.用食指和拇指夹出滤柱活动管子,把滤柱套入收集管,保存好两端帽子备用。
3.700×g 离心5分钟。
4. 取下滤柱,丢弃收集管和滤液。
5.滤柱重新套入另一2ml的收集管,小心的把95ul的cDNA样加到滤柱胶面中央,以免样品从胶面的内侧流出。
6. 700×g 离心5分钟。
军训新闻稿7.取下滤柱和收集管,纯化了的cDNA 集中在收集管的底部。
8.来自同一样品,纯化了的cDNA放入统一离心管。
9.加入如下试剂:
  1/10  体积  乙酸钠(3M;PH 4.8
  2.5  体积    95%乙醇(-20
10.轻微摇匀
11.-20条件下过夜。
12.室温下,14000rpm 离心20分钟。
13.小心吸出上清液
14.轻微离心使余液全都集中到离心管底部。
15.小心吸出余液,cDNA小团块在空气中干燥10分钟。
16.用20ul的去离子超纯水溶解cDNA小团块,-20条件下放置备用。
cDNA文库的建立
·YPD培养基加入25%甘油
·准备PEG/LiAc 溶液(参考部分)
1×PEG/LiAc sol: 8ml 50% PEG, 1ml 10xTE, 1ml 10xLiAc,
1.1×TE/LiAc施工方案审批流程:1.1ml 10xLiAc, 1.1ml 10xTE, 7.8ml H2O (water)
1.酵母感受态细胞的准备
在YPDA培养基上接种酵母AH109菌株,培养时间4周,菌落直径为2-3mm
15ml灭菌离心管加3ml的YPDA液体培养基,每管一个菌落,30℃,250rpm,8h
吸取5μl种子液加入到含有50ml YPDA的250ml三角瓶中
30,250rpm,16~20h 测OD600=0.15~0.3,将培养液移至50ml离心管
室温,700rcf,5min,弃上清液
用100ml YPDA重悬沉淀,用500ml三角瓶摇,30,250rpm,3~5h
测OD600=0.4~0.5,将培养液分装到两个50ml离心管,室温,700rcf,5min,弃上清液
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每管加入30ml 去离子超纯水,重悬沉淀,700rcf,5min,去上清
不必了
用3ml 1.1*TE/LiAc悬浮菌体,吸出与两支1.5ml离心管,12,000rpm 15~30s
弃去上清液,每管加入600μl 1.1*TE/LiAc 重悬沉淀,备用
Caution:制出的感受态必须马上使用
以下是转化过程
16.在一个15ml的离心管里加入如下药品
    20ul  ds cDNA
    6ul    pGADT7-Rec (0.54ug/ul)
    20ul    Herring Testes Carrier DNA(已变性)
( Herring Testes Carrier DNA的变性:离心管加入约50ul的HerringDNA,100条件下变性5分钟,迅速在冰水中冷却。加入15ml的离心管前要再重复变性冷却一次)
17.在DNA中加入600ul的感受态酵母细胞
18.轻轻摇匀
19.加入2.5ml的PEG/LiAc溶液
20.轻轻摇匀
失去后才懂得珍惜
21.30条件下温浴45min,每15分钟混匀一次)
22.加入160ul DMSO,摇匀,42心理健康教育的内容条件水浴20分钟,每10分钟摇匀一次
23.700×g 离心5分钟
24.去掉上清夜,每个管加入3ml的YPD Plus液体培养基(注意:不能用标准的YPD培养基)
25.30摇菌90分钟。
26.700×g 离心5分钟
27.去掉上清夜,加入15ml 0.9%的NaCl溶液。
SD/-Leu培养基上筛选转化株
28.在准备好的150mm含培养基的培养皿上涂抹150ul的菌液(约需100个)
(在100mm SD/-Leu含培养基的培养皿上分别涂抹1:10,1:100,1:1000,和1:100
00稀释了的菌液,以检测转化的效率)
29.培养皿倒置,在30条件下培养直至菌落出现,(一般要培养3-6天)
30.计算转化效率:一般要求1×106转化株/3ug pGADT7-Rec
转化株收集
31.培养皿在4条件下保存3-4个小时

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