怎么设计引物

更新时间:2023-04-18 04:02:16 阅读: 评论:0


2023年4月18日发(作者:送战友简谱)RACE引物设计原则
对于堂吉诃德读后感 用差海的简笔画 异显示或者抑制减法杂交、RNA指纹、EST芯片及兼并引物扩增等方法得到
DNA片断,可利用SMART cDNA Amplification技术克隆全长cDNA,引物设计方法如下:
(一)如欲克隆的基因在GenBank已列出的26种生物中,且是多基因家族的一个成员,应
先上网进行BL外国经典电影推荐 AST(/BLAST),为了提高扩增的特异性,应选择
没有同源性的区域设计引物。
(二)基因特异性引物(gene special primerGSP)和巢式引物 (nested primerNP)的设计
方味道英文 法:
15RACE引物设计
UPM序列(45bp)加在已知部分序列的5′端并设定为上游引物,在序列的5′端附近
寻找合适的片端选作下游引物GSP1。将NUP序列(23bp)加在已知部分简简单单的幸福 序列的5′端并设
定为上游引物,在序列的5′端附近寻找合适的片端选作下游NP引物NP1。用oligo 6.0
件分析引物。
23RACE引物设计
UPM反向互补序列(45bp)加在已知部分序列的3′端,并设定为下游引物,在序列的
3′端附近寻找合适的片端选作上游序列GSP2。将NUP反向互补序列(23bp)加在已知部
分序列的3′端并设定为下游引物,在序列的3′端附近寻找合适的片端月经期能喝中药吗 选作上游NP引物
NP2。用oligo 6.0软件分析引物。
(三) 3′和5RACE引物设计原则:
1)引物长度咖啡因的副作用 :以23~28个碱基为宜,最好不超过30个碱基;
2GC含量为50%~70%
3Tm最好>70℃,至少≥65℃(用软件或经验公式提供的退火温度只是一个参考值,在
具体操作中要灵活多变);
4GSP5’端6个碱基与UPM两条引物的3’端互补碱基应<4NP5’端6个碱基
NUP3’端的互补碱基应<4
5NP不能与GSP重叠;
63′和5RACE扩增产物最好有重叠部分,以便全序列的拼接。(实际运用中是否真的要
存在重叠部分,因为片段是已知的,以及race引物和巢式引物设计的位置怎么定,race
物在外?巢式引物在内?还是?)

(四) 如果是多基因家族的,且已知的信息有限,RACE的产物可能出现多条带,可先将
电泳后胶上的条带转到尼龙膜上,冬天去哪里旅游好 在EST序列中克隆一DNA片段,用32P-dCTP标记,
Southern印迹法,即可鉴定出来。(因为是把片段切下来做的,那么就是以该片段作为唯一
模板,为什乱世俱灭 么race还会出现多条带?难道多基因家族有可能存在分子量一致的情况?)

用的试剂盒
引物设计的具体注意事项
Oligo dG 后面的10是什么意思?十个Gadaptor prim跆拳道腿法 er是现成的还是自己设计的?


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