2023年4月17日发(作者：天鹅花)microRNA
的命名规则
microRNA，或称miRNA，是普遍存在于生物体内的一类小分子非编码RNA，
其成熟序列长度在22nt左右。microRNA成熟序列是由Dicer酶从前体microRNA
pre-miRNApre-miRNAprecursormiRNAhairpin
）通常具有发夹状（、切割而成，（）
二级结构。
目前以miRBa数据库为依托，一套包括了microRNA前体及成熟体的完整
的命名体系已经被建立起来，了解这一命名体系有利于我们快速明确一条已知
microRNA
分子的信息。
由于microRNA是一类非编码的调控分子，且microRNA分子与其调控的目
标序列具有一对多的对应关系，很难用一种功能描述或一个蛋白质名称表示
“”
（类似于现有的基因数据库命名方式），因此microRNA的命名是根据其发现的
时间顺序（递交数据库或发表的顺序）和其分子来源作为依据的。
下面用举例的方式来对这一命名体系做一个简要的介绍，需要说明的是这些
例子并不一定代表具有某一名称的microRNA真实存在于miRBa数据库中。
以下部分内容针对动物来源的，植物来源的及病毒
microRNAmicroRNA
microRNA
的命名会在后面加以说明。
以一个基本的命名为例：
hsa-miR-122
前三个字符hsa表示的是该microRNA分子所属的物种（hsa豆腐鸡蛋羹
表示人类，Homo
sapiens），miR是microRNA数据库内的成熟体microRNA标识，122则是该
microRNA所属家族成员被发现或者被提交数据库时按照顺序被给予的一个流水
号。假设在此之后又有一条新的被发现于其他物种比如小鼠，那么那
microRNA
个新的microRNA就会被按照规则被命名为mmu-miR-123。
microRNApre-miRNA
的发卡结构状前体在命名时中间的部分被写成小写的
mirmiRBaIDMImiRmiRBa
，在里的编号以开头，而成熟体简写成，在
数据库里的ID编号以MIMAT开头。再根据其物种名称，及被发现的先后顺序
加上阿拉伯数字，如的前体是。
cbr阅读伴我成长作文
-miR-42cbr-mir-42
由于不同的前体序列（pre-miRNA）或者基因组上的不同位置（genomicloci）
可以产生相同序列的成熟microRNA分子，当存在这种情况时，则在基本命名后
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增加一个编号，，如hsa-miR-19b-1和hsa-miR-19b-2，其前体分别位于第13号染
色体和性染色体。
X
由不同前体序列产生的具有高度同源的成熟体命名时在数字后加
microRNA
上英文小写字母(a,b,c,…)，如hsa-miR-12a、hsa-miR-12b等。
microRNA的前体pre-miRNA其长度大约为70~80nt，其形成发夹结构的两
个臂都可能分别产生成熟的，在这种情况下则以的成熟体
microRNAmicroRNA
产生于pre-microRNA的5`端臂还是3`端臂来命名，分别加上后缀“-5p”和“-3p”
分别命名。如和，表明这两条分别
asu-miR-100b-5pasu-miR-10自省作文
0b-3pmicroRNA
从asu-mir-100b前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。
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少部分例外是在确定这一命名三字经千字文
体系之前发现的microRNA，则保留原来名字，
如。
cel-let-7
植物microRNA命名与前面所说的动物microRNA命名方式略有不同，大致
如下：
①前体：以取代命名顺序，且其后不跟有短线，如
microRNA“MIR”“mir”“-”
osa-MIR420。
②成熟体：在与其后的数字字母等编广东甜品
号之间没有，如
microRNA“miR”(&)“-”
ath-miR420。
病毒microRNA及其前体命名方式同动物的命名方式一致。
【注】在旧有的命名体系中针对这一情况是先确定两个不同成熟体的表达水平，表达
量较高的microRNA后面不加任何符号，而表达量较低的microRNA后面加上*号，如
mmu-miR-7和mmu-miR-7*。然而并不是每次都能精确地确定其不同成熟体的表达量高低，还
有组织特异性表达等因素，在这种情况下才以microRNA的成熟体产生于pre-miRNA的5`端
臂还是3`端臂来命名，分别加上后缀“-5p”和“-3p”分别命名。如asu-miR-100b-5p和
asu-miR-100b-3p，表明这两条microRNA分别从asu-mir-100b前体的5’端臂和3’端臂加
工而来的。
类似地，在旧有规则的命名中，有时也会以“-s”和“-as”来命名，但自从miRBa18
Version开始已经取消了这种命名方式，具体信息可以参见参考资料3。
1
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microRNA命名体系简要示意图
参考资料：
1.最早确定microRNA命名规则的论文：
Auniformsystem带安字的成语
formicroRNAannotation.(2003)AmbrosV,BartelB,BartelDP,
BurgeCB,CarringtonJC,ChenX,DreyfussG,EddySR,Griffiths-JonesS,MarshallM,
MatzkeM,RuvkunG,TuschlT..9(3):277-279;
RNA
e网站对命名规则的介绍：dothemiRNAnames/identifiersmean?>
/help/
e网站对新的命名规则的说明：inaname>
/blog/2011/04/whats-in-a-name/
2015年10月
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