毕赤酵母电转化方法及转化子的筛选
菌体的准备:
1. 挑取酵母单菌落,接种至含有5ml YPD 培养基的50ml 三角瓶中,30℃、250-300r/min培养过夜;
2. 取100-500µl (≤1:100)的培养物接种至含有50ml 新鲜培养基的200mL三角摇瓶中,28~30℃、250-300r/min培养过夜 (约20h),至OD600 达到1.3~1.5;
3. 将细胞培养物于4℃,1500g 离心5min,用50ml 的冰预冷的无菌水将菌体沉淀重悬;
4. 按步骤3 离心,用25ml的冰预冷的无菌水将菌体沉淀重悬
5. 按步骤3 离心,用2-5ml,1M的冰预冷山梨醇溶液将菌体沉淀重悬;
6. 按步骤3 离心,用160µl的冰预冷的1mol的山梨醇溶液将菌体沉淀重悬,其终体积约为240 ul;
工作态度和责任心总结
备注:可将其分装为80 µl 一份的包装-70冷冻起来,2周之内使用,但会影响其转化效率。
比如常见的pPIC9K的载体转GS115一般先用MD平板初筛,然后长出的克隆子可以挑到不同浓度的含G418抗性的YPD平板上筛选高拷贝。对正确筛选出的单菌落接YPD小瓶摇活后,转大瓶BMGY摇瓶发酵。一般对于甲醇诱导菌株,摇瓶一天左右后开始补加甲醇,就类似BMMY的功能了。
✓KM71冬瓜糖的做法比GS115生长的要慢。毕赤酵母都应该是白色菌落的
✓对于LOX家族蛋白的表达,可尝试在酵母培养基中加入 Cu2+ 离子,提高表达量和蛋白活性?
菌种保存:
挑单克隆到YPD中培养18-24h,然后取菌液以1:1加入30%灭菌甘油, -80oC 拯救我们的城市ul/管冻存
(一般用10ug以上质粒用SalI酶切,然后直接加乙醇沉淀,70%乙醇洗一遍,约20ul ddH2O重溶。转化效率一般大于100个克隆每ugDNA。建议你不要用胶回收kit,回收的DNA可能还有盐,导致电击时放电时间很短。
乙醇沉淀主要步骤如下:
1)酶切体系(80ul)中2倍体积的无水乙醇加1/10体积的PH5.2 NaAC,混匀ﻫ2)-20℃ 20分钟沉淀ﻫ3)13200rpm,20min,离心后弃上清ﻫ4)75%乙醇300ul轻轻洗,同上离心5min,弃上清
5)37 度烘箱至无乙醇气味(或是用摇床的出风口吹出的暖风吹)。ﻫ6)20ul ddH2O重溶)
电击转化:
8. 将5~20 µ g 的线性化DNA 溶解在5~10 µ l TE溶液中,与80 µ l 的上述步骤6 所得的菌体混匀,转至0.2cm 冰预冷的电转化杯中;
9. 将电转化杯冰浴5min;
10. 根据电转化仪提供的资料,参考其他文献及多次摸索,确定合适的电压、电流、电容等参数,按优化的参数,进行电击;
11. 电击完毕后,马上加入1ml 1M的冰预冷的山梨醇溶液将菌体混匀,转至1.5ml 的EP管中;(置于30度摇床低速培养1h,再涂板)
12. 将菌体悬液涂布于MD平板上,每200~600 µ l 涂布一块平板;
13. 将平板置于30℃倒置培养,直至单个菌落出现 (3-4天)。
推荐:电压1.5kV ;电容25µF ;电阻200 Ω。电击时间为4 ~10mc。
Pichia酵母表达直接PCR鉴定重组子的方法
五陵豪杰1.平板上的菌落长到肉眼可见时(约12小时);
2.取1ml酵母悬液4000rmp离心,pbs重悬,煮沸5mins,放到冰上5mins,直接就可以用做pcr的模板了
3.将除了模板之外的其它PCR反应液的组分准备好,并分装。
3. 用灭菌的牙签挑取菌落,在PCR管中涮一下, PCR扩增,
利用5’AOX 1和3’AOX 1引物对转化子进行PCR复筛,同时检测基因插入(如果重组质粒以单交换的方式整合到Pichia pastoris基因组,则会扩增到两条带,一条为2.2kb(KM71为3.6kb)宿主茵AOXI基因,另一条为包括目的基因和成熟肽序列和a-factor信号肽序列的片段。)
Each 50 µl aliquot of competent Pichia cells with 3 µg linearized plasmid DNA will yield 50 colonies on lective medium.
Muts 表型重组酵母的诱导表达实验
As a general rule when inducing expression, never allow cultures to be more than 10-30% of your total flask volume.
1. 挑选一单菌落,置于装有50ml MGY、BMG 或BMGY培养基的500ml 摇瓶中,于28-30中班绘画°C /250-300 rpm 培养至OD600 = 2-6 (~16-18 h);
2. 室温下1500~3000g 离心5min,收集菌体,用1/5到1/10原培养体积的MM, BMM或 BMMY重悬菌体(约2.5~5ml );
3. 将步骤2 所得的菌液置于100ml 的摇瓶中,用双层纱布或粗棉布封口,放置于28-30 °
C/250-300 rpm 的摇床上继续生长;
4. 每24h 向培养基中添加100 %甲醇至终浓度为0.5 ~1.0%;
5. 按时间点分别取菌液样品,取样量为1ml,置于1.5ml EP 管中,最大转速离心2~3min ,分别收集上清和菌体,分析目的蛋白的表达量和菌液最佳收获时间。时间点一般取:0 、24、48、72、96和120h;
6. 对分泌表达,分离样品的上清液;对胞内表达,分离样品的菌体沉淀,带检测样品用液
氮或干冰速冻后,于-80 °C 保存备用;
7. 可以用SDS-PAGE、Western-Blot及活性实验检测与鉴定重组蛋白的表达。
Mut+表型重组酵母的诱导表达实验
1. 挑选一单菌落,置于装有25ml MGY、BMG或BMGY培养基的250ml摇瓶中,于28-30°C/250-300 rpm培养至OD600 = 2-6 (~16-18 h);
2. 室温下1500~3000g离心5min,收集菌体,用MM、BMM或 BMMY重悬菌体,使OD600 =1.0左右(约100~200ml);
3. 将步骤2所得的菌液置于1L的摇瓶中,用双层纱布或粗棉布封口,放置于28-30°C/250-300 rpm的摇床上继续生长;
4. 每24h向培养基中添加100% 甲醇至终浓度为0.5~1.0%;
5. 按时间点分别取菌液样品,取样量为1ml,置于1.5ml EP管中,最大转速离心2~3min,分别收集上清和菌体,分析目的蛋白的表达量和菌液最佳收获时间。时间点一般取:0、6、12、24、36、48、60、72、84和96h;
6. 对分泌表达,分离样品的上清液;对胞内表达,分离样品的菌体沉淀,带检测样品用液氮或干冰速冻后,于-80°C保存备用;
出行攻略
7. 可以用SDS-PAGE、Western-Blot及活性实验检测与鉴定重组蛋白的表达。
单杠练腹肌BMGY和BMMY的换液方式有2种:
1)一种是离心换液,即在生长培养结束后,转移到灭菌大离心管中,4000rpm室温离心5分钟后,用BMMY洗下菌体,再转移到摇瓶,整个过程均用灭菌移液管操作。
2)另一种是静止换液,即在生长培养结束后,将摇瓶在无菌室静止4小时后,直接在酒精灯旁倾倒培养液,再加入诱导培养基,此种方法的缺点有少量生长培养基残留。
是离心换液或者静止换液,到底那个好,只有根据自己的实验结果来考量。如果只是从防治污染的角度来说,静止换液也好一些,因为操作毕竟少一些,速度也快。
家长评语用新开启的分析纯甲醇,一直放在无菌室里面,每次直接用灭菌TIP吸取加入摇瓶就可以了。也有人试过用膜过滤,结果膜都溶解了。
菌体是在BMMY中培养的,可以不用BMMY做对照,在600nm处测OD值,培养基和PBS光吸收都很低,PBS更方便。
麦芽浸提液培养酵母(不换液,补料),生长阶段结束后,密度可达到10-12,诱导培养结束后,密度可达到18左右。
如果用1体积的BMGY,在生长阶段结束后,换液时,加入1/10-1/2体积的BMMY进行诱导培养(即浓缩培养),细胞密度也可达到20以上。
通常,真正的高密度发酵只有在发酵罐里才能实现,OD600可达到40-60及以上。摇瓶很难达到那样的密度,不过可以采取浓缩培养的方式实现高密度。
摇瓶不能像发酵罐那样保证通气量,但可以通过装量来暂时替代这个指标。
Mut+/Muts 的筛选
用Sac I,Sal I or Stu I 线性化插入HIS4 位点的载体转化GS155后,多数转化子应为Mut+,但也有His+Muts的转化子存在(见Invitrogen protocol p36),Not I or Bgl II线性化插入AOX I位点的载体转化GS155后,用MD/MM平板可区分Mut+/Muts。
Use the plates containing the His+ transformants and screen for the Mut+ and MutS phenotype as described below.
1. Using a sterile toothpick, pick one colony and streak or patch one His+ transformant in a regular pattern on both an MM plate and an MD plate, making sure to patch the MM plate first.
2. U a new toothpick for each transformant and continue until 100 transformants have been patched (2-3 plates).
3. To differentiate Mut+ from MutS, make one patch for each of the controls (GS115/His+ MutS Albumin and GS115/His+ Mut+ β -gal) onto the MD and MM plates.
4. Incubate the plates at 30°C for 2 days.
5. After 2 days or longer at 30°C, score the plates. Mut+ transformants will grow well on both MD and MM plates. MutS transformants will grow well on MD plates, but show little or no growth on the MM plates.