在老公的大力支持下,我参加了在首医举办的第八届cochrane培训班,好久没有坐在教室里认真的听课了,感觉真好!
以前也在网上看到过循证医学的介绍,真的不知道如何下手。cochrane很适合急功近利的中国人,如同Medical Hypothes 也是SCI一样。搞科研前要写综述,做临床要懂meta分析。cochrane的meta分析系统,有着非常规范的操作。仅其handbook就有600多页。首先它选择的是最严谨的随机对照实验(RCT, randomized controlled experiment)作为实验的证据,从题目的选择就开始进行注册,题目合理且无重复时才可以进,每一步都需要按照严格的步骤进行,至少需要三个作者进行讨论,还要跟所注册的编辑小组反复进行沟通,修改,才能不断的完善写作。还要学会对收集的资料进行分析,筛选,去除偏倚,制作森林图及漏斗图,估计一篇文章可能要花半年左右的文章,可能像博士论文那样上百页。
对于cochrane我仅仅摸到了门口,里面非常博大精深,很高兴认识这么多新同学,大家一起讨论。在介绍题目时,我是唯一一个用汉语介绍的,当我把题目说出来时,夏老师很遗憾她不会翻译,大家哄堂大笑,不知是笑我,还是笑她,我当然可以用英语讲,只是这样大家就可以听清我的题目了。最后,很遗憾夏老师没有选我的题目进行课堂讨论,因为我的口语不够好,不能直接与Mahesh Jarayam进行交流,好羡慕那个被选中题目的老哥,估计他一定在国外待过。
二天主要学习了检索策略、endnote之应用和revman软件管理三大块内容。下面主要介绍检索策略,只有我讲清楚了,才是我真正学会了:
1. cochrane检索策略的设计:有关传统的pubmed应用见我以前转的帖子。
Cochrane的系统评价对文献检索要求非常高,每一步都要求有记录,都需要信息检索官的参与,需要不同的修改及讨论检索策略。
(1)根据构建临床问题的国际PICO格式确定检索策略(identify concepts)
e.g.incticide-treated vs no incticide-treated bed nets and curtains for preventing malaria
比较杀虫剂和非杀虫剂对疟疾的预防
PICO
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举例
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P-population
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特定人群
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Healthy(健康人群无需检索)
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I-intervention
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干预措施
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incticide-treated nets
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C-comparison
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对照组或用于比较的干预措施
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Non-incticide treated
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陈道明评价丁勇岱O-outcome
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结局
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Infected with malaria 大鱼海棠结局
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Study method (RCT)can be additional concepts
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| | 语文成语 |
(2)为每一个concepts寻找一个关键词或mesh(medical subject headings )
一定要用头脑风暴法(brain storm)将每一个text word的不同写法想出来,如malaria,有的作者有写为plasmodium,blackwater fever 或marsh fever 。
①同时应利用些小技巧查全,如用net*(*为上标,是拓展符合)可以查到 net、nettles、netting、nether、network、nets等词语,避免查不全
②“mosquito net”加上引号表示这两个单词在一起才能查到,不加引号表明即使分开,只要在该文献出现这两个词就能查到。
③?和$可以替代拼写不同、英美语差别及拼写错误,如tumo?r可以查到tumor及tumour。
④Random* near/3 assign* 可以查到Random 和assign及其拓展的相关词之间间隔1-3个单词的文章,在Ovid中near用adj代替,而pubmed则没有near功能。
⑤MeSH可用于medline及cochrane library中。
(3)合并所有的检索策略(overall arch strategy)
Marala*OR
plasmodium*OR
blackwater fever *OR
marsh fever*OR subject
headings(主题词) |
Net*OR
Curtain*OR
Subject headings
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(random* near/3 control* near/3 trial*)OR (double near/3 blind) OR other alternatives OR Subject headings
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奥林匹克口号
Malaria arch and ITN arch and RCT arch
(3)我总结的pubmed之新经验
①原来pubmed和medline不是一回事,medline不同的版本(Version)有不同的方法寻找和使用MeSH。Pubmed可根据关键词(text words)自动寻找MeSH。二者大概有90%的重复文献,因此,两个数据库都要进行检索,然后导入到endnote中去,再删除重复的。同时补充查询emba数据库及cochrane library婢妾基本可以查全。当然还要检索google scholar 及会议文献。
②在pubmed注册一个账号后可以保存查询结果,并为这个save arch起个名字。并可以定制自动更新查询,并发送到邮箱中,非常方便。
③检索时,最好每一个text word单独查,然后再用#1 and #3,或者#3 or #5 等布尔逻辑值进行组合,便于调整检索策略时重新组合。
④如查询文章太多,可选择restrict to MeSH major topic进行设定。
(4)其他收获
cochrane是一个有严密游戏规则的meta,必须按照它的规则来才能写出符合cochrane八股的系统评价文章来。但是真的写起来规则很晦涩,即使经过培训,最好也要有写过的人一
起写。只有质量控制好,所以它影响因子才能6.18。由于每个专业组的编辑回信不一,只要能注册protocol并能完成就能发表,但是太难了!
先写篇质量差的中文meta熟悉软件及方法,在写篇非cochrane的meta分析,有位过来人说,为了找到适合RCT的文章,可能得读上千篇文献。O,my god,有点让人崩溃啊!
Endnote试用版只有1个月的期限,**版有被识别甚至毁坏文件的可能性,可以用notepress等软件代替。
所有的职工薪酬包括meta均应该在revman软件中写,其中涉及多次文件的导入及转换。
熟练应用cochrane library进行查询,目前只看了演示,还没有试用。
Cochrane之第三日 听刘关键老师讲统计(一)
丁香园上讲,刘关键老师是meta分析统计的关键,这一天我一点都没有打瞌睡,感觉好像听懂了,只是还有些知识点,在我以往的学习中是空白,还需要进一步补充,与统计无关。
刘关键老师举了最简单通俗的例子,网络上经常提到的“被涨工资”,有10个人每人工资1000元,大家的平均工资即为1000元,而由一个人工资涨到了夜雨纷纷2000,他们的平均工资应为“1100”?这是国家统计局报道的结果。实际上呢?任何统计都是有条件的,这10个人的
工资数据明显不符合正态分布,应该使用中位数,而不适合用均数来表述,这就是大家“被涨工资”的原因。加减法有条件吗?1kg+1cm?只用同质的东西才能相加,1个香蕉+1军事题材电视剧个香蕉=2个香蕉,而1个苹果+1个桔子=?这就引出了我们在做meta分析时要做异质性的检验。同时提醒大家小学数学很重要,中小学的任何知识是人类最基本的知识和文明。
以下为统计授课内容
一、临床实验中的统计指标
1. 单个试验的率差(RD,rate difference,risk difference):两个发生率的差即为率差,反应实验组发生率比对照组多或少的绝对量。RD=EER(试验组发生率)-CER(对照组发生率),RD值根据指标的不一而解释不同,如指标为死亡,RD>0代表病死率高。如为服药RD>0代表药物有效。(临床医生一定要区分病死率及死亡率的概念)。RD的可信区间,只要不包括0,认为有意义。
2. 单个试验的RR(relative risk,risk ratio )两个率的比值叫做相对危险度,是前瞻性研究中比较常用的指标,说明试验组的发生率是对照组的多少倍。RR=1认为试验组与对照组的发生率相同,RR=1与RD=0意义一致。RR的可信区间用自然对数进行计算(原始数据不能满足正态,用正态近似法计算可信区间),结果计算出来后用反对数将结果变为非对数。
RR的可信区间(CI)只要不包括1,认为有意义。
3. 单个试验的OR在回顾:在回顾性研究(如病例对照研究)中,往往无法得到某事件的发生率CER或EER,也无法计算出RR,但是当发生率很低时(如小于5%),可以计算出一个RR的近似值,即OR(odds ratio)。
4. 数值变量的指标:均数差(MD,mean difference or WMD weighted mean difference)为两个均数的差值,以试验原有的测量单位,真实的反映了试验效果,消除了绝对值大小对结果的影响。
5. 数值变量的指标:标准化标准差(SMD,standarddid mean difference)简单理解为两均数的差值再除以合并标准差的商,不仅消除了某研究绝对值大小的影响,还消除了测量单位对结果的影响。对SMD分析的结果解释要慎重,大小无用,只存在有或没有。
6. 若选择MD和SMD为合并统计量时,其95%CI与假设检验的关系如下:若其95%的CI包含了0,等价于P>0.05,即合并统计量无统计学意义。若其95%CI的上下限均大于0或小于0,等价于P<0.05,即合并效应量有统计学意义。