生工测序问题分析

更新时间:2023-07-19 02:47:38 阅读: 评论:0

1.DNA测序样品的要求
2.常用载体特征
3.PCR类型测序模板注意事项
川麻4. DNA测序常见问题分析及解决办法总结
5. 测序常见问题分析
DNA测序样品的要求
本公司提供如下通用测序引物:M13+,M13-,T7, SP6, T7 ter,BGH rev, pGL3+, pGL3-,pGEX5’,pGEX3’,5’AOX,3’AOX ,a-factor。其他引物请自带或提供序列由我们合成。
常用载体特征
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PCR类型测序模板注意事项
总反应体积建议为50uL或100uL,扩增结束后取3ul用1%左右的琼脂糖电泳检测,应为单一的条带。3ul样品总量不低于50ng(非常小的PCR产物可以酌情减小),PCR产物产量过低说明PCR扩增结果不是很理想,应改进条件重新扩增。
党团活动内容有哪些>求职英文自我介绍对于有杂带和扩增弥散的PCR产物,需经琼脂糖电泳将目的片段切下来并回收,建议将PCR产物作克隆后进行测序。有杂带的和扩增弥散的PCR产物即使通过琼脂糖电泳纯化,测序仍有可能出现双峰等异常结果。
实习报告范文5000字经上述检测合格的PCR产物,需经过琼脂糖电泳纯化去除未反应的引物,dNTP,引物二聚体等影响测序反应的组分。有多种纯化方法可供选择,Promega,Qiagen和生工等公司都有相应的产品可供选择。纯化后的PCR产物经电泳检测估计总量应不低于200ng/Kb(非常小的PCR产物可以酌情减小)。
与质粒模板相比,PCR产物彼此间差异很大,因此,每个PCR模板应尽可能提供相应的PCR退火温度和PCR产物的长度,以供测序时参考。
PCR模板一般不应短于200bp,过短的PCR产物应经克隆后进行测序。
纯化好的PCR产物应溶于双蒸水中,TE缓冲液会严重影响测序反应。海底两万里读后感500
若让公司对PCR产物进行纯化,PCR产物需满足∶总量不低于1ug/kb,片段长度不低于200bp
各种PCR测序模板均应提供相应的测序引物,并尽可能提供引物的全序列,并将引物浓度准确稀释到5pmole/ul 。
引物浓度的换算关系∶
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虾皮紫菜汤总ng数= pmole x 分子量/1000
由于PCR产物测序相对较难,为使您能拿到一个好的结果,请尽量满足上述要求。
DNA测序常见问题分析及解决办法总结

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