Locked Nucleic Acid(LNA)
在研究反义核酸技术的过程中,为了保护反义核酸免受核酸酶的攻击,开发出许多种化学修饰的核苷酸,用于提高靶标亲和性、核酸酶抗性和药物动力学性质。其中Locked Nucleic Acid(LNA)作为一种很有希望的核酸化学修饰技术引起广泛的关注。
定冠词1994年,Rodriguez等再发酵副产物中发现了LNA。1998年,Koshkin实验室进行了LNA的合成和杂交实验。由于LNA和核苷酸在结构上十分相似,它对DNA和RNA 有很好的亲和活性。和其它一些核酸修饰物相比,LNA寡核苷酸有很多优点:和DNA或RNA互补双链有很强的热稳定性,寡核苷酸中掺入一个LNA碱基就可以使熔解温度(Tm)升高4~9℃;
抗核酸酶降解;
针对英语
中心含有7~8个脱氧核苷酸的DNA·LNA gapmer,可以激活RNaH;
分子小,溶解度高,能自由通过细胞膜,机体容易吸收;十个月宝宝早教
体内无毒性;
合成方法简单,可以用DNA自动合成仪合成。
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LNA的结构:
LNA是一种双环状核苷酸衍生物,含有2'-O, 4'-C-亚甲基-β-D-呋喃核糖核酸单体,即核糖的2'氧原子和4'碳原子通过一个亚甲基桥连接起来,如下图。这个环形连接限制了呋喃核糖的灵活性,将其结构锁定成一个刚性的双环模式,增加了磷酸骨架局部结构
的稳定性。这种锁合的结构,有很多立体异构体,现在已经合成的有β-D-Xylo-LNA、α-L-LNA等。通过核磁共振( nuclear magnetic resonance , NMR) 研究水溶性DNA·LNA嵌合体与RNA及DNA杂交后的构型变化发现,LNA能和RNA或DNA互补杂交,碱基配对正常,且每个碱基都是反向构型(β构型)。DNA·LNA嵌合体与RNA杂交时,LNA碱基可诱导侧翼DNA碱基形成α构型。
显示器校准另外,
在LNA/RNA双链中,随着LNA增加,杂交双螺旋结构向A构型
变化。当寡核苷酸的碱基由β构型改变成α构型后,核酶不能识别磷酸二酯键,使得寡核苷酸的稳定性将大大提高。而LNA杂交双链稳定性的提高,可能是也由于磷酸盐骨架局部结构的调整,导致碱基堆积作用力增加的结果。
LNA杂交亲和活性:家常扣肉
通过碱基互补配对,LNA可以和单链DNA (ssDNA)、双链DNA (dsDNA)、RNA及LNA杂交,其中LNA/ LNA是最稳定的碱基配对结构。LNA和单链核苷酸杂交形成双螺旋;在中性pH下,以Hoogsteen氢键结合到特异序列dsDNA大沟处形成三螺旋寡核苷酸(triplex-forming oligonucleotide , TFO)。LNA与互补单链核苷酸杂交,亲和性比相应的寡核苷酸高得多,形成的杂交物的解链温度都很高。在寡核苷酸中每引入一个LNA碱
骆驼祥子的梗概基,Tm值最多可提高9.6 ℃,再引入LNA,每个LNA所带来的ΔTm降低。10nt的寡核苷酸在引入LNA时,对Tm值影响最大。LNA与核酸杂交有严格的序列特异性,比普通寡核苷酸更有效地区分碱基错配(mismatch)。有错配的LNA/DNA双链比相应有错配的DNA/DNA双链更加不稳定,在LNA/DNA双链中的一个错配至少使Tm值下降20℃,而DNA/DNA双链中,一个错配只能使Tm值下降4~16 ℃。另外,LNA与DNA还可形成三明治式的LNA/DNA/LNA结构,也具有很好的热稳定性和生物学活性。
LNA的酶学特性
无巧不成书的意思R N a H是一种广泛存在的酶, 1982年由Criych等发现,特异切割DNA复制时形成的RNA/DNA双链中的RNA链,产生5'-P和3'-OH末端。研究发现,只要有4个nt的DNA片段与mRNA结合,就能激活R N a H降解mRNA。仅含有LNA的寡核苷酸可以和RNA形成A型螺旋,阻碍RNa H降解RNA。但是通过构建中心含有7-8个脱氧核苷酸的DNA·LNA 嵌合体gapmer,可以激活RNa H,并且由于LNA的高亲和性促进RNa H的切割。LNA 寡核苷酸虽然不能激活RNa H,但它可通过空间位阻抑制基因表达。比如:LNA和LNA·DNA可以通过与荧光素酶mRNA上的许多区域结合抑制该基因表达。可以根据不同的实验策略和靶物需求,利用或抑制Rna H活性。另外,LNA/DNA/LNA 嵌合体亦能激活Rna H。
LNA和DNA·LNA还表现出抗核酸酶活性。Wahlestedt等报道,大鼠血清中DNA·LNA寡聚物比其它DNA寡核苷酸类似物更能抵抗核酸酶的降解。可能是由于LNA和DNA的结合,导致外切酶所需的特征结构发生了改变,从而抑制了核酸酶对DNA双链的切割作用。抗核酸酶降解的能力,因LNA和DNA碱基位置的不同而变化,LNA碱基从3'末端移到5'末端,可以降低核酸外切酶的水解。因此,LNA在体内非常稳定。研究发现,在寡核苷酸每个末端仅引入3个LNA,就足够能使它在人血清中的半衰期提高10倍,从未修饰的寡核苷酸的1.5小时增加到15小时。
除了抗核酸酶活性以外,LNA寡核苷酸也较容易被细胞摄取,并且没有毒性作用。通过人乳腺癌MCF27 细胞摄取实验证明,LNA易被细胞吸收,而且很快分布于整个细胞。将含LNA的寡核苷酸分别
注入活的大鼠的脑实质(纹状体) 、大脑室及神经鞘内,未检测出任何毒性作用和组织损伤。在首个LNA的体内研究报道中,大鼠的delta鸦片受体被有效的敲除,并且没有观察到任何毒性作用。随后,完全由LNA组成的寡核苷酸,在体内成功的抑制了RNA聚核酶II大亚基的翻译。这些寡核苷酸还被用于抑制异体移植模型中肿瘤的生长。
LNA以及DNA·LNA具有超凡的靶标亲和活性,抗核酸酶降解,良好的稳定性。因此,利用LNA组成的寡核苷酸和DNA·LNA杂合寡核苷酸进行体外以及体内实验具有许多诱人的前景。