分数线查询circRNA的转录因⼦分析
circRNA的转录因⼦分析
环状RNA研究越来越⽕热，⼤多数的机制在ceRNA机制，结合蛋⽩，翻译蛋⽩上，主要是circRNA的下游机制，上游机制怎么研究呢，我们可以找找哪些转录因⼦调控circRNA表达，哪些RNA剪切因⼦影响circRNA的表达，⽐如这个⽼师也是这么想的：
那如何来找到转录因⼦调控circRNA的关系呢，很简单，我们给出了预测的结果circBa ⼈⼩⿏所有circRNA的预测结果。
视频讲解
我们录制了操作视频，⼿把⼿教您使⽤这个数据，并对可能遇到的问题做了详解。
视频中主要讨论了5个关键问题：
（1）转录因⼦调控环状RNA问题的由来？
（2）为什么要将转录因⼦与环状RNA关联研究？
（3）转录因⼦靶标数据库来源于哪⾥？
（4）数据整理过程是怎么样的？
（5）如何来解读结果并找到调控环状RNA的转录因⼦？
视频教程:
纪伟讲测序-转录因⼦调控circRNA关系预测
分析结果内容如下：
1随机应变
1 分析结果内容如下：
解压⽂件后，搜索circRNA ID 找到circRNA与转录因⼦的对应关系。⽐如⽂件名为hsa_circ_0131431.DEK. ⽂件:
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（1）chrom：转录因⼦结合区域所在的染⾊体；
（2）start：转录因⼦结合区域的起始位点；
腾讯人工客服电话（3）end：转录因⼦结合区域的终⽌位点；
（4）width：转录因⼦结合区域的长度；
公共性
（5）peak_name：转录因⼦结合区域的名称；
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（6）geneChr：靶基因所在的染⾊体；
（7）geneStart：靶基因的起始位点；
（8）geneEnd：靶基因的结束位点；
（9）geneLength：靶基因的长度；
（10）geneSrand：靶基因的链位置；
花样梁祝（11）geneID：靶基因的Enmbl编号；
（12）genename：靶基因的基因名称；
（13）annotation：转录因⼦结合区域在靶基因的位置，Promoter表明转录因⼦与靶基因启动⼦区域结合；
（14）gene_biotype：靶基因的类型；
（15）gene_description：靶基因的基因全称；
（16）transcriptId：靶基因的转录本ID；
（17）distanceToTSS：转录因⼦结合区域到靶基因的距离；（18）summit：检测结果峰值；
（19）uniprotId：转录因⼦蛋⽩的uniprot编号；
（20）tfTile：转录因⼦基因名称；
（21）tfgeneId：转录因⼦基因的Enmbl编号；
（22）tfgene_description：转录因⼦的基因全称；
（23）cell.t：实验细胞系；
（24）treatment.t：实验处理；
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（25）exp.t：实验编号；
（26）peak-caller.t：鉴定软件；
（27）unt：鉴定软件的数量；
（28）unt：实验数量；
（29）unt：鉴定到的总次数，⼩于等于前2个数的乘积。
