酶切位点

更新时间:2023-05-22 13:37:33 阅读: 评论:0

  酶切位点(Restriction Enzyme cutting site):DNA上一段碱基的特定序列,限制性内切酶能够识别出这个序列并在此将DNA序列切成两段。
  可能存在同尾酶,不同酶的识别序列不同,
  有的可能能识别多个酶切位点比如STY1识别序列有WW
PCR引物设计时酶切位点的保护碱基表
    不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求(在本表中没有列出的酶,则通常需在识别位点两端至少加上6个保护碱基,以确保酶切反应的进行。)
寡核苷酸序列
链长
切割率%
2 hr
20 hr
Acc I
GGTCGACC
CGGTCGACCG
haarpCCGGTCGACCGG
8
10
12
0
0
0
0
0
0
Afl III
CACATGTG
CCACATGTGG
CCCACATGTGGG
8
10
12
0
>90
>90
0
>90
>90
Asc I
GGCGCGCC
AGGCGCGCCT
TTGGCGCGCCAA
8
10
12
>90
>90
>90
>90
>90
>90
Ava I
CCCCGGGG
CCCCCGGGGG
TCCCCCGGGGGA
8
10
12
50
>90
丝瓜的英文>90
>90
>90
>90
BamH I
CGGATCCG
CGGGATCCCG
CGCGGATCCGCG
8
10
12
10
>90
>90
25
>90
>90
Bgl II
CAGATCTG
GAAGATCTTC
GGAAGATCTTCC
8
10
12
0
75
25
0
>90
>90
BssH II
GGCGCGCC
AGGCGCGCCT
TTGGCGCGCCAA
8
10
12
0
0
50
0
0
>90
BstE II
GGGT(A/T)ACCC
9
0
10
BstX I
AACTGCAGAACCAATGCATTGG
AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA
CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
22
24
27
0
25
25
0
50
>90
Cla I
CATCGATG
GATCGATC
CCATCGATGG
CCCATCGATGGG
8
8
10
12
0
0
>90
50
0
0
>90
50
EcoR I
GG^AATTCC
CGG^AATTCCG
CCGG^AATTCCGG
8
10
12
>90
>90
>90
>90
>90
>90
Hae III
GGGGCCCC
AGCGGCCGCT
TTGCGGCCGCAA
8
10
12
>90
>90
>90
>90
>90
>90
Hind III
CA^AGCTTG
CCA^AGCTTGG
CCCA^AGCTTGGG
8
10
12
0
0
10
0
0
75
Kpn I
GGGTACCC
GGGGTACCCC
CGGGGTACCCCG
8 commissioned
10
12
0
>90
>90
0
>90
>90
Mlu I
GACGCGTC
fridge怎么读
CGACGCGTCG
8
10
0
25
0
50
Nco I
CCCATGGG
CATGCCATGGCATG
8
14
0
50
0
75
Nde I
CCATATGG
CCCATATGGG
CGCCATATGGCG
GGGTTTCATATGAAACCC
GGAATTCCATATGGAATTCC
GGGAATTCCATATGGAATTCCC
8
10
12
18
20
22
0
0
0
0
75
75
0
0
0
0
>90
>90
Nhe I
GGCTAGCC
CGGCTAGCCG
CTAGCTAGCTAG
8
10
12
0
10
10
0
25
50
Not I
TTGCGGCCGCAA
ATTTGCGGCCGCTTTA
AAATATGCGGCCGCTATAAA
ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTAT
AAGGAAAAAAGCGGCCGCAAAAGGAAAA
12
16
20
24
28
0
10
10
25
25
0
10
10
90
>90
Nsi I
TGCATGCATGCA
CCAATGCATTGGTTCTGCAGTT
12
22
10
>90
>90
>90
Pac I
TTAATTAA
GTTAATTAAC
CCTTAATTAAGG
8
10
12
0
0
0
0
25
>90
Pme I
GTTTAAAC
GGTTTAAACC
GGGTTTAAACCC
AGCTTTGTTTAAACGGCGCGCCGG
8
10
12
24
0
0
0
75
0
25
50
>90
Pst I
GCTGCAGC
TGCACTGCAGTGCA
AACTGCAGAACCAATGCATTGG
AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA
CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT
8
14
22
24
26
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10
>90
>90
0
0
10
>90
>90
0
Pvu I
CCGATCGG
ATCGATCGAT
TCGCGATCGCGA
8
10
12
0
10
0
0
25
10
Sac I
CGAGCT^CG
8
10
10
Sac II
GCCGCGGC
TCCCCGCGGGGA
8
12
0
50
0
>90
Sal I
GTCGACGTCAAAAGGCCATAGCGGCCGC
GCGTCGACGTCTTGGCCATAGCGGCCGCGG
ACGCGTCGACGTCGGCCATAGCGGCCGCGGAA
28
牛的英文30
32
0
10
10
0
50
75
Sca I
GAGTACTC
AAAAGTACTTTT
8
12
10
75
25
75
Sma I
CCCGGG
CCCCGGGG
CClotofCCCGGGGG
TCCCCCGGGGGA
6
8
10
哈尔滨雅思哪里好
12
0
0
10
>90
10
10
50
>90
Spe I
GACTAGTC
GGACTAGTCC
CGGACTAGTCCG
CTAGACTAGTCTAG
8
10
12
14
10
10
0
0
>90
>90
50
50
Sph I
GGCATGCC
CATGCATGCATG
ACATGCATGCATGT
8
12
14
0
0
10
0
25
50
Stu I
AAGGCCTT
GAAGGCCTTC
AAAAGGCCTTTT
8
10
12
>90
>90
>90
>90
>90
>90
Xba I
CT^CTAGAG
GCT^CTAGAGC
TGCT^广州环球雅思CTAGAGCA
CTAGT^CTAGACTAG
8
10
12
14
0
>90
75
join75
0
>90
>90
>90
Xho I
CC^TCGAGG
CCC^TCGAGGG
CCGC^TCGAGCGG
8
10
12
0
10
10
0
25
75
Xma I
CCCCGGGG
CCCCCGGGGG
CCCCCCGGGGGG
TCCCCCCGGGGGGA
8
10
12
14
0
25
50
>90
0
75
>90
>90
注释
1.如果要加在序列的5端,就在酶切位点识别碱基序列(红色)的5端加上相应的碱基(黑色),如果要在序列的3端加上保护碱基,就在酶切位点识别碱基序列(红色)的3端加上相应的碱基(黑色)。
2.切割率:正确识别并切割的效率。
3.加保护碱基时最好选用切割率高时加的相应碱基。

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