各种酶切位点的保护碱基

更新时间:2023-05-20 13:37:12 阅读: 评论:0

各种酶切位点的保护碱基
酶不同,所需要的酶切位点的保护碱基的数量也不同。一般情况下,在酶切位点以外多出    3
碱基即可满足几乎所有限制酶的酶切要求。    在资料上查不到的,我们一般都随便加3个碱基做保护。
寡核昔酸近末端位点的酶切
(Cleavage Clo to the End of DNA Fragments
(oligonucleotides)
为了解不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求,    NEB采用了一系列含识别序列的
短双链寡核昔酸作为酶切底物进行实验。实验结果对于确定双酶切顺序将会有帮助(比如在多接头上切割位点 很接近时),或者当切割位点靠近    nepaDNA末端时也很有用。在本表中
没有列出的酶,则通
常需在识别位点两端至少加上 6个保护碱基,以确保酶切反应的进行。
实验方法:用Y[32P]ATPT4多聚核甘酸激酶的作用下标记    0.1 A 260单位的寡核昔酸。取1 Q
角斗怎么读
已标记了的寡核昔酸与20单位的内切酶,在20°C条件下分别反应2小时和20小时。反应缓冲液 含70 mM Tris-HCI (pH 7.6) , 10 mM MgCI 2,5 mM DTT S适量的 NaCI KCI (视酶的具体要求而 定)。20%得到的反义词是什么PAGE 7M尿素)凝胶电泳分析,经放射自显影确定酶切百分率。
本实验采用自连接的寡核昔酸作为对照。若底物有较长的回文结构,切割效率则可能因为出现
发夹结构而降低。
1
寡核昔酸序列
链长
切割率%
2 hr
20 hr
Acc I
G GTCGACC
8
0
0
CG GTCGAC CG
10
0
0
CCG GTCGAC CGG
12
0
0
Afl III
CACATGTG
8
0
0
CCACATGT GG
10
>90
>90
CCC ACATGT GGG
12
>90
>90
Asc I
GGCGCGCC
8
>90
>90
AGGCGCGCCT
10
>90
>90
TTGGCGCGCC AA
12
>90
2012美国总统辩论>90
n
Ava I
CCCCGGGG
8
50
>90
CC CCCGGG GG
10
>90
>90

TCC CCCGGG GGA
12    >90    >90

scotlandcarrot的音标bit it
BamH 1
CGGATCC G
8
10
25
CG GGATCC CG
10
>90
>90
CGC GGATCC GCG
12
>90
>90
Bgl II
CAGATCTG
8
0
0
GAAGATCT TC
10
75
>90
GGA AGATCT TCC
12
25
中英翻译网>90
BssH II
GGCGCGCC
8
0
0
AG GCGCGC CT
10
0
0
TTG GCGCGC CAA
12
50
>90
BstE II
G GGT(A/T)ACC C
9
0
10
BstXI
AACTGCAGAA CCAATGCATTGG
22
0
0
AAAACTGCAG CCAATGCATTGG AA
24
25
50
CTGCAGAA CCAATGCATTGG ATGCAT
27
25
>90
Clal
CATCGATG
8
0
0
GATCGATC
8
0
0
CC ATCGAT GG
10
>90
>90
CCC ATCGAT GGG
12
50
50
j    —
EcoR 1
G GAATTCC
8
>90
>90
CG GAATTC CG
10
>90
>90
gogodancerCCG GAATTC CGG
12
>90
>90
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