第三节定量构效关系

更新时间:2023-05-06 02:50:59 阅读: 评论:0

第三节定量构效关系
(Quantitative Structure-Activity Relationships,QSAR)
人们研究药物的中心问题是揭示药物的化学结构、理化性质与生物活性之间的内在联系。19世纪中叶就有人提出了它们的定量关系式:
Ф=F(C)    (式2—12)
式中Ф和C分别表示化合物的生物效应和结构性质。后来,Meyer和Overton的研究表明,一些化合物的脂水分配系数与麻醉作用呈线性关系。
直到20世纪60年代,出现了3个QSAR模型,即Hansch分析(Hansch analysis)、Free-Wilson模型(Free-Wilson model)和模式识别(Pattern recognition)。其中应用较广的是Hansch分析。
本节我们主要简要介绍Hansch分析法和三维定量构效关系研究中的比较分子场分析法。
一、Hansch分析
Hansch分析认为,给药后,药物在体内经历随机运行到达靶部位,在那里发生药物—受体相互作用并产生药效(BE)。其中C为药量,A为到达靶的概率,Kx为限速反应的速率常数。
药效与药物的3个基本性质可能存在定量关系。这3个性质是疏水性、电性效应和立体效应。
(一)基本操作步骤
1.确定先导化合物(Lead compound),改变其化学结构的某一基团或某一部分X,用如下通式表示。X可与先导化合物的脂肪链或芳基相联。
设计不同性质的X并合成这些化合物。
2.定量地测定和评价这些化合物的体内或体外活性BE。
3.凋定、计算或查工具书获得这些化合物或X的理化参数,即疏水、电性和立体参数。4.用回归分析建立Hansch方程(式2—13)。
lgP、σ和Es分别表示疏水性、电性和立体性质。回归分析包括选取合适的理化参数,用数学运算求得各系数κ1-κ3和常数κ4。方程的可信性需经统计学检验。
5.若能获得一个初步的方程,再根据方程预测和设计下一批化合物,重复步骤1-4。
(二)结构参数
1.疏水参数
常用的疏水参数有分配系数lgP和疏水常数π(见本章)。lgP常用正辛醇和水系统,用摇瓶法测定。π值可查有关工具书,它具有加和性(式2—14),分子的分配系数lgP 还可通过分子表面积和体积的计算获得。
如普萘洛尔分配系数的计算:
实测值为3.33。
疏水参数也可采用高效液相色谱的t保留和薄层色谱的Rf值等表征疏水性质的数据。
还可用计算机计算分子的体积和表面积等参数,用这些参数计算分子的分配系数。
2.电性参数
电性参数采用Hammett常数σ。它表达取代基的电性效应,对有机化学反应速率或平
衡常数带来定量影响,用Hammett方程表示。
κ0和κ分别表示未取代和取代的化合物的速率常数或平衡常数。ρ为常数,取决于特定的反应,与取代基无关。σ是取代基的特性常数,与反应的性质无关。例如取代的苯甲酸的解离,在25℃的水中,ρ=1,式2—15变为(式2—16),移项得(式2-17)。
取代基为吸电子,K值增大,ρ为正;取代基为推电子,K值减小,ρ为负。因此,口为吸电子或推电子强弱的度量。取代基在苯环上还与具体位置有关,在对位为ρp,间位为ρm。常见取代基的ρp值如下:
脂肪族系列的取代基则有σ。还有反映诱导效应的σI和共轭效应的σR,它们有如下关系:
这些参数可从有关的工具书中查到。
此外,偶极矩、核磁共振的化学位移、红外的吸收谱率等都可作为电性参数。
3.立体参数
经典的立体参数是Taft立体参数Es。在乙酸乙酯酰基的邻位引入各种取代基,它们酸性水解的速率与邻位取代基的大小有关,立体参数Es与水解速率常数的关系用式2—19表示。
κH和κX分别为乙酸乙酯和取代乙酸乙酯的水解速率常数。取代基X为氢时,Es=0;其它取代基的Es值均小于零。
摩尔折射系数MR也可作为立体参数。
式中n为化合物的折光率,Mω为相对分子质量,d为密度。
Verloop用长度参数L和4个宽度参数(B1、B2、B3和B4)作为立体参数。
4.生物活性强度
生物活性强度是指在规定时间内达到同样效应的药物浓度或剂量。例如半有效剂量ED50,半致死量LD50和半抑制浓度IC50等。若C为等效浓度,则生物活性强度也可用1/C 或lg(1/C)表示。C越小,1/C或lg(1/C)越大,则活性越强。为便于比较,浓度和剂量都用物质的量表示。
通过生物活性强度与特性参数回归分析,得Hansch方程:
此式表示生物活性强度与各参数线性相关。也可能有复杂情况,如出现最适疏水常数,此时生物活性强度与疏水参数呈抛物线关系,方程为:
(三)Hansch方程的推导
生物效应速率与三个因素有关,即药物分子在一定时间内通过“随机运行”到达限速反应部位的概率A,
给药的剂量C,引起生物效应的限速反应的速率常数κx。用式2—23表示:
假定A与化合物的分配系数1gPo呈正态分布,即式中a,b为常数,lgPo为正态分布的lgP 的极值,为一常数。
为比较不同的化合物,规定一个相同的生物效应速率,因此,d(BR)/dt为常数κ。式2—23变为:
(四)Hansch分析的意义和应用
Hansch分析能预测同源物的生物活性,有助于认识药物的作用机理,对合理设计药物有一定的指导作用。
具有下列结构的化合物有抗癌活性,它的化疗指数与取代基参数π及σp有如下关系:
式2—29告诉我们,亲水性和推电子基团有利于活性的提高。羟基的π=-0.67,σp=-0.37,合成该化合物,回归分析得n=8时r=0.919。活性的实验值与计算值相当一致。如果某类化合物的活性、毒性与分配系数有图2—24所示关系。其中lgPo(A)和lgPo(B)分别是活性和毒性的极值,构效关系告诉我们,设计分配系数为lgPo(A)的化合物是不可取的,因此时其毒性也相当高。而分配系数为lgPi的化合物是适宜的。

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