fpkm值名词解释

更新时间:2023-07-24 07:20:35 阅读: 评论:0

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郑州少儿培训机构cielFPKM(Fragments Per Kiloba of transcript per Million mapped reads)是一种用于衡量RNA-Seq数据中基因表达量的单位。它考虑了RNA序列的长度和测序深度的影响,使得不同基因在表达量上可以进行比较。
紧张的英文营业税入什么科目>牛津小学英语2b具体地,FPKM值是指每个基因在一个样本中所对应的基因转录本数,除以该基因的长度(单位为千碱基,即kb值),再除以总的基因转录本数,并乘以1百万。因此,FPKM值可以反映出一个基因在RNA样本中的相对表达水平大小。
goldman需要注意的是,FPKM值仅适用于基因转录本的比较,而不能用于跨样本的基因表达量比较。此外,随着新一代RNA测序技术的发展,FPKM已经被更准确的表达量单位如TPM (Transcripts Per Million)所取代。
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标签:基因   表达   样本   单位   测序   科目   提示
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