从TCGA数据中提取lncRNA(这是一个找bug教程)

更新时间:2023-07-24 06:51:57 阅读: 评论:0

type=="transcript" 说明我要的是转录本
gene_biotype="protein_coding" 说明基因类型要的是蛋⽩质编码基因
transcript_biotype %in% ncRNA 是要指定的⼏种ncRNA类型
这逻辑没⽑病
跑了之后,
kgs
曲轴结构
comb标红处可以看出,蛋⽩质编码基因,对应着的转录本类型有且只有procesd_transcript
特朗普被宣判无罪那pro c esd_tr a nsc ript⼜是什么呢?短语翻译
百度肯定不会告诉我们答案,呵,百度,你对⼒量⼀⽆所知。charterparty
reply过去式
正确上⽹后
西点培训学校
原⽹址:bl/info/about/gene_and_transcript_types.html
可见,procesd_transcript不含ORF,包含LncRNA, ncRNA和unclassified procesd transcript。由
于transcript_biotype中已经含有"n_overlapping", "lincRNA", "3prime_overlapping_ncRNA"等很多种,所以我推测, 此处的procesd_transcript就是未分类的转录本。元宵节 英文
因此果⼦⽼师的那句话是对的,⾄少GTF告诉我们,⼀个编码基因也有可能转录出⾮编码基因的。
由于我的分⼦⽣物学底⼦⾮常弱,还请各位前辈多多指教。crawling
那么,如果想从TCGA⾥提lncRNA,不要蛋⽩质编码基因转录出来的该怎么写

本文发布于:2023-07-24 06:51:57,感谢您对本站的认可!

本文链接:https://www.wtabcd.cn/fanwen/fan/78/1114121.html

版权声明:本站内容均来自互联网,仅供演示用,请勿用于商业和其他非法用途。如果侵犯了您的权益请与我们联系,我们将在24小时内删除。

标签:基因   编码   转录   肯定   西点   结构   看出   包含
相关文章
留言与评论(共有 0 条评论)
   
验证码:
推荐文章
排行榜
Copyright ©2019-2022 Comsenz Inc.Powered by © 专利检索| 网站地图