每⽇paper-20211104-鸟类⽐较基因组学
Den sampling of bird diversity increas power of comparative genomicsday by day什么意思
2020 年发表在 Nature 上。
clo to you卡朋特全基因组测序为⽣命之树的构建和⽣物多样性的评估增加了许多可⽤的数据。之前的研究已经表明,如果在各类群间的采样分散的话,会使系统发育关系的结果不准确,并且在多样性的分析中只能了解基因组多样性的⼀⼩部分。
empties
联合国托管理事会研究者们对来⾃鸟类 92.4% 的科的 363 个基因组进⾏分析,其中包括 267 个在 Bird 10,000 Genomes (B10K) Project 中新测序的基因组。研究者们使⽤不需要全基因组参考序列的⽐对⽅法,研究了各鸟类⽀系的同源区域并且发现⽐已发表的要多很多。
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密集取样的⽐对(密集取样指的是多个类群都有样品)让我们能够在单碱基⽔平上研究选择,并且发现了⽐已发表的两倍还要多的保守位点,以及⾮编码 DNA 中的弱的选择作⽤。
研究表明,在⽐较分析中提⾼使⽤的基因组的多样性能够让我们了解更多的共有的、以及⽀系特异的 variation,并且帮助我们了解基因组characteristics。
上海塞万提斯学院研究结果能够帮助跨物种⽐较分析、以及物种的保护。收敛函数
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印度留学中介Fig. 1 Newly quenced genomes denly cover the bird tree of life.The 10,135 bird species 11,12 are shown on a draft phylogeny that synthesizes taxonomic and phylogenetic information36 (Supplementary Data). In total, 363 species, covering 92.4% of all families, now have at least 1 genome asmbly per quenced family (purple branches). The grey arc marks the diver Pasriformes radiation, with 6,063 species, of which 173 species have genome asmblies now. Chicken (*) and zebra finch (**) are marked for orientation. Paintings illustrate examples of quenced species.