威尼斯商人英语剧本第36卷第2期2018年4月海洋科学进展A D V A N C E S I N MA R I N E S C I E N C E V o l .36 N o .2A p
r i l ,2018海洋弧菌(V i b r i o s p .Q D -5)褐藻胶裂解酶基因的克隆和生物信息学分析
晁雅熙，王淑艳，吴谡琦，陈 颢
(国家海洋局第一海洋研究所，山东青岛266061)收稿日期:2017-11-23资助项目：国家重点基础研究计划 超深渊生物群落及其与关键环境要素的相互作用机制研究(2015C B 755906)
关于爱的小故事；海洋公益性行业科研专业 基于海洋微生物发酵的新产品开发技术研究与应用(201505032)作者简介：晁雅熙(1990-)，女，山东菏泽人，硕士，主要从事微生物功能酶方面研究.E -m a i l :y x c h a o @f i o .o r g .c n *通讯作者：陈 颢(1964-)，男，江苏南京人，博士，主要从事深海微生物功能酶方面研究.E -m a i l :h c h e n @f i o .o r g .c n (王佳实 编辑)摘 要：以海洋弧菌(V i b r i o s p
英语学习心得.Q D -5)的基因组为模板，使用设计的褐藻胶裂解酶引物进行P C R 扩增㊂将目的基因克隆至p e t -22b (+)载体后进行测序㊂测序结果显示，基因a l y
艾滋病的英文简称是-I I 的大小为2170b p ，预测编码含有723个氨基酸的蛋白质㊂对该蛋白质进一步进行了生物信息学分析㊂利用P r o t P a r a m 和P r o t S c a l e 对蛋白质的理化性质进行sugar bowl
分析，结果表明，蛋白质A l y -I I 的理论分子质量为85.6k D a ，理论等电点为5.1，并且是一种亲水性蛋白㊂利用软件M E G6.0对蛋白质A l y -I I 进行系统发育分析，结果显示，蛋白质A l y -I I 很可能是P L -17家族的褐藻胶裂解酶㊂利用同源建模法构建蛋白质A l y -I I 的三维结构,A l y -I I 含有2个结构域，分别为(α/α)6
t o r o i d 结构域和β-s h e e t 结构域㊂without you 歌词
关键词:V i b r i o s p
.；褐藻胶裂解酶；基因克隆；生物信息学分析中图分类号:Q 939.97 文献标识码:A 文章编号:1671-6647(2018)02-0290-11
d o i :10.3969/j .i s s n .1671-6647.2018.02.014褐藻胶是一类主要存在于褐藻细胞壁中的水溶性酸性多糖，由β-D -甘露糖醛酸和α-L -古洛糖醛酸组成,2个单体之间通过α-1,4-糖苷键可组成3种不同的褐藻胶分子，分别为多聚甘露糖醛酸(p o l y
M )㊁多聚古洛糖醛酸(p o l y G )和杂聚物(p o l y
GM )[1]㊂某些细菌也能合成褐藻胶，保护它们免受抗生素等有害因子的伤害[2]㊂褐藻胶寡糖是褐藻胶降解而形成的产物，已经广泛应用于食品和医药行业[3-5]㊂褐藻胶裂解酶是一种降解褐藻胶的工具酶，
能够以β-消去方式作用于褐藻胶2个单体分子形成的糖苷键，将褐藻胶大分子降解成小分子的褐藻胶寡糖㊂褐藻胶裂解酶的来源十分广泛，包括细菌㊁海洋无脊椎动物㊁海洋藻类㊁真菌和病毒等，其中细菌是褐藻胶裂解酶的主要来源㊂目前，许多不同来源的褐藻胶裂解酶基因已经被克隆，并对褐藻胶裂解酶进行了表达㊁鉴定和性质表征㊂根据褐藻胶裂解酶底物特异性的不同，褐
前呼后拥藻胶裂解酶主要被分为两种，一种是专一性降解p o l y M 的p o l y M 裂解酶(E C 4.2.2.3)，另一种是专一性降解p o l y G 的p o l y G 裂解酶(E C 4.2.2.11)㊂另外，还有少数裂解酶对p o l y M 和p o l y G 同时具有活性，这类酶被称为双功能裂解酶㊂根据褐藻胶裂解酶作用方式的不同，褐藻胶裂解酶被分为内切型和外切型两种[
标准韩国语mp312]㊂内切型褐藻胶裂解酶作用于褐藻胶分子内部的糖苷键，主要产生不饱和寡糖；外切型褐藻胶裂解酶从褐藻胶分子的一端对褐藻胶进行降解，可以产生单体分子㊂目前，在已发现的褐藻胶裂解酶中，大部分都是内切型，外切
型褐藻胶裂解酶只占很小一部分㊂在碳水化合物活性酶数据库(C a r b o h y d r a t e -A c t i v eE n z y m e s ,C A Z y
)中，褐藻胶裂解酶属于多糖裂解酶(P o l y s a c c h a r i d eL y a s e ,P L s )中的一类㊂根据蛋白质分子一级结构的不同，多糖裂解酶被划分到22个不同的家族中，褐藻胶裂解酶分布在7个不同的家族中，
english song分别为P L -5,P L -6,P L -7,
P L -14,P L -15,P L -17和P L -18㊂大部分内切型褐藻胶裂解酶属于P L -5和P L -7家族,
而外切型褐藻胶裂解
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