本文作者:kaifamei

基于RPA-侧流层析技术检测转基因玉米MO810的引物组和方法

更新时间:2024-12-23 10:52:55 0条评论

基于RPA-侧流层析技术检测转基因玉米MO810的引物组和方法


基于rpa-侧流层析技术检测转基因玉米mon810的引物组和方法
技术领域
1.本发明涉及基因检测领域,具体涉及一种基于rpa-侧流层析技术检测转基因玉米mon810的引物组和方法。


背景技术:



2.mon810品系转基因玉米可用于饲料食品的加工原料,其外源基因来源于苏云金芽孢杆菌库斯塔克亚种hd-1菌种(bacillus thuringiensis subsp.kurstaki hd-1)的cry1ab基因,经基因修饰后接入质粒载体pv-zmbk07中,通过基因法实现遗传转化。mon810转化事件的插入序列包含camv 35s启动子(299bp)、经修饰的抗虫基因cry1ab部分编码区域(2448bp)、玉米热激蛋白基因hsp70的内含子(804bp)。mon810表达的杀虫蛋白是苏云金芽孢杆菌(bacillus thuringiensis,bt)的杀虫晶体蛋白cry1ab,是所有抗虫蛋白中应用最广泛的一种,对欧洲玉米螟、西南玉米螟和亚洲玉米螟等鳞翅目害虫都具有良好抗性,对人类、哺乳动物和其它有益昆虫没有影响。cry1ab蛋白的杀虫机制是:该蛋白被昆虫摄入后,在碱性肠道中被活化,专一性与中肠上皮细胞受体结合,形成离子通道或孔洞,引起渗透压失衡,导致昆虫死亡。由于mon810品系在防治玉米螟方面的效果较好,自商业化至今,其种植范围越来越广,但是其食用安全和环境安全问题也越来越受到重视,因此对转基因mon810品系的分析检测至关重要。
3.目前针对mon810品系检测的国家标准是定性pcr法,出入境检测检疫行业标准是采用lamp方法进行检测。这些方法从提取基因组到后续的扩增检测所需的时间都较长,且需要一些专业的仪器设备。
4.同时,传统的提取玉米基因组的方法是ctab法,耗时大约3h。目前利用市面上的各种试剂盒提取玉米dna也大约需要1-2h,在提取玉米基因组阶段所耗费的时间也比较长。
5.重组酶聚合酶扩增技术(recombinase polymerase amplification,rpa)是在多酶体系下进行的一种恒温体外扩增技术。rpa反应一般在20min左右即可完成,且灵敏度高,特异性强,所需仪器设备简单便携,尤其是2014年rpa商业化试剂盒问世,使得rpa操作更加简便,可满足现场检测的需求。但是由于rpa反应体系组分较复杂,可能会对凝胶成像结果造成一定的影响。


技术实现要素:



6.(一)要解决的技术问题
7.为了开发一种快速、便携、灵敏且特异性强的检测转基因玉米mon810的方法,本发明提供了一种基于rpa-侧流层析技术检测转基因玉米mon810的引物组和方法。
8.(二)技术方案
9.本发明首先提供一种基于rpa-侧流层析技术检测转基因玉米mon810的引物组,其包括以下引物组中的一组或多组:
10.引物组i:
11.正向引物序列为:5
’‑
tacaacgccaagcacgagac-3’(seq id no.9);
12.反向引物序列为:5
’‑
atctgctgcaggtggtcttac-3’(seq id no.10);
13.引物组ii:
14.正向引物序列为:5
’‑
gctcaaggcttacactcgct-3’(seq id no.5);
15.反向引物序列为:5
’‑
aaaggacctgactgctcgc-3’(seq id no.6);
16.引物组iii:
17.正向引物序列为:5
’‑
agctcaaggcttacactcgc-3’(seq id no.7);
18.反向引物序列为:5
’‑
tgactgctcgcaagcaaattc-3’(seq id no.8)。
19.本发明经过大量的优化和筛查后发现,上述引物即使在所提基因组的产量和纯度有所损失的情况下,也能通过rpa反应很好地实现对目标基因的扩增,进而有利于减少实际检测时的提取工序和提取时间,提升对转基因玉米mon810的检测效率。
20.作为优选,当所述正向引物的5’端修饰有isp18,在isp18的另一端连接有序列为ttttttttttttttt(seq id no.13)的核酸分子;所述反向引物的5’端修饰有fitc时,更有利于后续侧流层析技术中的检测效果。
21.具体的,以引物组i为例,其修饰后的正向引物的序列如下:
[0022]5’‑
ttttttttttttttt/isp18/tacaacgccaagcacgagac-3’;
[0023]
修饰后的反向引物的序列如下:
[0024]5’‑
/fitc/-atctgctgcaggtggtcttac-3’。
[0025]
进一步的,本发明还提供一种基于rpa-侧流层析技术检测转基因玉米mon810的试剂盒,其包括所述的引物组。
[0026]
进一步的,本发明还提供所述的引物组或所述的试剂盒在检测转基因玉米mon810中的应用。
[0027]
进一步的,本发明提供一种基于rpa-侧流层析技术检测转基因玉米mon810的方法,其包括以下步骤:
[0028]
1)提取待测玉米的dna;
[0029]
2)以所提dna为模板,使用所述的引物组进行rpa扩增;
[0030]
3)通过侧流层析技术对rpa扩增产物进行检测。
[0031]
作为优选,在步骤1)中,利用wizard magnetic dna purification system for food试剂盒中的试剂提取待测玉米的dna,具体包括:
[0032]
以100mg待测玉米的粉末为计算基准(在实际操作时可等比例放大或缩小),将其与490-510μl lysis buffer a和4-6μlrnasea混合,大力晃动8-15s;而后加入240-260μl lysis buffer b并大力晃动8-15s,在室温放置0.8-1.2min后,加入740-760μl precipitation solution,大力晃动8-15s后,过滤除杂;
[0033]
在除杂后的液体中加入45-55μlpmp,并大力晃动4-6s,而后加入790-810μl异丙醇,将试样倒置10

15次后,用磁铁聚集磁珠,弃去上清液,在磁珠中加入240-260μl lysis buffer b,倒置2-3次,用磁铁聚集磁珠,弃去上清液,并用乙醇溶液清洗磁珠;
[0034]
在清洗后的磁珠中加入90-110μl无核酸酶水,并倒置4

6次,而后在37-42℃下孵育0.8-1.2min后,用磁铁聚集磁珠,收集上清液,即为待测玉米的dna。
[0035]
通过上述方式,只需要5min即可完成对待测玉米的dna的提取,同时所提基因组的产量和纯度不影响后续的rpa扩增,且上述过程不需要大型仪器设备,操作简便。
[0036]
进一步的,本发明对影响转基因玉米mon810检测效果的其他因素进行了探究与优化,得到如下的优选方案。
[0037]
作为优选,在步骤2)的所述rpa扩增中,反应温度为37-42℃。
[0038]
作为优选,反应时间为15-30min。
[0039]
作为本发明的一种实施方式,rpa扩增体系包括:冻干酶粉、primer free rehydration buffer、正、反向引物、模板dna、醋酸镁、h2o。扩增体系如下所示:
[0040][0041][0042]
作为优选,在步骤3)的侧流层析技术中,样品垫上的lfb缓冲液中含有:
[0043]
4x ssc、2%bsa、0.05%tween20、0.002%triton x-100、10mm tris-hac和5mm kac。
[0044]
作为优选,在步骤3)的侧流层析技术中,结合垫上的aunps-anti-fitc溶液的添加量为2.5-3.5μl;
[0045]
作为优选,在步骤3)的侧流层析技术中,样品垫上的rpa产物的添加量为4-6μl;
[0046]
作为优选,在步骤3)的侧流层析技术中,样品垫上的lfb缓冲液的添加量为150-200μl。
[0047]
通过对侧流层析技术中的lfb(侧流层析传感器)体系进行上述优化后,其结果不仅不受rpa复杂体系的干扰,而且结果直观且分析时间更短,只需要不到3min即可完成。
[0048]
作为本发明的一种实施方式,lfb体系包括:结合垫上的aunps-anti-fitc溶液、样品垫上的rpa产物和lfb缓冲液、组分为链霉亲和素-生物素-polya的检测线(t线),组分为羊抗鼠抗体的质控线(c线)、吸收垫以及pvc背板。
[0049]
本领域人员可根据常识对上述方案进行组合,并设置rpa-侧流层析技术中的其他操作及参数,以得到本发明中检测方法的较优实施例。
[0050]
进一步的,本发明提供一种实现所述方法的装置,其包括:
[0051]
(1)带有卡槽的水槽;
[0052]
(2)带有活塞的样品管;
[0053]
其中,所述卡槽用于固定所述样品管,所述水槽用于提供水浴,所述活塞可将样品管分为上下两个空间,并用于控制上下两个空间的分隔和连通。
[0054]
在一个具体的实施方式中使用上述装置时,可将rpa反应液加入到所述装置的样
品管中,然后放置在37-42℃的水槽中反应15-30min。反应结束后,加入lfb缓冲液,而后打开装置的活塞使试纸条掉落,2-4min后完成试纸条的显,读取检测结果。
[0055]
(三)有益效果
[0056]
(1)本发明所提供的引物组具有良好的特异性,即使在所提基因组的产量和纯度有所损失的情况下,也能通过rpa反应很好地实现对目标基因的扩增,进而有利于减少实际检测时的提取工序和提取时间,提升对转基因玉米mon810的检测效率。
[0057]
(2)本发明极大地缩短了检测转基因玉米mon810时所需的时间,其中基因组dna的提取时间仅需5min左右,整个检测过程仅需不到25min即可完成,非常快速,且不需要大型仪器设备,操作简便,有利于在实际检测中进行推广应用。
[0058]
(3)本发明方法的灵敏度较高,可检测mon810含量在0.1wt%以上的转基因玉米,符合国家标准的要求。
[0059]
(4)本发明提供了一种用于rpa和lfb反应的3d集成装置,实现了mon810品系的快速、简便、防污染的现场检测。
附图说明
[0060]
图1为本发明实施例的原理示意图;其中,a图为整个检测流程示意图,b图和c图分别代表rpa和lfb的工作原理。
[0061]
图2为本发明的dna快速提取方法与现有技术提取方法的比较结果;其中,a图为四种方法的操作和时间差异,b图、c图、d图和e图分别为四种基因组提取方法所提基因组dna、pcr结果、rpa结果和lfb结果之间的差异。
[0062]
图3为本发明的dna快速提取方法与现有技术提取方法的产量(a图)和纯度(b图)差异。
[0063]
图4为不同rpa体系的扩增结果差异;其中,a图、b图和c图分别为不同引物、不同反应时间、不同反应温度的扩增结果差异。
[0064]
图5为不同lfb体系的检测效果差异;其中,a图、b图、c图和d图分别为不同aunps-anti-fitc溶液的添加量、不同rpa产物的添加量、不同lfb缓冲液的添加量、不同lfb缓冲液的检测效果差异;在各图中,上方为lfb图像,下方为用image j定量结果。
[0065]
图6为本发明的灵敏度测试结果,其中,上方为lfb图像,下方为用image j定量结果。
[0066]
图7为本发明的特异性验证结果。
具体实施方式
[0067]
以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。
[0068]
实施例中未注明具体技术或条件者,按照本领域内的文献所描述的技术或条件,或者按照产品说明书进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可通过正规渠道商购买得到的常规产品。
[0069]
实施例1
[0070]
1.实验材料
[0071]
wizard magnetic dna purification system for food试剂盒购自美国promega
公司,天根植物基因组提取试剂盒购自天根生化科技有限公司,twistdx twistamp basic kit购自英国twistdx公司,ctab、异丙醇、乙酸钾、乙醇、苯酚、氯仿、10x pcr buffer、dntp(2.5mm)、rtaq酶(5u/ml)、haucl4、柠檬酸三钠、bsa、tween20、triton x-100等试剂购自sigma公司,链霉亲和素、anti-fitc、羊抗鼠抗体等购自abcam公司。吸水垫(cfsp001700、玻璃纤维样品垫(cfsp001700)、硝酸纤维素膜(135s)、结合垫(gfcp000800)、背板(hf000mc100)购自millipore公司。
[0072]
引物名称及序列如下:
[0073]
rpa-f:
[0074]5’‑
ttttttttttttttt/isp18/tacaacgccaagcacgagac-3’;
[0075]
rpa-r:
[0076]5’‑
/fitc/-atctgctgcaggtggtcttac-3’。
[0077]
2.转基因玉米mon810基因组的提取
[0078]
利用wizard magnetic dna purification system for food试剂盒中的试剂。称取100mg研磨好的转基因玉米mon810粉末(100%),加入到2ml离心管中。加入500μl lysis buffer a和5μl rnasea,用手大力晃动10s,混合均匀。加入250μl lysis buffer b,将混合液用手大力摇晃10s至完全混合,室温放置1min。加入750μlprecipitation solution,大力晃动10s。准备一个新的2ml离心管,在离心管口铺一层孔径约1mm的纱布,然后将上述溶液通过纱布转移至离心管中。剧烈混合pmp 5s,取50μl重悬的pmp加到上述溶液中,大力晃动5s。加入800μl异丙醇,将试样倒置10

15次混合,然后将离心管放置在磁铁上,磁珠会迅速聚集,弃去上清液。在磁珠中加入250μl lysis buffer b,倒置2-3次混合,放置在磁铁上快速分离,弃去上清液。用1ml 70%乙醇清洗磁珠三次。加入100μl无核酸酶水,倒置5次混匀,然后在37℃水浴(后续rpa温度)中孵育1min,放置在磁铁上迅速分离,将上清液转移至新的离心管中,即为所提dna。
[0079]
3.rpa反应
[0080]
使用twistdx twistamp basic kit进行rpa扩增,rpa反应体系包括29.5μl primer free rehydration buffer,12.2μl ddh2o,2.4μleach primers(10μm),1μl模板dna,将该混合液加入到含有0.2ml冻干酶粉的反应管中,再向反应管中加入2.5μl 280mm醋酸镁溶液,立即混匀后置于37℃中孵育15min。此处值得注意的是加入醋酸镁时rpa反应会立即进行,因此优选将醋酸镁加在管壁,以保证涡旋混匀后反应同时发生。
[0081]
4.aunps和aunps-anti-fitc的合成
[0082]
首先合成aunps,将圆底烧瓶泡在酸液中过夜,自来水、超纯水清洗干净,装入超纯水至圆底烧瓶瓶颈处,煮至沸腾。先加入190ml超纯水,再加入2ml haucl4(1wt%)溶液,煮至沸腾后加入8ml柠檬酸三钠溶液(1wt%),10-15分钟后停止加热,冷却至室温,溶液先变为黑棕,最后变为酒红,分装。
[0083]
取1ml制备好的aunps,加入1μg anti-fitc,在旋转摇床上摇晃30-60min。再加入20μl bsa(10wt%),继续摇晃5min。加入100μl nacl(10wt%)摇晃2h。最后在11000g离心20min,弃掉上清液所得沉淀即为aunps-anti-fitc。
[0084]
5.侧流层析传感器的制备
[0085]
侧流层析传感器由五部分组成:样品垫,结合垫,硝酸纤维素膜,吸收垫和pvc背
板。将玻璃纤维膜用切纸器切成17mm x 30cm规格作为样品垫、将玻璃纤维膜切成8mm x 30cm规格作为结合垫,将吸水纸切成17mm x 30cm规格作为吸收垫。然后,将样品垫和结合垫浸于垫处理液(含0.23%triton x-100,0.05m tris-hcl和0.15mnacl,ph 8.0)中30min,继而置于37℃的烘箱中干燥2h后存放于干燥环境中。将10μl链霉亲和素(1mg/ml)和10μl生物素修饰的poly a混合孵育1h,然后将其用试纸条划线仪以1μl/cm的速度喷涂在硝酸纤维素膜(25mm x 30cm)上形成检测线。然后,将羊抗鼠抗体(1mg/ml)也用试纸条划线仪喷涂在硝酸纤维素膜的相应位置上形成质控线。将检测线与质控线喷涂完毕的硝酸纤维素膜于37℃的烘箱中干燥1h,之后将其储存于4℃的冰箱中。最终,将样品垫、结合垫、硝酸纤维素膜和吸收垫均按照一定的叠加顺序组装于一个pvc背板(60mm x 30cm)上,每部分之间留出2mm的重叠宽度来保证溶液能够在层析试纸上流通顺畅。最后,用可编程切条器将组装好的侧流层析传感器切成3mm宽度的成品。
[0086]
6. 3d集成装置的设计
[0087]
rpa体系和lfb体系是在本发明设计的简易的3d集成设备中完成的。该3d集成设备包括:(1)带有卡槽的水槽,(2)带有活塞的样品管。其中卡槽用于固定样品管,水槽用于37℃水浴,活塞用于控制lfb的发生。将rpa反应液加入到该设备的pcr样品管中,然后放置在37℃的水槽中反应15min。反应结束后,加入lfb反应缓冲液,然后打开装置的活塞使试纸条掉落,3min后完成试纸条的显,读取检测结果。
[0088]
7.转基因玉米mon810的检测
[0089]
在lfb的结合垫上滴加2.5μl aunps-anti-fitc.将4μlevent-specific rpa product与150μl lfb缓冲液(4x ssc+2%bsa+0.05%tween20+0.002%triton x-100+10mm tris-hac+5mm kac)混合,将混合液滴加在lfb的样品垫上并通过毛细管力向上迁移。经过3min后可观察到t线和c线的红条带。可使用image j软件对t线的颜深浅进行定量检测。每个样品做3个平行,计算3次检测的平均值。
[0090]
上述实施例的原理如图1所示,本发明的整个检测流程分为三个部分(图1中a图),首先是基因组dna的提取,利用本发明提供的加速提取方法,只需要5min即可完成,而且不需要大型仪器设备,操作很简便。将提取得到的dna用于rpa扩增,rpa和lfb部分都是在本发明设计的简易的3d集成装置中完成的。将rpa反应液加入到该设备的pcr管中,然后放置在37℃的水槽中反应15min。反应结束后,加入lfb缓冲液,然后打开装置的活塞使试纸条掉落,3min后完成试纸条的显,读取检测结果。整个检测过程只需不到25min。
[0091]
图1中b图和c图分别代表rpa和lfb的工作原理。由于rpa的正向引物含有polyt尾巴,反向引物有fitc修饰,所以当有靶标存在时,扩增得到的rpa产物一端含有polyt尾巴,另一端标记fitc。该rpa产物在结合垫上可与aunps-anti-fitc相互作用,形成rpa产物-aunps-anti-fitc复合物。该复合物与检测线上的polya通过沃森-克里克互补配对,使得t线显示aunps的红。同时体系中的aunps-anti-fitc可与质控线上的羊抗鼠抗体结合,使得c线也显示红。c线上的红线指示该传感器正常工作。当没有靶标存在时,rpa反应不能进行,就没有产物使得t线显,只有c线显示红。
[0092]
试验例
[0093]
1.基因组dna快速提取方法的验证
[0094]
本发明同时比较了传统的ctab法、市售的天根生化有限公司植物基因组dna提取
试剂盒说明方法、市售的wizard magnetic dna purification system for food试剂盒说明方法,以及本发明提供的快速提取方法,通过简图(图2中a图)示意了这四种方法的操作和时间差异。通过琼脂糖凝胶电泳表征了这四种基因组提取方法所提基因组dna(图2中b图)、pcr结果(图2中c图)、rpa结果(图2中d图)和lfb结果(图2中e图)之间的差异,同时比较了这四种方法所得基因组的产量和纯度(图3)差异。结果表明本发明缩短了提取时间,仅需5min,牺牲了所提基因组的产量和纯度,但是不影响后续pcr、rpa扩增和lfb的结果。
[0095]
2.关于rpa反应体系
[0096]
rpa扩增体系包括:冻干酶粉、primer free rehydration buffer、正、反向引物、模板dna、醋酸镁、h2o。扩增体系如表1所示。
[0097]
表1 rpa扩增体系
[0098][0099][0100]
(1)关于rpa扩增体系的最佳引物序列,所设计的部分引物序列如表2所示,结果如图4中a图所示,可以证实本发明中引物组(包括引物组c、d、e)的效果优势,其中引物组e的效果最优,结合后续lfb反应效果,故设计最终引物序列为:
[0101]
rpa-f引物:ttttttttttttttt(seq id no.13)/isp18/tacaacgccaagcacgagac(seq id no.9);
[0102]
rpa-r引物:/fitc/-atctgctgcaggtggtcttac(seq id no.10);
[0103]
表2 rpa体系引物优化序列
[0104][0105][0106]
(2)关于rpa反应时间,分别选择5min,10min,15min,20min,30min,结果如图4中b图所示,表明最佳反应时间为15min。
[0107]
(3)关于rpa反应温度,分别选择25℃,30℃,37℃,42℃,47℃,结果如图4中c图所示,表明最佳反应温度为37℃。
[0108]
3.关于lfb体系
[0109]
lfb体系包括:结合垫上的aunps-anti-fitc溶液、样品垫上的rpa产物和lfb缓冲液、组分为链霉亲和素-生物素-polya的检测线(t线),组分为羊抗鼠抗体的质控线(c线)、吸收垫以及pvc背板。
[0110]
(1)关于结合垫上的aunps-anti-fitc溶液的添加量,分别选择1μl、1.5μl、2μl、2.5μl、3μl、3.5μl。结果如图5中a图所示,图上方为lfb图像,下方为用image j定量结果,表明aunps-anti-fitc溶液的最佳添加量为2.5μl。
[0111]
(2)关于样品垫上的rpa产物的添加量,分别选择1μl、2μl、3μl、4μl、5μl、6μl。结果如图5中b图所示,图上方为lfb图像,下方为用image j定量结果,表明rpa产物的最佳添加量为4μl。
[0112]
(3)关于样品垫上的lfb缓冲液的添加量,分别选择50μl、100μl、150μl、200μl、250μl、300μl。结果如图5中c图所示,图上方为lfb图像,下方为用image j定量结果,表明lfb缓冲液的最佳添加量为150μl。
[0113]
(4)关于样品垫上的lfb缓冲液的类型,分别选择
[0114]
a:1x pbs+2%bsa+0.05%tween20;
[0115]
b:1x pbs+2%bsa+0.05%tween20+0.002%triton x-100;
[0116]
c:1x pbs+2%bsa+0.05%tween20+0.002%triton x-100+10mm tris-hac+5mm kac;
[0117]
d:4x ssc+2%bsa+0.05%tween20;
[0118]
e:4x ssc+2%bsa+0.05%tween20+0.002%triton x-100;
[0119]
f:4x ssc+2%bsa+0.002%triton x-100+10mm tris-hac+5mm kac;
[0120]
g:4x ssc+2%bsa+0.05%tween20+0.002%triton x-100+10mm tris-hac+5mm kac。
[0121]
结果如图5中d图所示,图上方为lfb图像,下方为用image j定量结果,表明lfb缓冲液的最佳类型为:4x ssc+2%bsa+0.05%tween20+0.002%triton x-100+10mm tris-hac+5mm kac。
[0122]
4.灵敏度测试
[0123]
选择含有mon810质量分数分别为100wt%、50wt%、25wt%、10wt%、1wt%、0.1wt%的玉米样品,通过实验所得最优反应体系和反应条件进行测定,结果如图6所示,可测得mon810质量分数为0.1wt%的样品,符合国家规定标准。
[0124]
5.特异性验证
[0125]
选择8种转基因作物,分别为:转基因玉米mon810(a)、转基因玉米ga21(b)、转基因玉米bt11(c)、转基因玉米mir640(d)、转基因大豆mon87769(e)、转基因大豆mon87705(f)、转基因水稻10%tt51(g)、转基因油菜籽rf3(h)。通过实验所得最优反应体系和反应条件进行测定,结果如图7所示,只有mon810的t线和c线都显示红,其他转基因作物均只有c线显示红,表明本发明所构建的检测方法具有良好的特异性。
[0126]
虽然,上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述,但在本发明基础上,可以对之作一些修改或改进,这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此,在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。

技术特征:


1.一种基于rpa-侧流层析技术检测转基因玉米mon810的引物组,其特征在于,其包括以下引物组中的一组或多组:引物组i:正向引物序列为:5
’‑
tacaacgccaagcacgagac-3’;反向引物序列为:5
’‑
atctgctgcaggtggtcttac-3’;引物组ii:正向引物序列为:5
’‑
gctcaaggcttacactcgct-3’;反向引物序列为:5
’‑
aaaggacctgactgctcgc-3’;引物组iii:正向引物序列为:5
’‑
agctcaaggcttacactcgc-3’;反向引物序列为:5
’‑
tgactgctcgcaagcaaattc-3’。2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述正向引物的5’端修饰有isp18,在isp18的另一端连接有序列为ttttttttttttttt的核酸分子;所述反向引物的5’端修饰有fitc。3.一种基于rpa-侧流层析技术检测转基因玉米mon810的试剂盒,其特征在于,其包括权利要求1或2所述的引物组。4.权利要求1或2所述的引物组或权利要求3所述的试剂盒在检测转基因玉米mon810中的应用。5.一种基于rpa-侧流层析技术检测转基因玉米mon810的方法,其特征在于,其包括以下步骤:1)提取待测玉米的dna;2)以所提dna为模板,使用权利要求1或2所述的引物组进行rpa扩增;3)通过侧流层析技术对rpa扩增产物进行检测。6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,在步骤1)中,利用wizard magnetic dna purification system for food试剂盒中的试剂提取待测玉米的dna,具体包括:以100mg待测玉米的粉末为计算基准,将其与490-510μl lysis buffer a和4-6μlrnasea混合,大力晃动8-15s;而后加入240-260μl lysis buffer b并大力晃动8-15s,在室温放置0.8-1.2min后,加入740-760μl precipitation solution,大力晃动8-15s后,过滤除杂;在除杂后的液体中加入45-55μlpmp,并大力晃动4-6s,而后加入790-810μl异丙醇,将试样倒置10

15次后,用磁铁聚集磁珠,弃去上清液,在磁珠中加入240-260μl lysis buffer b,倒置2-3次,用磁铁聚集磁珠,弃去上清液,并用乙醇溶液清洗磁珠;在清洗后的磁珠中加入90-110μl无核酸酶水,并倒置4

6次,而后在37-42℃下孵育0.8-1.2min后,用磁铁聚集磁珠,收集上清液,即为待测玉米的dna。7.根据权利要求5或6所述的方法,其特征在于,在步骤2)的所述rpa扩增中,反应温度为37-42℃;和/或,反应时间为15-30min。8.根据权利要求5-7中任一项所述的方法,其特征在于,在步骤3)的侧流层析技术中,样品垫上的lfb缓冲液中含有:4x ssc、2%bsa、0.05%tween20、0.002%triton x-100、10mm tris-hac和5mm kac。
9.根据权利要求5-8中任一项所述的方法,其特征在于,在步骤3)的侧流层析技术中,结合垫上的aunps-anti-fitc溶液的添加量为2.5-3.5μl;和/或,样品垫上的rpa产物的添加量为4-6μl;和/或,样品垫上的lfb缓冲液的添加量为150-200μl。10.一种实现权利要求5-9中任一项所述方法的装置,其特征在于,其包括:(1)带有卡槽的水槽;(2)带有活塞的样品管;其中,所述卡槽用于固定所述样品管,所述水槽用于提供水浴,所述活塞可将样品管分为上下两个空间,并用于控制上下两个空间的分隔和连通。

技术总结


本发明涉及基因检测领域,具体涉及一种基于RPA-侧流层析技术检测转基因玉米MO810的引物组和方法。本发明所提供的引物组具有良好的特异性,即使在所提基因组的产量和纯度有所损失的情况下,也能通过RPA反应很好地实现对目标基因的扩增,进而有利于减少实际检测时的提取工序和提取时间,提升对转基因玉米MO810的检测效率。本发明极大地缩短了检测转基因玉米MO810时所需的时间,且不需要大型仪器设备,操作简便,有利于在实际检测中进行推广应用。同时,本发明方法的灵敏度较高,可检测MO810含量在0.1wt%以上的转基因玉米,符合国家标准的要求。国家标准的要求。


技术研发人员:

程楠 张倩 贺晓云 许文涛 黄昆仑 罗云波 刘清亮

受保护的技术使用者:

中国农业大学

技术研发日:

2021.06.28

技术公布日:

2023/1/13


文章投稿或转载声明

本文链接:http://www.wtabcd.cn/zhuanli/patent-1-82131-0.html

来源:专利查询检索下载-实用文体写作网版权所有,转载请保留出处。本站文章发布于 2023-01-27 12:39:52

发表评论

验证码:
用户名: 密码: 匿名发表
评论列表 (有 条评论
2人围观
参与讨论