crystal是什么意思

CrystalMaker绘制晶体结构教程

1.先打开CrystalMaker并创建晶体，过程是file——NewCrystal，在弹出的窗口中，有一些

项目需要填写。因为是自动生成晶体的，所以你先得告诉计算机绘制晶体所需要的参数。在

这里从上到下依次要填写的是空间群、晶胞参数和原子坐标。

2.所以我们先到晶体数据库Findit中进行查询。因为我用的Findit是09年试用非破解版的，

所以我先把系统时间调到09年再打开它。这里我们要绘制的晶体是尖晶石型的ZnCo2O4，

在选择好左下的筛选方式后，分别点击Zn、Co、O，然后Search。

3.在结果中我们看到没有我们要的整数比的物质，但是明显这里只是部分Co代替了Zn的

位置，因此原子坐标和空间群并没有改变，只是晶胞参数不能使用。这里空间群是fd3m。

4.回到CrystalMaker，点Brow手动添加空间群。

5.输入晶胞参数，由于空间群已经选定了，所以软件只会让你填你能填的部分。

6.继续在Findit里面找到原子坐标。在这里SOF是原子占位率，意思就是出现在该位置的

原子的比率，显然这里Co和Zn有重叠，但我们画的是完美晶体，所以我们Zn取占位率0.79，

而Co取0.9的那个。

7.用add添加项，把所有原子都输入进去，然后点ok。

8.结果是这个样子。

9.不好看就把原子半径调一下。

10.然后我们要告诉软件原子之间是怎么作用的，点Edit——Bonding，并用add添加项，改

成Co-O键和Zn-O键。

11.键长请查手册，但是这里我们只是画图，所以可以随便指定，只要满足配位关系就可以

了。这里Co应该6配位，Zn应该4配位，把Info勾上，满足了配位关系，点ok。

12.键被加上去了。

13.但是这是球棍图，我们要的结果是立方体堆积的，所以点Model——Polyhedrel。这样键

就消失了。

14.然后把Co和Zn的模型改成半透明的立方块。点apply确认。

15.之后是这个样子。

16.因为在我们显示的范围内有些原子不满足配位要求，没有被显示出来，所以我们要调一

下范围。点Transform——SetRange。选择合适的范围然后apply。

17.把多余的氧原子消掉，还有动画效果，挺好玩的。

18.把棍的模型调一下。

19.再把背景调一下。

20.晶胞虚线也调一下。

21.换不同的角度是不一样的形状。

22.保存。