南京某医院成人耐甲氧西林金黄色葡萄球菌检出情况及耐药基
因分析
张利;孙林春
【摘要】ObjectiveToinvestigatethedeterminationanddrugresistance
geneofmethicillin-resistantStaphylococcusaureus(MRSA)isolatedfrom
adultsinJiangsuProvinceHospitalonIntegrationofChineandWestern
Medicinefrom2011to2017,andtoprovideareferenceforclinicalrational
sAccordingtotheClinicalandLaboratoryStandards
Institute(CLSI)guidelines,gsusceptibility
β-lactamresistancegene
mecA,aminoglycosidemodifyingenzymegenesaac(6′)/aph(2″)andaph
(3)-Ⅲ,macrolide23srRNAmethylageneermA/C,tetracycline-like
ribosomalprotectiveproteingenetetM/K,quinoloneresistancegene
qnrA/BanddisinfectantresistancegeneqacA/Bweredeterminedby
polymerachainreaction(PCR).ResultsThedeterminationrateofMRSA
was31.95%,andtheisolatesofMRSAweremainlyisolatedfromsputum
3departmentswererespiratory
department,asno
MRSAisolatebeingresistanttovancomycin,linezolidandtigecycline.
Therewere0.49%g
resistanceratestocotrimoxazole,rifampicin,cipro?oxacin,tetracycline,
gentamicin,clindamycinanderythromycinwere11.18%,11.57%,21.47%,
63.63%,44.31%,59.41%and62.35%,erminationrate
ofmecAwas100%.Thedeterminationratesofaac(6′)/aph(2″),aph(3)-
Ⅲ,ermA/C,tetM/K,qnrA/BandqacA/Bwere36.67%,27.94%,68.43%,
57.35%,23.63%and52.45%,sionsFrom2011to2017,
susceptibilitytest'sresultscanbeudreferenceforclinicalmedication.%
目的了解江苏省中西医结合医院2011—2017年成人耐甲氧西林金黄色葡萄球菌
(MRSA)临床分离株的检出情况及其耐药基因,为临床合理用药提供参考依据.方法
采用美国临床实验室标准化协会(CLSI)推荐方法鉴定MRSA.采用纸片扩散法对
MRSA菌株进行药物敏感性试验.采用聚合酶链反应(PCR)检测β-内酰胺类耐药基
因mecA,氨基糖苷修饰酶基因aac(6′)/aph(2″)、aph(3)-Ⅲ,大环内酯类23srRNA
甲基化酶基因ermA/C,四环素类核糖体保护蛋白基因tetM/K,喹诺酮类耐药基因
qnrA/B和耐消毒剂基因qacA/B.结果MRSA的总检出率为31.95%,主要分离自
痰液和创口分泌物样本;检出率居前3位的科室依次为呼吸科、外科和重症监护病
房.未检出对万古霉素、利奈唑胺和替加环素耐药的MRSA菌株;仅有0.49%的
MRSA对奎奴普汀耐药,对复方磺胺甲噁唑、利福平、环丙沙星、四环素、庆大霉
素、克林霉素、红霉素的耐药率分别为11.18%、11.57%、21.47%、63.63%、
44.31%、59.41%、62.35%.多重耐药基因mecA阳性率为
100%,aac(6′)/aph(2″)、aph(3)-Ⅲ、ermA/C、tetM/K、qnrA/B、qacA/B基因
检出率分别为36.67%、27.94%、68.43%、57.35%、23.63%和52.45%.结论
2011—2017年江苏省中西医结合医院成人MRSA多重耐药基因检出率高.MRSA
对多种抗菌药物都不同程度耐药,临床应以药物敏感性试验结果为合理用药的最主
要依据.
【期刊名称】《检验医学》
【年(卷),期】2019(034)003
【总页数】6页(P215-220)
【关键词】耐甲氧西林金黄色葡萄球菌;多重耐药;基因
【作者】张利;孙林春
【作者单位】江苏省中西医结合医院检验科,江苏南京210009;南京医科大学附属
儿童医院儿科研究所,江苏南京210008
【正文语种】中文
【中图分类】R446.62
金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus,SA)是临床最常见的革兰阳性球菌,
可引起重症肺炎、复杂性皮肤及软组织感染、心包炎、伪膜性肠炎或败血症等[1]。
目前,SA对抗菌药物的耐药情况日益严重,特别是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌
(methicillin-resistantStaphylococcusaureus,MRSA),已成为高致死率的
主要病原菌之一[2]。有研究结果表明,MRSA不但对甲氧西林耐药,还对氨基糖
苷类、大环内酯类、四环素类、氟喹喏酮类或磺胺类抗菌药物不同程度耐药,使临
床抗感染治疗面临极大挑战[3]。本研究对分离自不同类型临床样本的1020株
MRSA耐药基因携带情况进行分析,以期为临床合理使用抗菌药物提供参考依据。
1材料和方法
1.1菌株来源
收集2011年1月—2017年12月江苏省中西医结合医院门诊及住院患者送检的
20932例各类临床样本,共分离出3192株SA非重复株,其中1020株经鉴定
为MRSA。质控菌株SA(ATCC25923)、SA(ATCC29213)购自中国科学院
微生物研究所。
1.2仪器与试剂
Bact/Alert血培养仪、YBJSZ42全自动微生物鉴定系统(法国生物梅里埃公司),
7300定量PCR仪(美国ABI公司),GelDocXR凝胶成像仪(美国Bio-Rad公
司),2%NaClM-H琼脂平板(法国生物梅里埃公司),聚合酶链反应
(polymerachainreaction,PCR)引物由华大基因公司设计并合成,Trizol
RNA提取试剂和SuperScriptVILOcDNA合成试剂盒(美国Invitrogen公司),
LightCyclerFastStartDNAMasterSYBRGreenI(瑞士Roche公司)。
1.3MRSA鉴定
根据美国临床实验室标准化协会(theClinicalandLaboratoryStandards
Institute,CLSI)M100-S20文件要求[4],将0.5麦氏单位SA均匀涂布于2%
NaClM-H琼脂平板,分别贴上头孢西丁和苯唑西林纸片,35℃培养24h后测
量抑菌圈直径。苯唑西林最小抑菌浓度(minimuminhibitoryconcentration,
MIC)≥4mg/L或头孢西丁MIC≥8mg/L判定为MRSA。
1.4体外药物敏感性试验
采用纸片扩散法对MRSA菌株进行体外药物敏感性试验。药物敏感性试验纸片
(万古霉素、利奈唑胺、替加环素、奎奴普汀、利福平、克林霉素、红霉素、苯唑
西林、青霉素、环丙沙星、庆大霉素、四环素、头孢唑林、头孢西丁、复方磺胺甲
噁唑)购自英国Oxiod公司。
1.5DNA模板制备
分离、纯化菌株,挑取2~3个新鲜菌落放入200μL无菌双蒸水中制成细菌悬液,
100℃煮沸10min后冰上冷却,10000×g离心10min,上清液即为细菌
DNA模板。
1.6多重耐药基因检测
参照文献[5-6]设计PCR引物,引物序列见表1。PCR反应体系:稀释后的DNA模
板2μL,2×powerSYBRGreenMasterMix10μL,上、下游引物各1μL,加
蒸馏水至总体积为20μL。PCR扩增条件:94℃预变性5min;94℃40s,60℃
1min,72℃60s,40个循环;72℃10min。反应产物送上海英骏生物技术有
限公司测序。
表1耐药基因PCR引物序列基因名称引物序列(5'~3')长度(bp)mecA上
游:AAAATCGATGGTAAAGGTTGGC;下游:AGTTCTGCAGTACCGGATTTGC
533aac(6′)/aph(2″)上游:CCAAGAGCAATAAGGGCATA;下
游:CACTATCATAACCACTACCG220Aph(3)-Ⅲ上
游:GCCGATGTGGATTGCGAAAA;下游:GCTTGATCCCCAGTAAGTCA292
ermA/C上游:GTTCAAGAACAATCACAGAG;下
游:GGATCAGGAAAAGGACATTTTAC533tetM/K上
游:GTGTGACGAACTTTACCGAA;下游:GCTTTCTATCTCCAAGAACAC501
qacA/B上游:GGTTGTGGAAGAACTTTCTCCTT;下
游:CCAATTCCGGAAGGTAACAC416qnrA/B上
游:ATTTCTCACGCCAGGATTTG;下游:GATCGGCAAAGGTTAGGTCA515
1.7统计学方法
采用SPSS17.0软件进行统计分析,组间比较采用χ2检验,以P<0.05为差异有
统计学意义。
2结果
2.12011—2017年MRSA检出情况
2014年MRSA检出率最高(35.40%),以后稍有降低。2012、2013年MRSA
检出率与2011年比较,差异无统计学意义(P>0.05);2014、2015、2016、
2017年MRSA检出率均显著高于2011年(P<0.05)。见表2。
表22011—2017年MRSA的检出情况注:与2011年比较,*P<0.05年份SA
(株)MRSA(株)MRSA检出率(%)2.722012431111
25.752.692.40*2.88*2016
48616433.74*2.40*
2.2MRSA临床样本类型分布
1020株MRSA主要分离自痰液、创口分泌物、血液、穿刺液、前列腺液、引流
物和胸腹腔积液样本,各类临床样本中MRSA检出率有差异,以痰液样本最高
(48.80%)。见表3。
2.3MRSA科室分布
MRSA在不同科室的检出率不同,检出率居前3位的分别为呼吸科465例
(45.58%)、外科293例(28.73%)、重症监护病房118例(11.57%),以下
依次为感染科57例(5.59%)、泌尿外科42例(4.12%)、老年科27例
(2.65%)、内分泌科21例(2.06%)、其他科室5例(0.49%)。
表3MRSA临床样本类型分布注:与总检出率比较,*P<0.05、**P<0.01样本类
型SA(株)MRSA(株)MRSA检出率(%)痰液124660848.80**创口分泌
物49618737.70*血液101215215.02**前列腺液1441711.81**穿刺液98
2727.55引流物651624.62胸腹腔积液131139.92**合计3192102031.95
2.4MRSA耐药情况
未检出对利奈唑胺、万古霉素、替加环素耐药MRSA菌株。1020株MRSA全部
对青霉素耐药。1020株MRSA中,1007株(98.73%)对苯唑西林耐药,1
019株(99.90%)对头孢西丁耐药,5株(0.49%)对奎奴普汀耐药,118株
(11.57%)对利福平耐药,114株(11.18%)对复方磺胺甲噁唑耐药,219株
(21.47%)对环丙沙星耐药,649株(63.63%)对四环素耐药,452株
(44.31%)对庆大霉素耐药,606株(59.41%)对克林霉素耐药,636株
(62.35%)对红霉素耐药;546株(53.53%)同时对2种抗菌药物耐药,337
株(33.04%)同时对3种或3种以上抗菌药物耐药。
2.5多重耐药基因检出率
1020株MRSAmecA基因阳性率为100%,见图1。分别检出aac(6′)/aph
(2″)、aph(3)-Ⅲ、ermA/C、tetM/K、qnrA/B、qacA/B基因阳性MRSA
374、285、698、585、241和535株,检出率依次为36.67%、27.94%、
68.43%、57.35%,23.63%和52.45%,见图2。
图1mecA基因电泳图
图2aac(6′)/aph(2″)、aph(3)-Ⅲ、ermA/C、tetM/K、qnrA/B、
qacA/B基因电泳图注:(a)aac(6′)/aph(2″)基因电泳图;(b)aph(3)-
Ⅲ基因电泳图;(c)ermA/C基因电泳图;(d)tetM/K基因电泳图;(e)
qnrA/B基因电泳图;(f)qacA/B基因电泳图
528株MRSA同时检出2种耐药基因,309株同时检出3种或3种以上耐药基因。
最常见的2种耐药基因组合形式为aac(6′)/aph(2″)+ermA,共检出301株,
占29.51%;最常见的3种耐药基因组合形式为aac(6′)/aph(2″)
+ermA+tetM,共检出168株,占16.47%,见表5。
表5多重耐药基因检出情况携带基因检出株数检出率(%)aac(6')/aph(2'')
+ermA30129.51aac(6')/aph(2'')+ermA+tetM16816.47aac(6')
/aph(2'')+ermA+tetK787.65ermA+tetM373.63aac(6')/aph(2'')
+ermA+tetM+tetK131.27
3讨论
MRSA的主要特征为获得了特异性耐药基因mecA而大量表达青霉素结合蛋白2a,
代替原来正常的青霉素结合蛋白2,使细菌与β-内酰胺类抗菌药物的结合力下降,
从而表现出对青霉素类、头孢类或碳青酶烯类等所有β-内酰胺类抗菌药物耐药。
MRSA还普遍表现出对氨基糖苷类、大环内酯类、喹诺酮类和四环素类抗菌药物
耐药,这给临床抗感染治疗带来极大困难[7]。目前,MRSA正在全球范围内快速
扩散流行,在亚洲、北美洲及南美洲部分地区的检出率高达50%[8]。有研究发现,
超过20%的MRSA患者在1年内会发生侵袭性感染[9]。此外,与非MRSA感染
患者相比,MRSA感染患者的住院时间更长、医疗费用更高、病死率更高。了解
医院MRSA的检出情况和耐药基因携带情况,有助于及时掌握MRSA的耐药特点,
合理选择抗菌药物。
2011—2017年江苏省中西医结合医院共检出3192株SA,其中1020株为
MRSA,MRSA检出率为31.95%,低于国外某些大型教学医院MRSA检出率>
60%的报道,也低于我国一线城市大型综合医院MRSA检出率为50%~80%的报
道[10-11]。2011—2017年,江苏省中西医结合医院MRSA检出率总体呈上升趋
势,其中2014年检出率最高,之后3年逐渐稳定,甚至略有降低,可能与医院近
几年不断加强对MRSA的防控有关。
MRSA分布广泛,但近距离接触是MRSA的主要传播途径。本研究MRSA在痰液
和创口分泌物样本中检出率最高(48.80%和37.70%),说明MRSA以侵染呼吸
道和皮肤黏膜为主,这与LEGESE等[12]认为MRSA主要在机体的鼻腔、口咽、
下呼吸道处定植相符。从科室分布看,检出率居前3位的依次为呼吸科、外科和
重症监护病房,与MRSA在样本中的检出规律基本吻合。外科MRSA主要分离自
痰液和创口分泌物样本,患者皮肤和呼吸道黏膜多严重损伤,合并全身感染及吸入
性损伤;重症监护病房患者发生MRSA感染与患者年龄、病情严重程度、住院时
间、是否气管插管及是否使用呼吸机等有关。
定量PCR是判定MRSA的金标准,本研究结果显示,分离出的MRSAmecA基
因全部为阳性。但由于实验室环境、设备、经济等条件的限制,临床工作中
MRSA检测采用最多的是纸片扩散法。有研究证实纸片扩散法能用于检测各种
MRSA表型,特别是低水平耐药、异质性耐药的MRSA[13]。MILLER等[14]发现
PBP过表达可使表型对头孢西丁敏感的SA转为对头孢西丁耐药。本研究结果显示,
MRSA对苯唑西林的耐药率为98.73%,对头孢西丁的耐药率为99.90%,与文献
报道一致[15]。MRSA除了携带mecA基因外,还常同时携带其他耐药基因。
MRSA耐氨基糖苷类药物主要是由于获得了氨基糖苷类修饰酶(钝化酶)基因,
其中aac(6′)/aph(2″)基因编码6′位乙酰转移酶/2″位磷酸转移酶双功能酶,
aph(3)-Ⅲ基因编码3'位磷酸转移酶,能修饰卡那霉素、新霉素、链霉素和庆大
霉素等氨基糖苷类药物[16];本研究中aac(6′)/aph(2″)和aph(3)-Ⅲ基
因检出率分别为36.67%和27.94%,MRSA对庆大霉素的耐药率为44.31%。
erm编码23SrRNA基因甲基化酶,使大环内酯类抗菌药物靶点甲基化,拮抗大
环内酯类药物如红霉素的作用,以ermA/C最为常见;本研究中ermA/C基因的
检出率为68.43%,MRSA对红霉素的耐药率为62.35%。四环素类耐药基因的作
用机制是表达核糖体保护蛋白,阻断四环素与细菌30S核糖体受体结合,或编码
四环素外排泵蛋白,促进四环素清除,以tetM/K作用最显著[16];本研究中
tetM/K基因检出率为57.35%,MRSA对四环素的耐药率为63.63%。喹诺酮类
抗菌药物的作用靶点是DNA促旋酶和拓扑异构酶Ⅳ,喹诺酮嵌入断裂的DNA链
中间,形成DNA-拓扑异构酶-喹诺酮复合物,阻止DNA拓扑异构变化,抑制细
菌DNA复制转录,qnrA/B基因编码的蛋白能够逆转喹诺酮对DNA旋转酶的抑
制作用,增强由于靶基因突变、外排激活及膜空蛋白缺失引起的喹诺酮耐药[17];
本研究中,qnrA/B基因检出率为23.63%,MRSA对环丙沙星的耐药率为
21.47%。本研究中,消毒剂耐药MRSA检出率较高,这与医院常规使用消毒剂有
一定关系,MRSA对消毒剂耐药机制为获得了化合物外排泵蛋白,该泵蛋白由
qac基因家族编码,促进细菌将季铵盐类、双胍类消毒剂外排,目前发现的该家族
成员有数十种,其中qacA、qacB容易被葡萄球菌属获得,qacA基因主要编码外
排泵蛋白,qacB基因则在耐重金属质粒中有表达[18]。MRSA对消毒剂耐药应引
起医院重视,在临床工作中应合理选择有效的消毒剂对环境、空气、医疗器械等进
行消毒,注意手卫生,防止耐药菌在院内扩散传播。
万古霉素和利奈唑胺是目前治疗MRSA的一线药物,其中万古霉素是MRSA治疗
的标准药物。但是随着多重耐药情况的日益严重,已经出现了一些对万古霉素中介
耐药、异质性耐药甚至耐药的MRSA[19-20]。万古霉素是治疗MRSA的最后一
道防线,一旦出现耐药,将造成无药可用的严重后果。虽然本研究未发现对万古霉
素和利奈唑胺耐药的MRSA,但医院必须重视,做好监测和防控工作,密切关注
耐药情况。本研究中,大部分耐药基因检出率和耐药表型之间一致性较好,如大环
内酯类耐药基因和耐药表型阳性率分别为68.43%和62.35%,喹诺酮类耐药基因
和耐药表型阳性率分别为23.63%和21.47%,四环素类耐药基因和耐药表型阳性
率分别为57.35%和63.63%。但氨基糖苷类耐药基因和耐药表型检出率分别为
64.61%和44.31%,存在较大差异,这可能是因为由基因到表型有着极其复杂的
调控机制,生物体的某一表型并不单纯由基因控制;另外,同一种药物大多存在不
同的耐药机制交叉作用,导致单纯检测某一耐药基因并不一定能真正反映细菌对某
种药物的耐药情况。临床上仍应重视药物敏感性试验,并以药物敏感性试验结果作
为临床合理用药的最主要参考依据。
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