5个与脂肪酸代谢相关基因在油菜不同生育期表达量
刘凯;肖刚;张振乾;官春云;陈社员;邬贤梦
【摘要】为了明晰与脂肪酸代谢相关基因在不同油酸含量油菜中的表达情况,以
出苗后7d、5~6叶期和越冬期的叶片、花瓣和授粉后20~35d的种子为材料,
对5个转录组分析得到的差异基因(Bna0691280,Bna0421530,
Bna0547440,Bna0799930和Bna0764010)在高油酸油菜近等基因系中的表
达情况进行研究。结果发现,在营养生长期(出苗后7d、5~6叶期和越冬期)
的叶片中,5个基因在高油酸油菜材料中的表达量均高于低油酸油菜中的表达量。
在花中除Bna0547440和Bna0764010外,其它3个基因在高油酸油菜中的表达
量高于低油酸油菜中的表达量。在授粉后20~35d的种子中除Bna0799930外,
其余4个基因在高油酸油菜材料中的表达量均低于低油酸油菜中的表达量。研究
结果可为高油酸油菜育种和分子机理研究提供参考。%Inordertounderstand
theexpressionoffattyacidmetabolism-relatedgenesinrapeed
materialswithdifferentoleicacidcontents,inthisstudy,theleavesof7-
dayedlings,in5-6leafstageandoverwinteringperiod,petalsandthe
edsof20-35daysafterpollinationwereudasmaterials,andthe
expressionof5differentialgenes(Bna0691280,Bna0421530,Bna0547440,
Bna0799930andBna0764010)whichobtainedbytranscriptomeanalysisof
ultsshowed
that:intheleaves,theexpressionlevelsinhigholeicrapeedmaterial
heexpressionin
flowers,exceptforBna0547440andBna0764010,theexpressionlevelsof
theother3genesinhighole-icrapeedmaterialwerehigherthantho
hointheedsof20-35daysafter
pollination,theex-pressionlevelsinthehigh-oleicrapeedwerelower
resultsofthisstudycanbeudforthebreedingstudyofmolecular
mechanismofhigholeicrapeed.
【期刊名称】《生物学杂志》
【年(卷),期】2016(033)001
【总页数】4页(P32-34,48)
【关键词】实时荧光定量PCR;脂肪酸代谢;高油酸油菜
【作者】刘凯;肖刚;张振乾;官春云;陈社员;邬贤梦
【作者单位】湖南农业大学农学院,长沙410128;湖南农业大学农学院,长沙
410128;湖南农业大学农学院,长沙410128;湖南农业大学农学院,长沙410128;
湖南农业大学农学院,长沙410128;湖南农业大学农学院,长沙410128
【正文语种】中文
【中图分类】S565.4
AbstractInordertounderstandtheexpressionoffattyacidmetabolism-
relatedgenesinrapeedmaterialswithdifferentoleicacidcontents,inthi
sstudy,theleavesof7-dayedlings,in5-
6leafstageandoverwinteringperiod,petalsandtheedsof20-
35daysafterpollinationwereudasmaterials,andtheexpressionof5di
fferentialgenes(Bna0691280,Bna0421530,Bna0547440,
Bna0799930andBna0764010)whichobtainedbytranscriptomeanalysisof
higholeicrapeednear-
ultsshowedthat:intheleaves,theexpr
essionlevelsinhigholeicrapeedmaterialwerehigherthanthointhel
heexpressioninflowers,exceptforBna0547440
andBna0764010,theexpressionlevelsoftheother3genesinhigholeicr
hos
eintheedsof20-
35daysafterpollination,theexpressionlevelsinthehigh-
oleicrapeedwerelowerthantheexpressioninthelow-
ultsofthisstudycanbeudfo
rthebreedingstudyofmolecularmechanismofhigholeicrapeed.
KeywordsReal-
timequantitativePCR;fattyacidmetabolism;higholeicacidrapeed
高油酸油菜是近年来兴起的一种油菜新品种,其菜籽油中的油酸含量高于75%,
有较好的营养保健功能[1]。为了更好地了解其油酸合成的分子机理,国内外进行
了大量的研究[2-9],但多集中在fad2[5-9]。为了进一步挖掘与油酸合成相关的
基因,在本研究中以高油酸油菜近等基因系材料授粉后20~35d种子的转录组分
析得到的5个与脂肪酸代谢相关基因为对象,分别取高油酸油菜近等基因系材料
幼苗期、5~6叶期、越冬期、花期和种子成熟期等不同时期的材料,采用定量
PCR方法对这些差异基因在不同生育期表达量进行了研究,以期从中找出不同材
料间的差异,为高油酸油菜育种和油酸合成分子机理研究提供参考。
1.1材料
1.1.1试验材料
高油酸油菜近等基因系材料由国家油料改良中心湖南分中心提供。本试验研究的5
个与脂肪酸代谢相关的基因来自高油酸油菜近等基因系材料授粉后20~35d种子
的转录组分析。转录组分析以低油酸油菜为对照组,高油酸油菜为处理组,对差异
在1.5倍以上基因进行GO分类分析,采用FDR≤0.001和log2Ratio≥2作为标
注筛选差异基因,共得到6414个差异基因,1296个基因上调表达,5118个基
因下调表达。通过路径富集分析和KEGG注释显示共有2043个差异基因被富集
表达,分为119个分类,其中与脂肪酸代谢相关的有5个基因(结果未发表)。
1.1.2仪器设备
Nanodrop2000微量紫外分光光度计(Thermo),CFX96CFX384荧光定量
PCR(Thermo),Eppendorf超低温离心机等。
1.2方法
1.2.1样品制备
在出苗后7d幼苗去根,5~6叶期(2014年12月4日)和越冬期(2015年1月3
日)嫩叶,盛花期(2015年3月15日)自交套袋的花,在授粉后20~35d(2015年
4月10日)未成熟种子,以上材料各取10株以上,混合保存于-80℃备用。
1.2.2RNA提取
采用TransZolUpPlusRNAKit(TransGeneBiotech)提取总RNA,具体方法参
照说明书。经Nanodrop2000微量紫外分光光度计检测浓度、纯度,琼脂糖凝
胶电泳检测RNA无明显降解,保存于-80℃备用。
1.2.3定量PCR研究
采用TransScriptAll-in-OneFirst-StrandcDNA(TransGeneBiotech)进行逆转
录反应,具体方法参照说明书。采用Primer5.0设计引物,由上海生工技术公司
合成。UBC21(ubiquitin-conjugatingenzyme21)作为内参基因,引物序列
为:5′-CCTCTGCAGCCTCCTCAAGT(F);5′-
CATATCTCCCCTGTCTTGAAATGC(R),使用CFX96TMReal-
TimeSystem(BIO-RAD,USA)参考文献[3]进行。基因表达情况采用比较周期阈
值法进行评价[10]。数据分析采用ANOVA和PostHoctest,P<0.05为显著差
异。试验进行3次,取平均值。需要进行研究的基因及其引物情况如表1所示。
2.1出苗后7d不同材料间基因表达情况
5个基因在出苗后7d材料中表达量结果如图1所示。由图1可知,5个基因在高
油酸油菜材料中的表达量均显著高于低油酸油菜中的表达量,其中Bna0799930
和Bna0547440在不同材料中表达量差异较大。γ-谷氨酰转肽酶是催化γ-谷氨肽
和氨基酸生成γ谷氨酸和肽反应的酶。Janczur等[11]研究了甘蓝型油菜品系
DHO-120的重金属累积和螯合系统对铅胁迫,发现该酶为对铅胁迫有潜在修复
能力的螯合肽的限速酶,在根和茎中表达量同时伴随着酶活性的增加。
2.25~6叶期叶片中与光合相关基因表达情况
5个基因在5~6叶期不同材料叶片中的表达量结果如图2所示。由图2可知,5
个基因在高油酸油菜中的表达量高于低油酸油菜中的表达量,但与幼苗期相比表达
量差异明显减少,Bna0799930在不同材料中表达量差异较大。
2.3越冬期叶片中与光合相关基因表达情况
5个基因在越冬期不同材料叶片中的表达量结果如图3所示。由图3可知,5个基
因在高油酸油菜中的表达量高于低油酸油菜中的表达量,但与幼苗期相比表达量差
异明显减少,Bna0691280在不同材料中表达量差异较大,与前面两个时期相比
差异增幅较大,而Bna0799930和Bna0764010差异较小。
2.45~6花中与光合相关基因表达情况
5个与脂肪酸代谢相关基因在不同材料花中的表达量结果如图4所示。由图4可
知,5个基因的表达情况与前面3个时期明显不同,Bna0547440和
Bna0764010在高油酸油菜中的表达量低于低油酸油菜中的表达量,其余3个基
因在高油酸油菜材料中的表达量高于低油酸油菜中的表达量。
2.5授粉后20~35d种子中与光合相关基因表达情况
5个基因在授粉后20~35d不同材料种子中的表达量结果如图5所示。由图5可
知,除Bna0799930外,其余4个基因在高油酸油菜材料中的表达量均低于低油
酸油菜中的表达量,5个基因在不同材料中表达量差异较小。
3.1结论
由上述结果可得到如下结论:在营养生长期(出苗后7d、5~6叶期和越冬期)的叶
片中,5个基因在高油酸油菜材料中的表达量均高于低油酸油菜中的表达量。在花
中Bna0547440和Bna0764010在高油酸油菜中的表达量低于低油酸油菜中。在
授粉后20~35d的种子中除Bna0799930外,其余4个基因在高油酸油菜材料
中的表达量均低于低油酸油菜中的表达量。
3.2讨论
在营养生长期,5个与脂肪酸代谢相关的基因在高油酸油菜中的表达量高于低油酸
油菜中,在后续研究中可进行进一步研究,以确定其是否具有同样的表达情况,如
结果与本研究一致,则可利用实时荧光定量PCR的方法对该基因进行测定,在油
菜生育前期进行高油酸油菜育种材料的筛选,加快育种进程。
在授粉后20~35d种子中除Bna0799930外,其余4个基因在高油酸油菜材料
中的表达量均低于低油酸油菜中的表达量。此时期为油菜产量形成关键时期,可能
是这4个基因对油酸合成起负向调控作用,可通过基因沉默等方式进行进一步验
证;Bna0799930可通过过量表达进行其功能验证,从而找出影响油酸合成的基
因。
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