亲核试剂:在反应过程中供给电子进攻反应物中带部分正电荷原子的
试剂称为亲核试剂。
常见的亲电试剂与亲核试剂如下:
酯与胺反应生成酰胺
双分子亲核取代反应
SN2反应(双分子亲核取代反应)是亲核取代反应的一类,其中S代
表取代(Substitution),N代表亲核(Nucleophilic),2代表反应
的决速步涉及两种分子。与SN1反应相对应,SN2反应中,亲核试剂带
着一对孤对电子进攻具亲电性的缺电子中心原子,形成过渡态的同
时,离去基团离去。反应中不生成碳正离子,速率控制步骤是上述的
协同步骤,反应速率与两种物质的浓度成正比,因此称为双分子亲核
取代反应。
反应机理
SN2反应最常发生在脂肪族sp3杂化的碳原子上,碳原子与一个电负性
强、稳定的离去基团(X)相连。亲核试剂(Nu)从离去基团的正后
方进攻碳原子,Nu-C-X角度为180°,以使其孤对电子与C-X键的σ
*反键轨道可以达到最大重叠。然后形成一个五配位的反应过渡态,
碳约为sp2杂化,用两个垂直于平面的p轨道分别与离去基团和亲核
试剂成键。C-X的断裂与新的C-Nu键的形成是同时的,X很快离去,
形成含C-Nu键的新化合物。
由于亲核试剂是从离去基团的背面进攻,故如果受进攻的原子具有手
性,则反应后手性原子的立体化学发生构型翻转,也称“瓦尔登翻转”。
这也是SN2反应在立体化学上的重要特征。反应过程类似于大风将雨
伞由里向外翻转。
例如溴乙烷与氢氧根离子发生SN2生成乙醇和溴离子。
上例中,OH−(亲核试剂)进攻C2H5Br(底物)发生SN2反应,经过不
稳定的过渡态,最终Br−离去,得到乙醇。
SN2反应一般发生在伯碳原子上,很难成为有位阻分子的反应机理,
并且取代基越多,按SN2机理反应的可能性越小。基团在空间上比较
拥挤的分子一般采用SN1机理,可以缓解一部分的位阻,也可生成较
稳定的碳正离子(通常为三级碳正离子)。
影响因素
离去基团的碱性:离去基团的碱性越强,其离去能力越弱,反之
亦然。氨是碱性物质,但当氨分子中的氢原子被酰基取代后则碱性减
弱,它不能使石蕊变色,一般认为是中性化合物。这是由于酰胺中氮
原子上未共用电子对与碳氧双键形成p,π-共轭,从而使氮原子上
电子云密度降低,因此减弱了它接近质子的能力,故碱性大大降低。
与此同时,氮氢键的极性又有所增强,从而又表现了微弱的酸性。所
以,是一个很好的离去基团,有利于反应的进行。
亲核试剂的亲核性:亲核性需要与上面的碱性相区别。碱性是试
剂对质子的亲和能力,而亲核性是试剂形成过渡态时,对碳原子的亲
和能力。一般来讲,试剂的负电性、碱性和可极化性越强,其亲核性
也越强。实际上通常需要综合考虑这几个因素以及溶剂的影响。而亲
核性:I-
溶剂:SN2反应在质子溶剂中进行时,一方面,溶剂化作用有利于
离去基团的离去;另一方面,溶剂也会与亲核试剂发生作用,使亲核
试剂与底物的接触变得困难。最后的影响是这两种因素的综合结果。
相对而言,极性非质子性分子很少包围负离子,因此对SN2反应是有
利的。而DMF,DMSO都是极性疏质子性溶剂,也有利于实验的进行。
空间效应:立体阻碍性(含体积大的取代基)会使亲核试剂的亲
核性下降。空间效应基本上与链长短无关,主要与碳原子上的取代基
多少有关,如果取代基越多,那各取代基的空间位置基本固定,键就
无法自由旋转,所以我们说空间效应比较大。而与链长无关。
NHSesterreactionschemeforchemicalconjugationtoaprimaryamine.(R)reprentsalabeling
reagentoroneendofacrosslinkerhavingtheNHSesterreactivegroup;(P)reprentsaprotein
orothermoleculethatcontainsthetargetfunctionalgroup(i.e.,primaryamine).
综上反应条件
1、CalculaterequiredamountofNHSester:
NHS_ester_weight[mg]=8×amino_compound_weight[mg]×
NHS_ester_molar_weight[Da]/amino_compound_molar_weight[Da].
2、DissolveNHSesterin1/10reactionvolumeofDMForDMSO.
Amine-freeDMFispreferredsolvent.
3、Dissolvebiomoleculein9/10reactionvolumeofbufferwithpH
ctionofNHSesterswithaminesisstronglypH-dependent:at
lowpH,theaminogroupisprotonated,
higher-than-optimalpH,hydrolysisofNHSesterisquick,andmodification
lpHvalueformodificationis8.3-8.5.
配制100mlpH8.34的磷酸缓冲液(PBS)配制方法可以这样配制:
1/15mol/LNa2HPO4溶液的配制:准确称取Na2HPO4•12H2O2.3876g,用水溶解,定容至100
mL;
1/15mol/LKH2PO4溶液的配制:准确称取KH2PO40.4540g,用水溶解,定容至100mL;
再取上述1/15mol/LNa2HPO4溶液97.5ml+l/15mol/LKH2PO4溶液2.5ml即得
lternatives
are0.1MTrisbuffer(althoughTrishasaminogroup,itishinderedand
doesnotreactwithNHSesters),is
risisprimaryamineisnotcompatible,
becauitcompetesforreaction;however,insomeprocedures,itis
ufultoaddTrisorglycinebufferattheendofaconjugationprocedure
toquench(stop)thereaction.
4、AddNHSestersolutiontothesolutionofbiomolecule,andvortexwell.
Keeponiceovernight,oratroomtemperatureduringatleast4hours.
5、Purifytheconjugateusingappropriatemethod:gel-filtrationfor
itationandchromatographyis
cimpurities(suchasN-hydroxysuccinimide,
NHSester,acidproducedbyhydrolysis)arealmostalwayasily
teinsandnucleicacids,ethanoloracetoneprecipitation
canbeud.
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