肺腺癌患者突触小体相关蛋白家族的表达研究
黄兴;陆世民;王欣;陈辰;王洁;许林;任斌辉
【摘要】[Abstract]ObjectiveNumerousstudieshadshownthatsynaptic-
associatedproteins(SNAPs)wereclolyrelatedtotheoccurrenceand
ofthisstudywastoinvestigatethe
expressionofsynaptosomal-associatedprotein47(SNAP47)andits
correlationwiththeclinicopathologicalfeaturesinnon-smallcelllung
cancer(NSCLC).MethodsTheexpres-sionsofSNAPfamily(SNAP23,
SNAP25,SNAP29andSNAP47)wereextractedandanalyzedthroughthe
geneexpressionmicroarrayandthecancergenomeatlas(TCGA)data-
47mRNAexpressionin52casoflungadenocarcinomaand
theircorrespond-ingnormaltissuesweredetectedbyquantitativereal-
timePCR(qRT-PCR).ResultsAmong52casoflungadenocarcinoma,
SNAP47mRNAexpressionlevelsof41cas(78.9%)weresignificantly
higherthantheadjacentlungtissue(P<0.05).ThemRNAlevelofSNAP47
wasassociatedwithlymphnodeinvasionandadvancedclinicalpatho-
AlevelsofSNAP47ofpatientsinII/IIIstagewere
significantlyhigherthanthoofIstagepatients(6.558±4.730vs2.718
±2.370,P<0.05).ThemRNAlevelsofN1+N2werehigherthanthoofN0
(6.609±4.942vs3.360±2.987,P<0.05).ConclusionThehighspecificityof
SNAP47expressioninlungcancertissuesmightbeassociatedwiththe
invasionandlymph nodemetastasisofNSCLC,whichisthe
potentialtherapeutictargetoflungcancer.%目的:大量研究表明,突触小体
相关蛋白(synaptosomal-associatedprotein,SNAP)与多种肿瘤的发生发展
密切相关。文中旨在筛选并验证在肺腺癌中特异性表达的突触小体相关蛋白47
(synaptosomal-associatedprotein47,SNAP47)并分析其与临床指标间的
关系。方法应用表达谱基因芯片和肿瘤基因组图谱(thecancergenomeatlas,
TCGA)公共数据库筛选出特异性高表达于肺癌中的SNAP47,并选取江苏省肿瘤
医院有完整临床资料的52例肺腺癌患者,对其癌组织及对应的癌旁肺组织应用实
时定量逆转录聚合酶链反应检测SNAP47mRNA的表达情况,并分析其与临床指
标间的关系。结果52例肺腺癌组织中,41例(78.9%)SNAP47mRNA表达
水平明显高于对应的癌旁肺组织,差异有统计学意义(P<0.05),且Ⅱ、Ⅲ期
患者SNAP47mRNA的表达水平(6.558±4.730)显著高于I期患者
(2.718±2.370),N1+N2组患者SNAP47mRNA的表达水平
(6.609±4.942)也明显高于N0组患者(3.360±2.987),差异均有统计
学意义(P<0.05)。结论SNAP47mRNA特异性高表达可能参与了肺腺癌的
浸润及淋巴结转移,是潜在的肺癌诊疗靶点。
【期刊名称】《医学研究生学报》
【年(卷),期】2015(000)006
【总页数】4页(P600-603)
【关键词】SNAP47;SNARE蛋白;肺腺癌;侵袭转移;实时PCR
【作者】黄兴;陆世民;王欣;陈辰;王洁;许林;任斌辉
【作者单位】210009南京,南京医科大学附属江苏省肿瘤医院胸外科;210009南
京,南京医科大学附属江苏省肿瘤医院胸外科;210009南京,南京医科大学附属
江苏省肿瘤医院胸外科;210011南京,南京医科大学第二临床医学院;210009南
京,江苏省恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室;210009南京,南京医科
大学附属江苏省肿瘤医院胸外科;210009南京,南京医科大学附属江苏省肿瘤医
院胸外科
【正文语种】中文
【中图分类】R734.2
0引言
肺癌发病率及病死率位居恶性肿瘤之首[1]。肺癌的侵袭转移是其恶性的标志和
特征,也是肺癌患者治疗失败和死亡的主要原因,约90%患者最终死于肺癌转移
[2]。当前针对肺腺癌驱动基因表皮生长因子受体(epidermalgrowthfactor
receptor,EGFR)的酪氨酸激酶抑制剂(tyrosinekinainhibitor,TKI)治疗显示
了较好的临床疗效[3-5],但肺癌总体5年生存率依然在20%~30%[6]。因
此筛选肺癌侵袭转移特异的新型分子靶标并探索其功能,是当前肺腺癌研究领域关
注的热点问题。包括肿瘤细胞在内,真核细胞内的膜性细胞器之间的物质运输(如
蛋白质、脂类),主要通过囊泡完成;细胞通过囊泡运输系统完成生命活动,包括新
陈代谢、命运决定、增殖分化、运动迁移及损伤修复等[7]。有研究报道,N-乙
基马来酰胺-敏感因子受体(solubleNSFattachmentproteinreceptors,
SNARE)蛋白作为囊泡运输系统的核心,在基质金属蛋白酶的转运过程中起到了非
常重要的作用,从而促进了肿瘤的侵袭与转移[8-9]。而可溶性N-乙基马来酰
胺-敏感因子附着蛋白(synaptosomeassociatedprotein,SNAP)作为SNARE
蛋白的一种,主要参与了这一过程。SNAP蛋白家族作为SNARE复合物的一大类,
目前已知主要有SNAP23、SNAP25、SNAP29及SNAP474种蛋白,其中
SNAP23及SNAP47是全身表达的[10-11]。但目前尚无囊泡运输系统SNARE
复合物关于非小细胞肺癌的研究。因此我们认为针对非小细胞肺癌,挖掘肺癌相关
的SNAP,将有助于揭示肺癌侵袭转移的新机制,为临床诊疗提供新思路。
我们前期进行了大通量的基因芯片筛选,发现SNAP23是正常肺组织中主要表达
的SNAP蛋白,而SNAP47基因在肺癌组织中相对于癌旁组织的表达明显升高。
通过TCGA在线数据库(/)下载相应肺腺癌组织及
癌旁组织SNAP47RNAq数据,数据表明非小细胞肺癌标本中SNAP47
mRNA表达明显高于对应癌旁组织(P<0.01)。因此,本研究应用TCGA数据库
进一步筛选验证SNAP在肺癌中的表达,并检测临床肺癌患者癌组织和癌旁组织
中相应SNAP47mRNA的表达,探讨其与临床病理特征的关系,为进一步研究
SNAP家族基因与肺癌的发生、发展关系奠定基础。
1资料与方法
1.1研究对象收集江苏省肿瘤医院2014年5月至2014年9月共52例肺腺癌患
者资料,其中男29例,女23例;年龄≥60岁者29人。取患者距肿瘤边缘5cm
处的正常组织做对照,所有癌组织标本均经病理检查明确诊断。新鲜标本取出后立
即置于液氮罐内冻存,然后转入-80℃保存。病理分期采用肺癌研究国际联盟
(IASLC)2009年公布的TNM分期,患者术前均未接受过放疗或化疗。患者的性别、
年龄、有无胸膜侵犯、分化程度、淋巴结是否转移、临床分型分期等临床资料完整。
1.2主要试剂和仪器总RNA抽提试剂TrizolReagent为美国Invitrogen公司产
品;Real-time逆转录试剂盒(R0036A)为Takara公司产品;SYBR®SelectMaster
Mix试剂盒和实时定量PCR检测仪购自美国AppliedBiosystems公司。
1.3引物根据Genebank公布的人SNAP23、SNAP25、SNAP29及SNAP47
基因序列,应用引物设计软件primer5.0设计引物,并经GenebankBlast检索
确定引物的特异性。内源性对照基因选择甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-
3-phosphatedehydrogea,GAPDH)。引物序列:SNAP47上游引
物:GCTGTCGCTCAGGTTCAT,下游引物:CTCCCTCCAGAAATGCTC;SNAP23上
游引物:CTGGGTTTAGCCATTGAGTCTCAGG,下游引
物:GGTGTCAGCCTTGTCTGTGATTCG;SNAP25上游引
物:ATGGATGAAAACCTAGAGCAGG,下游引物:ACACTTAAC
CACTTCCCAGC;SNAP29上游引物:ATGTCTGGCTATCCTAAA,下游引
物:CTGGCTTGGTACTTGTT;GAPDH上游引物:GAAGGTGAAGGTCGGAGT,下
游引物:GAAGATGGTGATGGGATTTC。所有引物均由上海Invitrogen公司合成。
1.4方法
1.4.1总RNA提取及浓度测定使用TRIzolReagent一步法提取肺腺癌细胞株及
肺癌组织标本总RNA,操作步骤严格按照说明书。随后经紫外分光光度计确定所
得到的RNAA260/A280比值在1.8~2.0之间,说明RNA无蛋白污染,符合后
续RT-qPCR实验要求。最后,通过A260的值计算RNA的浓度。总RNA提取
后加入100μL焦碳酸二乙酯(DEPC)水稀释,储存于-80℃备用。
1.4.2cDNA合成反应体系20μL。取1.5μgRNA,加入4μL
5×PrimeScriptTMRTMasterMix,然后加无RNA酶水至20μL。反应条
件:37℃15min,85℃5s,4℃15min行逆转录。合成好的cDNA置于-80℃
保存备用。
1.4.3实时定量逆转录-聚合酶链(realtimequantitativerevertranscription-
polymerachainreaction)反应反应体系10μL。2×SYBR®GreenReal-time
PCRMasterMix5μL,上游引物(5μmoL/L)0.4μL,下游引物(5μmoL/L)0.4
μL,cDNA2μL,加DEPC水至10μL。将反应管置于7300Real-timePCR反
应仪(AppliedBiosystem中),反应条件为95℃预变性10min后,按下述条件
扩增40个循环:95℃10s,60℃1min。每个实验重复3次。采用2-ΔΔCT法计
算基因的相对表达量[12],公式如下:
ΔΔCt=ΔCt-Avg.ΔCt=(CtSNAP47-CtGAPDH)-Avg.
(CtSNAP47-CtGAPDH)
1.5统计学分析采用SPSS17.0软件进行统计分析。定量资料用均数±标准差()表
示。肿瘤及瘤旁组织SNAP47表达均数比较采用配对t检验,两独立样本均数的
比较视方差齐性检验(以0.1作为检验水准进行Levene检验)结果,当方差齐同时,
用两独立样本t检验,当方差不齐时,用Satterthwaite校正t检验。以P≤0.05
为差异有统计学意义。
2结果
2.1SNAP47mRNA在肺腺癌及癌旁组织中的表达SNAP47mRNA在正常肺组
织和肺癌组织中都有表达,且52例中有41例(78.9%)的SNAP47mRNA表达水
平高于正常组织,其中33例(63.5%)比正常组织高2倍以上,20例(38.5%)比正
常组织高4倍以上,差异均具有统计学意义(P<0.05)。
2.2肺癌组织中SNAP47mRNA表达与临床病理特征的相关性分析在低分化与中
高分化的患者中,SNAP47mRNA表达的差异不具有统计学意义(P=0.476)。
SNAP47mRNA的表达量与患者性别和年龄及胸膜侵犯情况之间的差异无统计学
意义(P>0.05)。但在不同临床分期中不同,肺癌Ⅱ、Ⅲ期患者SNAP47mRNA
的表达水平显著高于I期患者,N1+N2组患者SNAP47mRNA的表达水平也明
显高于N0组患者(P<0.05)。见表1。
表1SNAP47mRNA表达与临床资料相关性分析Table1Correlationbetween
SNAP47mRNAlevelandclinicopathologiccharacteristics特征n表达比例P
值性别男294.588±4.4150.611女235.203±4.201年龄(岁)≥6029
4.886±3.3780.969<60234.839±4.978胸膜侵犯有285.368±4.1120.365无
244.267±4.505淋巴结转移N0283.360±2.9870.005N1+N224
6.609±4.942分化程度低134.084±4.5070.476中高395.118±4.245TNM分
期Ⅰ232.718±2.3700.001Ⅱ、Ⅲ296.558±4.730
3讨论
寻找并研究肺癌侵袭转移相关的基因,对改善肺癌患者预后意义重大[13-14]。
基质金属蛋白酶(matrixmetalloproteina,MMP)降解细胞外基质是肿瘤的侵
袭和转移的关键环节。SNARE复合物(VAMP3,Stx13及SNAP23)参与基质金属
蛋白酶的转运分泌进而降解细胞外基质实现纤维肉瘤细胞(HT-1080)的侵袭转移
[9]。而Williams等[15]在侵袭性乳腺癌细胞株中证实SNARE复合物
(VAMP7,Stx4及SNAP23)介导侵袭伪足形成和膜相关MT1-MMP的转运从而
影响肿瘤细胞侵袭。
SNAP家族作为SNARE家族的一员,在MMP转运过程中起到了关键的作用,从
而参与了肿瘤的侵袭、转移。本组通过前期的芯片发现SNAP47基因在肺腺癌中
的表达明显增高。因此,本研究探讨SNAP家族在肺癌组织中的表达及其临床意
义。研究结果显示:TCGA数据库中,SNAP47在包括肺腺癌在内的非小细胞肺癌
中的表达明显高于对应瘤旁组织,SNAP23为低表达,SNAP25及SNAP29的表
达无明显差异。随后,针对52对新鲜标本组织,应用qRT-PCR方法检测了
SNAP47mRNA的表达,结果发现:癌组织标本中SNAP47mRNA的表达明显高
于癌旁组织,且SNAP47mRNA的表达与肿瘤的临床分期和淋巴结转移等情况有
密切的联系。SNAP47mRNA的表达在不同TNM分期有显著的差异,随着肺腺
癌临床分期的增高,SNAP47的表达也相应增高,在Ⅱ、Ⅲ期患者的表达水平明
显高于I期,根据此结果可以推测SNAP47参与了肺腺癌的发生及发展过程。
N1+N2组患者SNAP47的表达水平明显高于N0组,表明SNAP47的表达水平
与淋巴结转移情况有密切的联系,这从另一方面提示SNAP47参与了肺腺癌的发
生发展。由于肿瘤较小,无法进行T分期的分层分析,因此SNAP47是否与肺癌
的T分期相关仍需进一步的研究。
综上所述,SNAP47的高表达可能与肺癌的发生发展有关,参与了肺腺癌的浸润
转移及淋巴转移,有望作为肺癌的预后和转移指标或治疗靶点。基于前期SNAP
家族蛋白在MMP转运中的研究,我们推测SNAP47也可能通过增加MMP的转
运实现肺癌的侵袭转移。进一步的体内体外实验有助于明确SNAP47对于肺癌侵
袭转移的作用并揭示其可能的机制。
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