反式作用因子

lncRNA顺反式调控模式

关于分⼦⽣物学的顺反式

顺式作⽤：cis-acting，同⼀染⾊体上的DNA序列直接调控其他邻近基因的表达。即DNA对DNA，强调的是距离近，并强调的是距离近，并

且是DNA对DNA的调控

常见的顺式调控元件是增强⼦，启动⼦，沉默⼦

反式作⽤：trans-acting，DNA通过其产物（mRNA或蛋⽩质）间接调节基因的表达。⽤以描述基因元件的专有名词，

如阻遏物基因与转录因⼦基因，它们可以影响位于不同染⾊体上的其他基因。这些反式作⽤基因通过产⽣能远距离作⽤的

可扩散物质发挥功能

lncRNA的顺反式调控

⽂献《FunctionalClassificationandExperimentalDisctionofLongNoncodingRNAs》中对lncRNA的顺反式调控进⾏了讨论

对于顺式调控⽬前有三种类型：

通过招募调节因⼦调节临近的mRNA基因的表达，（这⾥强调的是距离），⽐⽅说lncRNA结合到了临近mRNA基因的染⾊体⼤沟中，

使得该mRNA基因在转录时polll由于空间阻塞⽆法结合，导致转录受抑制（本质上是由于lncRNA改变了临近mRNA基因的空间结构，从⽽影响

mRNA的表达）

2.距离相近的lncRNA基因和mRNA基因若同时转录，由于转录所需的TF和polll等在空间中产⽣竞争，导致mRNA的转录效率下降。（这⾥同样

强调距离，但是真正影响mRNA表达的是转录的空间阻塞，⽽不是lncRNA转录物）

编码基因区含有mRNA的顺式调控元件，那么当lncRNA开启转录时，下游的mRNA就⽆法进⾏转录的增强，开启或，（这⾥强调的是

顺式作⽤元件，如果含有的是增强⼦序列，那可能距离因素不是⼀个区分的重要因素）

因此，定义lncRNA顺式调控的因素，⼀个是lncRNA基因与调控的mRNA基因的距离，第⼆个是看lncRNA编码区是否含有某些mRNA基因的顺

式作⽤元件

对于反式作⽤因⼦也有三种形式：

调控mRNA基因表达，但是调控的mRNA基因要远离lncRNA编码的位点（考虑到距离因素），可能也是改变远端mRNA基因的空间结

构，从⽽影响该mRNA的表达。因此从这个⾓度区分顺反式调控实际上是在考虑距离因素因此从这个⾓度区分顺反式调控实际上是在考虑距离因素

影响核的结构，从⽽影响mRNA基因的表达（其中⼀个例⼦是lncRNA影响核斑，从⽽影响基因表达，核斑是⼀类蛋⽩质，属于反式作

⽤因⼦）

通过影响反式作⽤因⼦或者其他具有调控功能的RNA分⼦来影响基因表达

总结

区分lncRNA的顺反式调控的依据主要有两个，⼀个是距离，另⼀个是是否与顺式作⽤元件（顺式调控）或者反式作⽤因⼦（反式调控）发⽣作⽤