方案24制备和转化感受态大肠杆菌的Inoue方法:
制备超级感受态细胞
采用Inoue的方法(1990)制备大肠杆菌感受态细胞很好时甚至能达到Hanahan方法(1980)
的转化效率。但在标准的实验室条件下,达到1×108~3×108个转化克隆/μg质粒DNA的转
化效率更为常见。与Hanahan方法相比,这一方法的优点在于并不过分地讲究细节,但是重
复性更好,而且更有预见性。
这一方法与其他方法有所不同的是细菌在18℃进行培养而不是通常的37t。否则这个方
法也就没有什么特别之处,而不过是一个司空见惯的标准程序。没有人知道为何在低温进行细
菌培养会影响转化效率。也许是18℃时合成的菌膜成分和物理性状更有利于攫取DNA,也许
是低温使有利于高效转化的生长时相延长了。
在18℃进行细菌培养并非易事,大多数实验室缺乏在夏天和冬天能够准确保持18℃的摇
床。将摇床置于4℃冷室,用温控器加温至18℃是一个解决问题的方法。也可使培养物的温度
维持在20~23℃,这样做并不会造成转化效率降低。这一温度在很多实验室其实是室温。在这
一温度范围,细菌生长得很慢,倍增时间大约为2.5~4h。如此缓慢的生长可能会导致培养失
败,尤其是在晚间较迟的时候,这时细菌的OD
600
吸收值似乎永远不能达到理想的0.6。解决
这个问题的方法是晚上就进行培养,第二天一早收获细菌。分子克隆中常用的很多大肠杆菌品
系都适用于这种方法,如XL-Blue、DH1,JM103、JM108/109、DH5α和HB101。
材料
注意:标记(!)试剂的正确操作,请参见附录12。
缓冲液和溶液
贮存液、缓冲液和试剂成分请见附录1。使用时将贮存液稀释至适当浓度。
二甲亚砜DMSO(!)
二甲亚砜的氧化产物据推测为二甲硫醚,是转化的抑制物(Hanahan1985)。为避免上述问
题,应购买高质量的DMSO。
Inoue转化缓冲液(见步骤1)。
用前置于冰上预冷至0℃。
核酸和寡核苷酸
质粒DNA(重组质粒)
构建方法采用本章方案17和22所提供的方法。
培养基
LB或SOB培养基(培养最初的细菌生长物)
SOB琼脂板,含20mmol/LMgSO
4
和适当的抗生素。
标准的SOB琼脂板含10mmol/LMgSO
4
。
SOB培养基(培养转化的细菌)
培养前,准备3个内盛250ml18~20℃SOB的lL锥形瓶。
SOC培养液
每个转化反应约需lml。
离心机和转头
SorvallGSA转头或与之相当的转头
专用设备
液氮(!)
聚丙烯管(17×170mm;Falcon2059),冰上预冷
18℃摇床
温度可调42℃的水浴装置
方法
重要:本方案的所有程序都必须进行无菌操作。
制备感受态细胞
1.准备Inoue转化缓冲液(用前冰上预冷)。
来自配制转化缓冲液的水的有机污染,会降低感受态细胞的转化率。因此,采用直接从质
量很好的Milli-Q过滤系统(Millipre)取得的水将会得到满意的结果。假如出现问题,使用前用
活性炭处理去离子水。
a.0.5mol/L的PIPES(pH6.7)[哌嗪-N,N`-双(2-乙磺酸)]溶液的配制:将15.1gPIPES溶
于80ml水中(Milli-Q级,或与之相当级别的),用5mol/LKOH调pH值至6.7,最后加纯水,
定容至100ml。用预先处理的Nalgene滤膜(0.45μm孔径)过滤、除菌。分成小份于-20℃保存。
转化缓冲液的配制:将下列组分溶于800ml纯水中,然后加20ml0.5mol/L的
PIPES(pH6.7),加纯水定容至1L。
试剂需要量/L终浓度
MnCl
2
·4H
2
O10.88g55mmol/L
CaCl
2
·2H
2
O2.20g15mmol/L
KCl18.65g250mmol/L
PIPES(0.5mol/L,pH6.7)20ml10mmol/L
H20补至lL
c.用预先处理的Nalgene滤膜(0.45μm孔径)过滤除菌。分成小份于-20℃保存。
2.挑取一个经37℃培养16~20h平皿上的单菌落(2~3mm直径),接种至250ml锥形瓶中的
25mlLB培养液或SOB培养液中,37℃摇床(250~300r/min)培养6~8h。
3.晚上约6点钟,将上述初始培养物接种于三个盛有250mlSOB培养液的1L锥形瓶中,第
一个加10ml,第二个加4ml,第三个加2ml,于18~22℃中速摇床过夜。
4.次日早上,测量三瓶培养物的OD
600
值,每45min测定一次。
5.当有一瓶的培养物OD
600
=0.55时,将培养瓶置于冰上10min,弃去另两瓶培养物。
由于大多数实验室的昼夜温差较大,而且温差也随一年四季及工作人员数的变化而变化。
因此,很难预测合适OD值的时期,尤其是晚上。同时培养三瓶不同浓度梯度的菌液,可以
提高成功的机会,培养过夜的菌液至少有一瓶是符合要求的。
6.于4℃以2500g(相当于SorallGSA转头,3900r/min)离心10min收集菌体。
7.倒去培养物,将离心管倒扣在吸水纸上2min以吸干剩余液体,用一个真空吸引器将贴附
在管壁上的培养基吸干。
8.加80ml预冷的Inoue转化缓冲液重悬细菌沉淀。轻轻旋转,不要用振荡器或吹吸混匀。
9.于4℃2500g(相当于SorallGSA转头3900r/min)离心10min收集菌体。
10.倒去上层培养液,将离心管倒扣在吸水纸上2min以吸干剩余被体,用一个真空吸
引器将附在管壁上的培养基吸干。
冻存感受态细胞
11.用20ml预冷的Inoue转化缓冲液轻轻重悬沉淀。
12.加1.5mlDMSO。轻轻混匀细菌悬液,放置冰上10min。
13.迅速将悬液分装到冷却的无菌微量离心管中,封紧管口,没入液氮中快速冰冻感受态细胞。
贮存于-70℃备用。
用液氮速冻可以提高转化效率约5倍。
就大多数克隆方面的用途来说,50μL感受态细胞悬液已绰绰有余了。然而,如需要更大
量的转化菌落(如构建cDNA文库),每小份感受态细胞的量可能需要加大些。
14.需要时,从-70℃冰箱中取出一管感受态细胞,把管握于手心,融化细胞。细胞一经融化,
立即把管转移至冰浴中,在冰上放置10min。
15.用一冷的无菌吸头把感受态细胞转移到冷却的无菌聚丙烯管(17×170mm)中,放置在冰浴
上。不用玻瑞管是因为它们会降低转化效率约10倍。
转化
包括阳性和阴性对照(请见方案23中的专栏"细菌转化")
16.将要转化的DNA片段加入到装有感受态细胞的管中(50μl感受态细胞需25ngDNA),体
积不应超过感受态细胞的5%,轻轻旋转几次混匀内容物。实验中至少设对照管:一个含有感
受态细胞和已知量的超螺旋质粒DNA,另一管只有感受态细胞。海匀内容物,冰浴30min。
17.将管放入预加温至42℃的循环水陆中,恰恰放置90s,不要摇动。
热激是一个关键步骤,准确地达到热激温度非常重要。这里的温度及温育的时间都是使用
Fa1con2059管的测量参数,其他类型的管将可能获得不同的结果。
18.快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却1-2min。
19.每管加800μlSOC培养基,用水浴将培养基加温至37℃,然后将管转移到设置为37℃的
摇床上,温育45min,使细菌复苏并表达质粒编码的抗生素抗性标记基因。为最大限度地提高
转化率,复苏期中应温和地摇动细胞(<225r/min)。如果带有α互补,请接方案27。
20.将适当体积(每个90mm平板达200μ1)已转化的感受态细胞转移到含20mmol/LMgSO
4
和
相应抗生素的SOB培养基上。
如果用四环素作为选择标记,全部的转化混合物可以铺在一个单独的平皿上(或软琼脂中),
可以先在微量离心机上室温离心20s以收集转化菌,轻拍管壁的同时加入100μlSOC重悬沉
淀。
重要:玻璃铺菌器先需在乙醇中浸泡,然后在酒精灯上灼烧,待它凉至室温后,才可将转
化菌轻轻地铺在琼脂板表面。
如检查氨韦青霉素的抗性,用转化菌铺平板时密度应较低(每个90mm平极不超过104菌
落),于37℃培养的时间不超过20h。氨莘青霉素抗性的转化体可将ß-内酰胺酶分泌到培养基
中.迅速灭活菌落周围区域的青霉素。这样,铺平板时密度过高或培养时间过长都会导致出现
对氨苄青霉素敏感的卫星菌落。在选择培养基中不用氨苄青霉素而用羧苄青霉素,以及将抗生
素浓度从60μg/ml提高到100μg/ml,可使情况有所改善,但不能彻底根除之。抗氨苄青霉素
菌落的增加与平皿上所加的细菌数的增加并无线性比例关系,这可能是因为被抗生素杀死的细
胞释放生长抑制物质的缘故。
21.将平板置于室温直至被体被吸收。
22.倒置平皿,于37℃培养,12-16h后可出现菌落。
转化克隆可以用本章方案27、28、31、32或第8章方案12中所介绍的方法进行重组质粒
的筛选。
方案25用氯化钙制备和转化感受态大肠杆菌
下面的方法是对Cohen等于1972年发表的方法更为便捷的修改。这一方法可以用于批量
制备感受态细胞,其转化效率可达到5×106-2×107个转化克隆/μg超螺旋质粒DNA。这个转
化效率对于方便地进行质粒中克隆已经足够高了。用此方法制备的感受二细胞可以在-70℃冻
存。但随着冻存期的延长,转化效率会有所降低。
材料
缓冲液和溶液
贮存液、缓冲液和试剂成分请见附录1。使用时将贮存液稀释至适当浓度。
CaCl
2
·H
2
O(1mol/L)
制备感受态细胞时取出10mL贮存液加90ml纯水稀释至100mL,用预先处理的Nalgene
滤膜(0.45μm孔径)过滤除菌,放置冰上。
或
标准的转化缓冲液(TFB)(见方案23步骤1)。对许多大肠杆菌的菌株,用标准TFB代替
CaCl
2
可获得一致或更好的结果。
MgCl
2
-CaCl
2
溶液,冰上预冷
培养基
LB或SOB培养液(培养最初的细菌生长物)
SOB琼脂板,含20mmol/LMgSO
4
和适当的抗生素。
标准的SOB琼脂板含10mmol/LMgSO
4
。
SOC培养液
每个转化反应约需1ml。
核酸和寡核苷酸
质粒DNA(重组质粒)
构建方法采用本章方案17和22所提供的方法。
离心机和转头
SorvallGSA转头或与之相当的转头
专用设备
聚丙烯管(50mm),冰上预冷
聚丙烯管(17×100mm;Fa1con2059),冰上预冷
可调至42℃的水浴装置
方法
重要:本方案的所有操作都必须在无菌条件下进行。
制备感受态细胞
1.从37℃培养16~20h的平板中挑取一个单菌落(直径2~3mm),转到一个含有100mlLB
或SOB培养基的1L烧瓶中。于37℃剧烈振摇培养3h。一般经验,1OD
600
约含有大肠杆菌
DHI109个/ml。
为达到高效转化,活细胞数务必少于108个细胞/时,对于大多数大肠杆菌来说,这相当于
OD
600
值为0.4左右。为保证细菌培养物的生长密度不致过高,可每隔15-20min测定OD
600
酬值来监测,用监测的时间及OD
600
值列一个图表,以便预测培养物的OD
600
值达到0.4的时
间,当OD
600
值达到0.35时,收获细菌培养物。
在菌株与菌株之间,OD
600
值与每毫升中活细胞数间的关系变化很大,因此有必要通过测
量特定大肠杆菌的生长培养物在生长周期的不同时相的OD
600
值,并将各稀释浓度的培养物铺
于无抗生素的LB琼脂板以计算每一时相的活细胞数,从而使分光光度计读数得到标准化。
2.将细菌转移到→个无菌、一次性使用的、用冰预冷的50ml聚丙烯管中,在冰上放置
10min,使培养物冷却至0℃。
3.于4℃用SorvallGS3转头(或与之相当的转头)以4100r/min离心10min,以回收细胞。
4.倒出培养液,将管倒置1min以使最后的痕量培养液流尽。
5.每50ml初始培养液用30ml预冷的0.1mol/LCaCl
2
-MgCl
2
溶液(80mmol/LMgCl
2
,
20mmol/LCaCl
2
)重悬每份细胞沉淀。
6.于4℃用SorvallGS3转头(或与之相当的转头)以4100r/min离心10min,以回收细胞。
7.倒出培养液,将管倒置1min以使最后的痕量培养液流尽。
8.每50ml初始培养物用2ml用冰预冷的0.1mol/LCaCl
2
(或TFB)重悬每份细胞沉淀。
9.此时,可以按步骤10~16用新鲜制备的感受态细胞直接做转化实验,也可以将细胞冻
存于-70℃(见方案23步骤12)。
对大多数大肠杆菌(MC106除外),在这一步采用TFB代替CaCl
2
可得到相同或更好的结
果。
Dagert和Ehrlich的实验(1979)曾表明,细胞可以于4℃在CaCl
2
溶液中保存24-48h,在
贮存的最初12-24h内,转化率增加4-6倍,然后降低到初始水平。
转化
包括阳性和阴性对照(见方案23中的专栏"细菌转化")。
10.用冷却的无菌吸头从每份用CaCl
2
溶液制备的感受态细胞悬液中吸取200μl转移到无
菌离心管(17×100mm)中,每管加入DNA(用不超过10μL的体积,其中的DNA小于50ng),
轻轻旋转以混匀内容物,在冰中放置30min。
11.将管放入预加温至42℃的循环水浴中,恰恰放置90s,不要摇动管。热激是一个关键步
骤,准确地达到热激温度非常重要。
12.快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却1-2min。
13.每管加800μLSOC培养基,用水洛将培养基加温至37℃,然后将管转移到摇床上,
温育45min,使细菌复苏并表达质粒编码的抗生素抗性标记基因。复苏期中应于37℃温和地
摇动细胞(用低于50r/min转速的摇床)。
如果用α互补筛选,请接方案27铺板。
14.将适当体积(每个90mm平板达200μ1)已转化的感受态细胞转移到含20
mmo1/LMgSO
4
和相应抗生素的SOB琼脂培养基上。
如果用四环素作为选择标记,全部的转化混合物可以铺在一个单独的平皿上(或软琼脂中).
可以先在微量离心机上室温离心20s以收集转化菌,加100ΜlSOC重悬沉淀,轻轻混匀。
重要:玻璃铺菌器需先在乙醇中浸泡,然后在酒精灯上灼烧,待它凉至室温后,才可将转化
菌轻轻地铺在琼脂板表面。
如检查氨苄青霉素的抗性,用转化菌铺平板时密度应较低(每个90mm平板不超过104茵落).
于37℃培养的时间不超过20h。氨苄青霉素抗性的转化体可将ß-内酰胺酶分泌到培养基中,
迅速灭活菌落周围区域的青霉素。这样,铺平板时密度过高或培养时间过长都会导致出现对氨
苄青霉素敏感的卫星菌落。在选择培养基中不用氨苄青霉素而用羧苄青霉素,以及将抗生素浓
度从60μg/mL提高到100μg/mL,可使情况有所改善,但不能彻底根除之。抗氨苄青霉素菌落
的增加与平皿上所加的细菌数的增加并无线性比例关系,这可能是因为被抗生素杀死的细胞释
放生长抑制物质的缘故。
15.将平板置于室温直至液体被吸收。
16.倒置平皿,于37℃培养,12-16h后可出现菌落。
转化克隆可以用本章方案27、28、31、32或第8章方案12中所介绍的方法进行重组
质粒的筛选。
本文发布于:2022-11-13 23:26:26,感谢您对本站的认可!
本文链接:http://www.wtabcd.cn/fanwen/fan/88/14027.html
版权声明:本站内容均来自互联网,仅供演示用,请勿用于商业和其他非法用途。如果侵犯了您的权益请与我们联系,我们将在24小时内删除。
留言与评论(共有 0 条评论) |