CCGC文件4
生物标本采集技术规范及
数据库建立指南
(讨论稿)
2006年12月制定
2009年12月修订
国家863“肿瘤分子分型与个体化诊治”项目组
“肿瘤基因组”研究重大项目组
中国医药生物技术协会组织生物样本库分会
目录
简介........................................................................................................................1
背景......................................................................................................................3
指南概述................................................................................................................4
一、技术标准和标准化操作指南.................................................................4
二、伦理、法律和法规.................................................................................6
生物样本采集和保存操作指南实施细则............................................................9
一、采集的生物样本种类.............................................................................9
二、生物样本的贮存和加工.......................................................................10
三.临床资料的收集和数据管理..............................................................11
四.生物样本采集SOPs(StandardOperationProcedure)手册...........12
附件1:关于使用组织样本开展科学研究的知情同意书.............................14
附件2:伦理委员会审核意见书.......................................................................17
附件3:为何要使用生物样本进行科学研究的问答.......................................18
附件4:生物样本交接协议书...........................................................................20
附件5:肿瘤样本采集的基本技术标准...........................................................23
样本采集登记表..................................................................................24
附件6:项目合作协议.......................................................................................25
附件7:临床研究队列入组标准.......................................................................26
附件8:国际肿瘤基因组协作研究(ICGC)肿瘤组织样本质量标准.........27
简介
目前在世界范围内开始进行肿瘤分子分型和个体化诊治的研究。这项研究能否获得实质
性进展取决于一个最基本的问题,即研究用生物样本的质量和数量,包括符合临床诊治规范
的临床研究队列,高质量、严格按照SOPs收集的组织样本和详细的临床、病理、与随
访等资料。
实际上做到这一点在操作上有相当的难度。以科技最发达的美国为例,为了保证高质量
标本采集和完整数据库的建立,过去的多年中美国国立癌症研究(CI)每年都投入约5000
多万美金的专项基金用于生物资源标本库的建立;Relax—it'snotyourmoneythey'reafter.近
期,FolksattheationalCancerInstitute(CI)areheadingupanefforttoestablishtheUS'sfirst
nationalbiobank—asafehousefortissuesamples,tumorcells,DAand,yes,evenblood—that
wouldbeusedforresearchintonewtreatmentsfordiseases.美国CI正在为建立美国第一个国
家“生物银行”而奔走努力。“生物银行”是一个存放组织样本,肿瘤细胞、DA甚至血
液的生物样本库----主要用于研究疾病的新方法。目前,美国国立癌症研究所(CI),
生物资源和生物样本(OBBR)办公室正在努力从事这项工作。预计近期Byfall,thegroup
hopestohavemappedoutaplanforanationalbiobank;therecentstimulusshoweredonthe
governmentbytheObamaAdministrationmightevenacceleratethattimetabl可制订出筹建国家
“生物银行”的实施计划,奥巴马政府也在积极促成这一计划的实现。
其中还不包括大量研究课题本身具有采集生物样本的任务。其他发达国家均以类似的方
式进行这项工作中。这项工作最大的问题是如何按照相对统一的标准进行样本采集和开展研
究工作。因为,这样一项研究决不可能由一个单位或几个实验室完成,以近来发表在ATURE
的几种疾病基因变异相关性研究,所用的病例数达到14,000,共同对照3000,参与的医疗
机构超过百余个。我国的一项发表在ATUREGEETICS的基因多态性与肿瘤相关性研究,
采用的病例和对照分别达到近5000例。这一结果表明,研究队列和生物样本是决定我国在
这一领域中自主创新能力和国际竞争力的关键问题。
已有事实表明,现代肿瘤研究是以规范化诊治的多中心临床队列建立为基础;以获得高
质量肿瘤样本和系统临床随访资料为核心。这二项已成为国际生物医药领域竞争的决定性因
素,也是转化医学研究的基础。
因此集成我国肿瘤资源、人才和技术的优势,发挥我国在肿瘤研究领域的作用,提升创
新能力和参与国际竞争具有重要意义。
目前,我国在这一领域已具备一定的条件。许多大型医疗科研机构已开展了一些关于生
物样本采集和临床数据库建立的工作。但是,这些生物样本采集工作基本上是科研人员自发
的、零散的、缺乏系统的设计和规范。主要目的是为眼前的课题研究,无固定经费支持,缺
少具有法律保障的伦理监督、缺乏长远打算,管理使用无序,低水平重复和浪费现象严重。
为了促进我国人口与健康领域战略目标的实现、建立和推动我国“组学及系统生物学”
整合医学和转化医学的发展,特别是提升我国在这一领域的整体创新能力和国际竞争力。建
立国家层面上的生物样本库,将包括肿瘤在内的重大疾病和高危人研究队列建立、生物资
源采集、储存和使用与具体研究工作进行有机整合。其中研究队列建立、规范化生物样本采
集和使用。保障有足够数量的生物样本可用于科学研究和技术开发。
成项目将在竞争力。结合“十二五”结合“十二五”的主要支持方向,在国家高技术发
展863计划资助的<肿瘤分子分型与个体化诊疗>和<肿瘤基因组项目>是以规范化肿瘤多中
心临床研究队列建立和生物样本规范化采集为基础的.肿瘤生物样本采集包括手术冰冻标
本、石蜡标本以及血液标本。对入组的临床样本和数据进行科学实验鉴定和系统分析。在此
基础上建立并完善肿瘤分子标志谱临床研究专用的样本采集和应用体系,包括技术规范、资
源库和实验分析数据库。为此参照美国CI(2006年)与国际肿瘤肿瘤基因组研究协作组
(ICGC,2008年)制定的生物样本采集技术规范,结合我国的现状和多年的实践经验提出
本项目拟实施的技术规范供研究项目实施时参考。
背景
近年来通过对肿瘤临床和基础研究资料的系统分析和总结表明,提高早诊率及合理
水平是延长肿瘤患者生存期和改善生活质量的关键。
以往的研究通过筛选和鉴定出一些肿瘤相关的分子标志物,发展了用于临床样本的检测
方法,并具有较好的特异性和敏感性,能将分期及组织病理学类型相同的病例按临床生物学
行为及预后划分成为不同的亚。但是这些研究结果往往缺乏系统的、大样本,前瞻性临床
验证,其临床生物学意义和价值有待进一步确定。
有鉴于此,实现这一目标的关键是能否将基础性的工作做好,做到位。为此,首先需要
有一个相对统一的标准。美国CI和TCGA对所资助的生物标本采集项目提出了统一的标
准,他们根据多年来工作中总结的经验和遇到的问题,通过多方面的沟通和讨论制定了一个
规范化、可操作的生物样本采集和质量评价标准。
高质量生物样本库建设也是现代医院建设和管理的重要组成部分之一;同时也是与国际
同行交流和合作的物质基础。为了使研究工作能够取得实质性进展和持续发展,我们十分有
必要在一开始的基础性工作中既突出课题研究所用生物样本的采集和评价标准。为此,参照
美国CI(2006年)和ICGC(2008年)制定的生物样本采集技术规范,结合我国目前的
实际状况和课题研究的要求制定肿瘤生物样本采集技术规范,以保证课题研究所用样本的统
一,临床资料的可整合性及各种科研活动的透明度。
指南概述
一、技术标准和标准化操作指南
1.标本的收集、加工、储存、检索和推广使用
1)根据不同的标本类型和使用目的,采用最适的条件对生物样本进行筛选,收集和加
工,并配有系统的资料和可靠的数据。
2)参照标准操作流程(SOPs)建立技术档案以供研究使用。
3)设立一个清楚明确的解释标准以保护生物样本提供者的隐私。通常使用以代码代替
身份的隐藏方式或者完全匿名的方式予以保护。
4)用数据化的管理系统进行分类管理。设计统一,专一和唯一确定的号码格式标记样
本,并附有所需的资料信息。管理系统必须具有安全保密措施并设定相对应的访问权限。
5)建立统一的综合质量管理系统,记录必须严格按照质量控制进行标准化,尽量避免
可能出现的人为误差,所有数据应录入统一规范的数据库,实现计算机化管理并随时备份,
并能及时发现不符合规范的录入记录。
6)必须保证工作人员的科学素质和工作质量,人员上岗前必须经过标准操作规程
(SOPs)培训和考核。上岗后的继续培训需要由质量分析(QA)人员进行定期和不定期的
监督,并决定如何实施。
7)必须在病理医生指导下进行组织标本的采集,并配有系统和精确的临床资料,包括
患者的过程和随访资料。
8)要有标准化的存储环境,根据不同的组织标本类型、储存的时间及对生物活性物质
保存的要求选择不同的温度(4、-20、-80、-130、-196C)。这些存储设备的温控需要有自
动的检测以及足够的安全保障。
9)建立生物样本处理的原则并严格执行,应考虑样本储存数量与空间的关系,以保障
足够空间备用,重要研究项目必备的样本采集要预留空间。
10)尽可能在最短的时间内完成将样本的采集(应该保证30分钟完成,不适当的处理
时间将直接影响和干扰研究的结果),应尽快降低所采集组织样本的温度。对于其他类型的
生物样本应根据具体的实验研究目的和要求执行。
11)建立详细的电子文档资料样本目录,以便取出样本时查询。尽量保障样本存储器工
作状态和温度的稳定。
12)建立标准的操作规程对用于样本长期保存的设备的性能进行适时监控和定期维护。
13)根据实验研究的目的选择储存生物样本的容器,在考虑坚固的同时,尽量避免使用
含有微量金属的容器。
14)转运生物样本时,要特别注重包装和运输过程的安全性,建立生物样本转运的登记